104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0233 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0233  hypothetical protein  100 
 
 		 219 aa  431  1e-120  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.363081  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0262  hypothetical protein  71.69 
 
 		 219 aa  309  2e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.404279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0277  hypothetical protein  74.43 
 
 		 219 aa  304  7e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.521102  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2903  hypothetical protein  62.1 
 
 		 219 aa  275  5e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.159439  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3445  hypothetical protein  60.73 
 
 		 219 aa  262  4e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00496877  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0084  protein of unknown function DUF480  59.82 
 
 		 215 aa  259  2e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3975100000000002e-18 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0102  protein of unknown function DUF480  59.36 
 
 		 215 aa  258  3e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000409835  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0194  protein of unknown function DUF480  48 
 
 		 226 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0176  protein of unknown function DUF480  47.11 
 
 		 226 aa  191  5e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000112356 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3645  hypothetical protein  50.95 
 
 		 214 aa  189  2.9999999999999997e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.784319  normal  0.81819 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3715  hypothetical protein  48.62 
 
 		 230 aa  187  9e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1905  hypothetical protein  45.41 
 
 		 215 aa  182  3e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0011352  hitchhiker  0.00151074 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0605  hypothetical protein  43.38 
 
 		 221 aa  181  8.000000000000001e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.209579  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0676  multidrug resistance protein A  46.79 
 
 		 216 aa  179  2.9999999999999997e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.545698  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000539  hypothetical protein  45.05 
 
 		 216 aa  178  4e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.755702  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3509  protein of unknown function DUF480  47.49 
 
 		 225 aa  178  4.999999999999999e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2055  hypothetical protein  46.95 
 
 		 219 aa  177  1e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0305732  normal  0.0543921 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1617  hypothetical protein  48.33 
 
 		 215 aa  176  2e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.397537  normal  0.0239474 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05349  hypothetical protein  45.09 
 
 		 217 aa  176  2e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2178  hypothetical protein  47.25 
 
 		 215 aa  176  2e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1581  hypothetical protein  47.91 
 
 		 216 aa  176  3e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2066  hypothetical protein  45.45 
 
 		 222 aa  173  1.9999999999999998e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124636 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2274  hypothetical protein  46.58 
 
 		 214 aa  171  6.999999999999999e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1804  hypothetical protein  45.07 
 
 		 211 aa  171  1e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.817852  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1236  hypothetical protein  47.66 
 
 		 215 aa  169  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.159536 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2020  hypothetical protein  47.66 
 
 		 215 aa  169  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2204  hypothetical protein  47.66 
 
 		 215 aa  169  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0185732 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2794  hypothetical protein  47.78 
 
 		 214 aa  168  5e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.127586 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1967  hypothetical protein  46.19 
 
 		 210 aa  168  6e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.465185  normal  0.175017 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1644  hypothetical protein  44.5 
 
 		 221 aa  168  7e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.808623  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1161  hypothetical protein  42.86 
 
 		 230 aa  167  8e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1265  hypothetical protein  47.2 
 
 		 215 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.143853 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1280  hypothetical protein  47.2 
 
 		 215 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.48257 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1190  hypothetical protein  46.73 
 
 		 215 aa  166  2e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1190  hypothetical protein  46.73 
 
 		 215 aa  166  2e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2533  hypothetical protein  46.73 
 
 		 215 aa  166  2e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.477556  normal  0.117101 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4077  protein of unknown function DUF480  44.55 
 
 		 228 aa  166  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2062  hypothetical protein  46.73 
 
 		 215 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.174673 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2259  hypothetical protein  47.6 
 
 		 215 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2081  hypothetical protein  45.37 
 
 		 212 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.781105  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01063  hypothetical protein  46.26 
 
 		 215 aa  165  4e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2579  protein of unknown function DUF480  46.26 
 
 		 215 aa  165  4e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1446  hypothetical protein  46.73 
 
 		 215 aa  165  4e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.585817  hitchhiker  0.00180396 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01071  hypothetical protein  46.26 
 
 		 215 aa  165  4e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2048  hypothetical protein  51.48 
 
 		 233 aa  165  5e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2520  protein of unknown function DUF480  44.39 
 
 		 223 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.60784  normal  0.805512 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1867  hypothetical protein  42.73 
 
 		 222 aa  164  6.9999999999999995e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0399  hypothetical protein  46.26 
 
