More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0220 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU0220  cytochrome c oxidase, subunit III  100 
 
 
200 aa  394  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0044  cytochrome c oxidase subunit III  67.5 
 
 
199 aa  271  6e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.388042  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0250  cytochrome c oxidase, subunit III  74 
 
 
200 aa  256  2e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.256401  normal  0.022866 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0043  cytochrome c oxidase subunit III  69 
 
 
199 aa  240  1e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000712999 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1824  cytochrome c oxidase, subunit III  59.69 
 
 
199 aa  226  1e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.240701  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1540  cytochrome c oxidase subunit III  61.31 
 
 
199 aa  226  2e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0535  cytochrome c oxidase subunit III  62.05 
 
 
198 aa  224  1e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177568 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1346  cytochrome c oxidase, subunit III  54.82 
 
 
209 aa  197  6e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0703851  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2527  caa3-type cytochrome c oxidase, subunit III  58.29 
 
 
201 aa  190  1e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00772107  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2704  cytochrome c oxidase subunit III  50 
 
 
224 aa  175  3e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.343343  normal  0.321582 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0231  cytochrome c oxidase subunit III  45.45 
 
 
226 aa  157  7e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38618  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2273  cytochrome c oxidase, subunit III  43.41 
 
 
235 aa  143  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.545672  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1586  cytochrome c oxidase subunit III  40.72 
 
 
234 aa  142  3e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1602  cytochrome c oxidase subunit III  43.41 
 
 
234 aa  142  4e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0896497  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1678  cytochrome c oxidase subunit III  43.41 
 
 
234 aa  141  5e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0857  cytochrome c oxidase subunit III  41.41 
 
 
209 aa  140  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0853  cytochrome c oxidase subunit III  41.41 
 
 
209 aa  140  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0805  cytochrome c oxidase, subunit III  40.91 
 
 
209 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0850  cytochrome c oxidase subunit III  41.33 
 
 
211 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6884  cytochrome c oxidase subunit III  41.24 
 
 
215 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2421  cytochrome c oxidase subunit III  35.86 
 
 
262 aa  132  3e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0162196  normal  0.448728 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5815  cytochrome c oxidase subunit III  42.56 
 
 
225 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.186525  hitchhiker  0.0033512 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4437  cytochrome c oxidase, subunit III  40.82 
 
 
209 aa  132  5e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.424494  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0168  cytochrome c oxidase subunit III  41.15 
 
 
229 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0413962 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0224  cytochrome c oxidase subunit III  40.62 
 
 
229 aa  128  6e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.933417  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1246  cytochrome/quinol oxidase subunit 3  40.91 
 
 
214 aa  125  3e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0407  cytochrome c oxidase, subunit III  41.29 
 
 
196 aa  123  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4178  cytochrome c oxidase, subunit III  39.29 
 
 
211 aa  121  7e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.304449  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1520  cytochrome c oxidase subunit III  34.91 
 
 
259 aa  117  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.34828  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2994  cytochrome c oxidase, subunit III  35.15 
 
 
229 aa  115  3.9999999999999997e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0786  cytochrome c oxidase subunit I  39.78 
 
 
832 aa  114  7.999999999999999e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0454101  normal  0.689784 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1250  cytochrome c oxidase, subunit III  38.3 
 
 
197 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.287461  hitchhiker  0.0000975001 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0826  cytochrome c oxidase subunit III  36.22 
 
 
215 aa  110  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.648896  normal  0.196045 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1036  cytochrome c oxidase subunit III  35.53 
 
 
219 aa  107  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0806413 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6231  cytochrome c oxidase subunit III  38.34 
 
 
225 aa  105  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211629  normal  0.107946 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0819  cytochrome c oxidase, subunit III  35.14 
 
 
203 aa  105  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1977  cytochrome c oxidase, subunit III  34.76 
 
 
243 aa  102  4e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.888389  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3192  putative additional subunit of nitric oxide reductase (Nor) complex, membrane protein  35.9 
 
 
201 aa  102  5e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4575  cytochrome c oxidase, subunit III  33.33 
 
 
200 aa  101  8e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.383719 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1918  cytochrome c oxidase subunit III family protein  33.67 
 
 
204 aa  100  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5946  cytochrome c oxidase subunit III  34 
 
 
211 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0560  putative additional subunit of nitric oxide reductase (Nor) complex, membrane protein  36.55 
 
 
197 aa  99.4  3e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0830367  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2248  cytochrome c oxidase subunit I  33.85 
 
 
825 aa  99.4  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3105  cytochrome c oxidase subunit I  33.86 
 
 
819 aa  98.6  5e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2428  cytochrome c oxidase subunit III  31.94 
 
 
240 aa  96.7  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0272  cytochrome c oxidase subunit III family protein  31.72 
 
 
206 aa  96.3  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3958  cytochrome c oxidase subunit III  35.03 
 
 
234 aa  95.9  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.178096 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4932  cytochrome c oxidase, subunit III  35.57 
 
 
193 aa  96.3  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.318049  normal  0.0324373 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0026  cytochrome c oxidase subunit III  36.92 
 
