More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0217 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  100 
 
 		 188 aa  383  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  79.26 
 
 		 186 aa  307  5e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  75 
 
 		 186 aa  288  3e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  71.66 
 
 		 186 aa  272  2.0000000000000002e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  69.35 
 
 		 184 aa  268  4e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  43.62 
 
 		 178 aa  165  2.9999999999999998e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  44.39 
 
 		 176 aa  157  7e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  44.62 
 
 		 194 aa  157  7e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  44.09 
 
 		 194 aa  156  1e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  45.16 
 
 		 178 aa  156  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  43.01 
 
 		 170 aa  151  5e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  40.53 
 
 		 176 aa  130  7.999999999999999e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0664  nitroreductase  36.02 
 
 		 180 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.237638  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  39.01 
 
 		 174 aa  115  3e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  36.13 
 
 		 168 aa  111  7.000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  36.75 
 
 		 163 aa  108  5e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  35.98 
 
 		 180 aa  103  1e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  35.06 
 
 		 169 aa  102  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  33.33 
 
 		 165 aa  101  5e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  35 
 
 		 192 aa  99.8  2e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  31.55 
 
 		 163 aa  97.1  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  32.11 
 
 		 174 aa  94.4  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  35.11 
 
 		 176 aa  92.4  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  34.34 
 
 		 166 aa  91.7  5e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  31.65 
 
 		 204 aa  92  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  34.34 
 
 		 166 aa  92  5e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  33.14 
 
 		 179 aa  91.3  8e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1158  nitroreductase  35.54 
 
 		 169 aa  91.3  8e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000244648  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  30.9 
 
 		 169 aa  90.9  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0617  nitroreductase  31.05 
 
 		 169 aa  89.7  2e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.146729  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0645  nitroreductase family protein  30.37 
 
 		 171 aa  89.4  3e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0679  nitroreductase family protein  30.37 
 
 		 171 aa  89.4  3e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0115  nitroreductase  35.26 
 
 		 274 aa  89.4  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00205311  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1167  nitroreductase  37.36 
 
 		 174 aa  88.6  6e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_585  nitroreductase  30.57 
 
 		 169 aa  88.6  6e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.179153  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1083  nitroreductase  32.97 
 
 		 175 aa  87.8  9e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000705077  normal  0.264169 
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  33.33 
 
 		 183 aa  86.7  2e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0079  nitroreductase  33.33 
 
 		 175 aa  86.3  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.423186  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0649  nitroreductase  31.69 
 
 		 173 aa  86.7  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.535499  normal  0.149872 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2289  nitroreductase family protein  31.63 
 
 		 221 aa  85.5  4e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  31.79 
 
 		 188 aa  85.5  4e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0271  nitroreductase  31.05 
 
 		 171 aa  85.5  4e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000757805  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0813  nitroreductase  36.02 
 
 		 173 aa  85.1  5e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1165  nitroreductase family protein  34.9 
 
 		 181 aa  85.5  5e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000313764  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0997  nitroreductase family protein  34.9 
 
 		 181 aa  85.5  5e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0119809  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3226  nitroreductase  29.89 
 
 		 187 aa  85.5  5e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.236693  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24750  nitroreductase  30.39 
 
 		 176 aa  85.1  6e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  33.51 
 
 		 167 aa  84.7  7e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1141  nitroreductase  31.52 
 
 		 171 aa  84  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.426198  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  35.26 
 
 		 190 aa  83.2  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2247  nitroreductase  38.54 
 
 		 209 aa  82.4  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.200242  normal  0.163117 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2104  nitroreductase  37.5 
 
 		 223 aa  82.8  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.0062642  normal  0.304613 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0212  nitroreductase  32.97 
 
 		 184 aa  82  0.000000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.362808  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1183  nitroreductase  32.26 
 
 		 175 aa  82  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000761176  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1895  nitroreductase  27.01 
 
 		 191 aa  82  0.000000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13220  nitroreductase  30.9 
 
 		 278 aa  81.6  0.000000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1226  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  32.21 
 
 		 222 aa  81.6  0.000000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18320  nitroreductase  28.42 
 
 		 174 aa  81.6  0.000000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0371  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  31.34 
 
 		 227 aa  81.3  0.000000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2239  nitroreductase family protein  30 
 
 		 215 aa  80.9  0.000000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.153685  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0599  nitroreductase  31.74 
 
 		 166 aa  80.9  0.000000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0153  nitroreductase  32.07 
 
 		 174 aa  80.9  0.000000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027489  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0509  nitroreductase  35.19 
 
 		 181 aa  80.9  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  32.61 
 
 		 167 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1660  nitroreductase  30.43 
 
 		 175 aa  80.9  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.283139  normal  0.036754 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  30.86 
 
 		 187 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0846  nitroreductase  32.32 
 
 		 169 aa  80.1  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.245537  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0739  nitroreductase  32.6 
 
 		 176 aa  79.7  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.033186  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2975  nitroreductase  31.98 
 
 		 169 aa  79.3  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.522963 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0082  nitroreductase  29.7 
 
 		 201 aa  79.3  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4783  nitroreductase  35.42 
 
 		 217 aa  79.3  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0866516 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2367  nitroreductase family protein  29.52 
 
 		 215 aa  79  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.130661  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  28.11 
 
 		 180 aa  78.6  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2286  nitroreductase family protein  29.52 
 
 		 215 aa  78.2  0.00000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.153669  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1643  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  31.12 
 
 		 216 aa  77.8  0.00000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.462353  normal  0.0151841 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0406  nitroreductase  33.33 
 
 		 201 aa  77.8  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.699033  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33110  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase protein  31.12 
 
 		 216 aa  77  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00411999  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  31.98 
 
 		 214 aa  77  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00135  nitroreductase  34.65 
 
 		 227 aa  77.4  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2105  nitroreductase  30.11 
 
 		 176 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.892838  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4962  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  31.86 
 
 		 207 aa  77  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.445827  normal  0.0961797 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2657  nitroreductase  30.46 
 
 		 202 aa  77.4  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.752481  normal  0.637011 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  31.98 
 
 		 191 aa  77.4  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_003296  RS03753  oxidoreductase protein  32.14 
 
 		 216 aa  76.6  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.451042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2909  nitroreductase  33.33 
 
 		 206 aa  77  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2211  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  33.33 
 
 		 228 aa  76.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.249777  normal  0.157352 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0427  oxidoreductase  33.85 
 
 		 205 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  26.49 
 
 		 177 aa  76.6  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5045  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  31.96 
 
 		 584 aa  77  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87863  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0432  nitroreductase  33.16 
 
 		 201 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.181342  normal  0.330733 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1710  nitroreductase family protein  30.5 
 
 		 216 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2101  nitroreductase family protein  29.05 
 
 		 215 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.320716  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2040  nitroreductase family protein  29.05 
 
 		 215 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0134367  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2282  nitroreductase family protein  29.05 
 
 		 215 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.1661e-35 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2257  nitroreductase family protein  29.05 
 
 		 215 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.328438  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1903  nitroreductase  35.76 
 
 		 185 aa  76.3  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  33.92 
 
 		 190 aa  76.3  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3085  nitroreductase family protein  29.81 
 
 		 215 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000156331 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2080  nitroreductase  28.57 
 
 		 215 aa  75.5  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.123305  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3978  nitroreductase  31.47 
 
 		 209 aa  75.5  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0811138 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>