 		 297 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1958  hypothetical protein  46.26 
 
 		 255 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.473189  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1866  hypothetical protein  47.6 
 
 		 234 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.409237  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1765  hypothetical protein  44.39 
 
 		 223 aa  164  8e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.76394  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1802  hypothetical protein  44.39 
 
 		 223 aa  164  8e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.694493 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1554  hypothetical protein  42.73 
 
 		 222 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1622  hypothetical protein  44.04 
 
 		 218 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.138254 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1629  hypothetical protein  42.92 
 
 		 222 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.039164 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2482  hypothetical protein  45.37 
 
 		 216 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0256196  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1758  hypothetical protein  43.95 
 
 		 223 aa  161  6e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1696  hypothetical protein  40.47 
 
 		 217 aa  161  8.000000000000001e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2426  hypothetical protein  41.1 
 
 		 223 aa  161  9e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.374899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2516  hypothetical protein  47.64 
 
 		 205 aa  160  1e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.338314 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3392  hypothetical protein  47.55 
 
 		 225 aa  159  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.473482 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3231  hypothetical protein  49.38 
 
 		 235 aa  159  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.373258 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2611  hypothetical protein  43.66 
 
 		 221 aa  158  5e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0461289 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2730  protein of unknown function DUF480  47.06 
 
 		 225 aa  157  1e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.395206  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0106  hypothetical protein  38.74 
 
 		 221 aa  156  3e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5328  protein of unknown function DUF480  50.62 
 
 		 287 aa  155  3e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5265  protein of unknown function DUF480  45.5 
 
 		 234 aa  155  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.534627  normal  0.764141 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1449  hypothetical protein  43.26 
 
 		 233 aa  154  1e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2078  protein of unknown function DUF480  41.95 
 
 		 215 aa  154  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.424148  normal  0.164766 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2469  hypothetical protein  43.22 
 
 		 213 aa  153  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.964701  normal  0.69032 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0990  hypothetical protein  45.67 
 
 		 234 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3844  hypothetical protein  41.83 
 
 		 236 aa  152  5e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.368568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0081  hypothetical protein  48.78 
 
 		 235 aa  150  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5439  hypothetical protein  44.71 
 
 		 236 aa  149  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.118943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5360  hypothetical protein  46.7 
 
 		 234 aa  150  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.434043  normal  0.525827 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5373  hypothetical protein  42.03 
 
 		 240 aa  149  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.712311 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3509  hypothetical protein  40.28 
 
 		 218 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.688553 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4618  hypothetical protein  48.17 
 
 		 236 aa  146  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.685823  hitchhiker  0.00167817 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1356  hypothetical protein  46.03 
 
 		 236 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0108358 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4889  hypothetical protein  43.75 
 
 		 236 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.022245 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0052  protein of unknown function DUF480  43.48 
 
 		 216 aa  145  4.0000000000000006e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.102804  normal  0.491736 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4455  hypothetical protein  43.4 
 
 		 234 aa  145  5e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2419  hypothetical protein  44.83 
 
 		 224 aa  144  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.768585 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5610  hypothetical protein  42.06 
 
 		 297 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.260426 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1648  hypothetical protein  42.31 
 
 		 228 aa  142  3e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0405293  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3697  hypothetical protein  47.56 
 
 		 243 aa  143  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0217939 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3438  hypothetical protein  47.24 
 
 		 232 aa  142  3e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.333291 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2442  hypothetical protein  41.51 
 
 		 215 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2686  hypothetical protein  44.5 
 
 		 221 aa  142  4e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2282  hypothetical protein  40.45 
 
 		 243 aa  142  4e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.102117  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3223  hypothetical protein  40.93 
 
 		 220 aa  141  9.999999999999999e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2627  hypothetical protein  43.27 
 
 		 216 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2102  hypothetical protein  42.86 
 
 		 240 aa  140  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.59809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3531  hypothetical protein  39.62 
 
 		 215 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0125316  normal  0.0563858 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3252  hypothetical protein  41.06 
 
 		 214 aa  138  7e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2782  hypothetical protein  49.38 
 
 		 400 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3184  hypothetical protein  39.42 
 
 		 215 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04790  hypothetical protein  42.86 
 
 		 223 aa  131  6e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.02558  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3711  hypothetical protein  41.71 
 
 		 216 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61306 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19450  hypothetical protein  43.03 
 
 		 221 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>