 
229 aa  95.9  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.471967 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2070  cytochrome c oxidase subunit III  35.45 
 
 
204 aa  95.5  5e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.515134 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1813  cytochrome c oxidase, subunit III  34.05 
 
 
194 aa  95.5  5e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3895  cytochrome c oxidase subunit III  33.18 
 
 
240 aa  95.5  5e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2320  cytochrome c oxidase subunit III family protein  30.43 
 
 
174 aa  94  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0210247  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2600  cytochrome c oxidase subunit III  35.83 
 
 
204 aa  93.6  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3991  cytochrome c oxidase subunit III  46.02 
 
 
305 aa  93.6  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.632363  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2591  cytochrome c oxidase subunit III  30.41 
 
 
239 aa  93.6  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0750722  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4463  cytochrome c oxidase, subunit III  37.37 
 
 
193 aa  93.2  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.327335  normal  0.0356516 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4376  cytochrome c oxidase, subunit III  37.37 
 
 
193 aa  93.2  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265005  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4757  cytochrome c oxidase, subunit III  37.37 
 
 
193 aa  93.2  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0954288  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0998  cytochrome c oxidase, subunit III  33.15 
 
 
209 aa  92.8  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0519  cytochrome c oxidase subunit III  33.5 
 
 
224 aa  92.8  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0892634  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2265  cytochrome c oxidase subunit III  31.19 
 
 
239 aa  92.8  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.06442  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1163  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  33.15 
 
 
209 aa  91.7  7e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.322361  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2238  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  33.15 
 
 
209 aa  91.7  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.394617  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0911  cytochrome c oxidase, subunit III  33.15 
 
 
209 aa  91.7  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1513  cytochrome c oxidase subunit III  36.96 
 
 
184 aa  90.9  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0440  cytochrome c oxidase subunit III  35.6 
 
 
208 aa  90.9  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0994287 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0077  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  32.61 
 
 
209 aa  90.1  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0129097  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2361  cytochrome c oxidase subunit III  31.16 
 
 
241 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1541  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  32.61 
 
 
209 aa  90.1  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0106  cytochrome c oxidase subunit III  35.03 
 
 
208 aa  89.7  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3635  cytochrome-C oxidase subunit III oxidoreductase protein  33.5 
 
 
231 aa  89.4  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.074977  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5127  cytochrome c oxidase subunit III  33.5 
 
 
234 aa  89.4  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0263  cytochrome c oxidase subunit I  31.28 
 
 
827 aa  89  5e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0374509  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2342  cytochrome c oxidase subunit III  34.5 
 
 
225 aa  86.7  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4156  cytochrome c oxidase subunit III family protein  29.95 
 
 
205 aa  86.3  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.487941  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1639  cytochrome c oxidase subunit III  33.33 
 
 
202 aa  86.3  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0251  cytochrome c oxidase subunit III  36.22 
 
 
248 aa  86.3  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00348503 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2477  cytochrome c oxidase, subunit III  31.34 
 
 
240 aa  84.7  7e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2086  NorE protein involved in nitric oxide reduction  34.59 
 
 
192 aa  84.3  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.289144  normal  0.597939 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3647  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  30.77 
 
 
204 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.435887  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0445  putative denitrification protein NorE  32.82 
 
 
199 aa  83.2  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000224014  normal  0.5524 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2267  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  32.5 
 
 
211 aa  83.2  0.000000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.462963  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7359  Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like  32.99 
 
 
239 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.617384 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1900  Cytochrome-c oxidase  34.55 
 
 
208 aa  83.2  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.910491  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1968  cytochrome c oxidase, subunit III  34.01 
 
 
212 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6212  cytochrome c oxidase, subunit III  32.49 
 
 
240 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5939  cytochrome c oxidase subunit III  32.49 
 
 
240 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0729  cytochrome c oxidase, subunit III  32.49 
 
 
236 aa  82.4  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1777  cytochrome c oxidase, subunit III  30.85 
 
 
211 aa  82  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.723591  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2265  cytochrome c oxidase, subunit III  32.34 
 
 
202 aa  81.6  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2777  cytochrome c oxidase, subunit III  33 
 
 
211 aa  81.3  0.000000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.735853 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3795  cytochrome c oxidase, subunit III  34.05 
 
 
198 aa  81.3  0.000000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478856  normal  0.908261 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3187  nitric oxide reductase E protein  37.82 
 
 
184 aa  80.5  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1970  putative denitrification protein NorE  32.8 
 
 
201 aa  81.3  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2714  ubiquinol oxidase, subunit III  32.34 
 
 
197 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.67417  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3864  cytochrome c oxidase, subunit III  33.51 
 
 
198 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00290565  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1213  cytochrome c oxidase subunit III  29.8 
 
 
208 aa  80.1  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.84888  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1371  ubiquinol oxidase, subunit III  32.34 
 
 
202 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.819538  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06401  cytochrome c oxidase, subunit III  31.03 
 
 
207 aa  80.5  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0898782 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>