57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0218 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0218  hypothetical protein  100 
 
 		 278 aa  564  1e-160  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.540785  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0248  hypothetical protein  68.11 
 
 		 274 aa  364  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000174158  hitchhiker  0.00180581 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0041  hypothetical protein  61.19 
 
 		 276 aa  323  3e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194765 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0042  hypothetical protein  59.46 
 
 		 276 aa  311  5.999999999999999e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2525  SCO1/SenC family protein  51.5 
 
 		 298 aa  279  4e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.2485899999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0537  hypothetical protein  47.48 
 
 		 415 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0290591 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1344  hypothetical protein  51.12 
 
 		 247 aa  241  1e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00606517  normal  0.54274 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1822  uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC  49.28 
 
 		 313 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000175275  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1542  uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC  45.65 
 
 		 342 aa  231  8.000000000000001e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.12811  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0228  electron transport protein SCO1/SenC  42.54 
 
 		 277 aa  187  2e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.133565  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2997  electron transport protein SCO1/SenC  30.58 
 
 		 280 aa  152  8e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100576 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0847  SCO1/SenC family protein  37.13 
 
 		 283 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0854  SCO1/SenC family protein  35.02 
 
 		 291 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0802  SCO1/SenC family protein  35.86 
 
 		 291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.953306  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0850  SCO1/SenC family protein  35.02 
 
 		 291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1589  electron transport protein SCO1/SenC  34.14 
 
 		 287 aa  146  5e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0415  hypothetical protein  35.15 
 
 		 299 aa  142  4e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1523  electron transport protein SCO1/SenC  29.74 
 
 		 279 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3988  electron transport protein SCO1/SenC  33.46 
 
 		 344 aa  133  3.9999999999999996e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.784831  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6887  hypothetical protein  30.42 
 
 		 342 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5949  electron transport protein SCO1/SenC  29.46 
 
 		 267 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2418  hypothetical protein  31.05 
 
 		 312 aa  109  6e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0278371  normal  0.33337 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2276  uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC-like  31.42 
 
 		 276 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0829  hypothetical protein  30.91 
 
 		 260 aa  103  4e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.449378  normal  0.121929 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1599  uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC-like protein  30.97 
 
 		 276 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.613564  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4434  SCO1/SenC family protein  31.82 
 
 		 260 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0517752  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1675  uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC-like protein  30.53 
 
 		 276 aa  98.6  9e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2707  hypothetical protein  32.58 
 
 		 303 aa  92  8e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.330864 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5818  hypothetical protein  27.56 
 
 		 261 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.110023  hitchhiker  0.00869837 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4181  hypothetical protein  27.27 
 
 		 262 aa  79.7  0.00000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.149601  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5012  hypothetical protein  30.51 
 
 		 277 aa  79.3  0.00000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.460518  normal  0.137531 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3047  electron transport protein SCO1/SenC  26.19 
 
 		 282 aa  67.4  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1172  electron transport protein SCO1/SenC  24.85 
 
 		 283 aa  58.9  0.00000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1948  electron transport protein SCO1/SenC  30.34 
 
 		 248 aa  59.3  0.00000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1977  electron transport protein SCO1/SenC  27.81 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1482  electron transport protein SCO1/SenC  27.54 
 
 		 193 aa  51.6  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2458  electron transport protein SCO1/SenC  30.97 
 
 		 218 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.657864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2283  electron transport protein SCO1/SenC  30.18 
 
 		 218 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.897597  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3488  electron transport protein SCO1/SenC  28.82 
 
 		 218 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3891  electron transport protein SCO1/SenC  30.49 
 
 		 222 aa  49.7  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2449  electron transport protein SCO1/SenC  30.77 
 
 		 218 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.010405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0048  electron transport protein SCO1/SenC  27.52 
 
 		 208 aa  48.5  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1479  electron transport protein SCO1/SenC  21.82 
 
 		 196 aa  47.4  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0070  hypothetical protein  29.82 
 
 		 198 aa  46.6  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1588  electron transport protein SCO1/SenC  22.36 
 
 		 188 aa  46.2  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000473469  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2627  electron transport protein SCO1/SenC  30.93 
 
 		 425 aa  45.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1801  electron transport protein SCO1/SenC  23.67 
 
 		 291 aa  45.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.53156 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1521  electron transport protein SCO1/SenC  24.44 
 
 		 202 aa  44.3  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0663  electron transport protein SCO1/SenC  20.55 
 
 		 197 aa  43.1  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000146035  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1572  electron transport protein SCO1/SenC  27.23 
 
 		 250 aa  43.1  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.304694  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4130  electron transport protein SCO1/SenC  22.63 
 
 		 194 aa  42.7  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4017  electron transport protein SCO1/SenC  22.63 
 
 		 194 aa  42.7  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0582  electron transport protein SCO1/SenC  28.93 
 
 		 206 aa  42.7  0.006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1398  SCO1/SenC family protein  27.56 
 
 		 193 aa  42.7  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0931  electron transport protein SCO1/SenC  26.59 
 
 		 248 aa  42.4  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03040  signal peptide protein  22.39 
 
 		 194 aa  42.4  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0471511 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1985  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.89 
 
 		 521 aa  42  0.01  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.225139  hitchhiker  0.0000175467 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>