More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0212 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0212  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 265 aa  543  1e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.272765  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0738  ABC transporter related  81.89 
 
 		 265 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000124437 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0725  ABC transporter related protein  78.87 
 
 		 265 aa  443  1e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.129055  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1475  ABC transporter related protein  50.38 
 
 		 265 aa  290  1e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0659  ABC transporter related  49.24 
 
 		 264 aa  289  3e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.548438  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2854  ABC transporter related protein  50 
 
 		 264 aa  282  5.000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2163  ABC transporter related  47.15 
 
 		 264 aa  272  5.000000000000001e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.573773 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1111  ABC transporter, ATPase subunit  48.8 
 
 		 260 aa  270  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1118  ABC transporter, ATPase subunit  49.2 
 
 		 270 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.505252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0323  hypothetical protein  49.05 
 
 		 264 aa  267  1e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0704987  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2076  ABC transporter, ATP-binding protein  51.79 
 
 		 267 aa  266  2e-70  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000172805  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19970  ABC transporter related  48.86 
 
 		 265 aa  266  2.9999999999999995e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0719287  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2586  ABC transporter related protein  52.61 
 
 		 262 aa  266  2.9999999999999995e-70  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000199395  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0075  ABC transporter related  49 
 
 		 282 aa  265  4e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03830  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  47.35 
 
 		 263 aa  263  2e-69  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2830  ABC transporter related  47.35 
 
 		 267 aa  260  2e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1714  ABC transporter related  45.45 
 
 		 264 aa  258  5.0000000000000005e-68  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0481461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4551  ABC transporter related  48.86 
 
 		 264 aa  256  2e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000329769  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0251  ABC transporter ATP-binding protein  47.19 
 
 		 267 aa  256  2e-67  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000273  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1601  ABC transporter related  44.32 
 
 		 264 aa  256  3e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.81737 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0630  ABC transporter related  48.86 
 
 		 263 aa  255  5e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.764744  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1437  ABC transporter, ATPase subunit  43.94 
 
 		 264 aa  253  2.0000000000000002e-66  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.432186 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0865  ABC transporter related  43.35 
 
 		 264 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1945  ABC transporter related  46.97 
 
 		 264 aa  252  4.0000000000000004e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.446826  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1571  ABC transporter related  46.79 
 
 		 265 aa  250  2e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.865643  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1209  ABC transporter-related protein  42.59 
 
 		 264 aa  248  5e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0487778 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4044  ABC transporter related  42.05 
 
 		 264 aa  247  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2040  ABC transporter-related protein  42.42 
 
 		 264 aa  244  9e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1463  ABC transporter related  43.61 
 
 		 264 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.466344  hitchhiker  0.000000593097 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3721  ABC transporter related  41.67 
 
 		 264 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1504  ABC transporter related  43.61 
 
 		 264 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1313  ABC transporter related  42.97 
 
 		 264 aa  243  3e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3065  ABC transporter related  41.29 
 
 		 264 aa  242  3.9999999999999997e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1976  ABC transporter, ATP-binding protein  41.83 
 
 		 264 aa  242  3.9999999999999997e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.333354  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1504  ABC transporter related  45.45 
 
 		 296 aa  241  6e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2056  ABC transporter, ATP-binding protein  41.83 
 
 		 264 aa  241  6e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0111  ABC transporter, ATP-binding protein  42.59 
 
 		 264 aa  241  1e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3142  ABC transporter, ATP-binding protein  42.59 
 
 		 264 aa  241  1e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0690  ABC transport system ATP-binding protein  42.59 
 
 		 264 aa  241  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.553471  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0442  ABC transporter, ATP-binding protein  42.42 
 
 		 264 aa  241  1e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0762699  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1477  ABC transporter, ATP-binding protein  42.59 
 
 		 264 aa  241  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2905  ABC transporter, ATP-binding protein  42.59 
 
 		 264 aa  241  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0524  ABC transporter, ATP-binding protein  42.59 
 
 		 264 aa  241  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002972  ABC transporter ATP-binding protein  42.8 
 
 		 264 aa  240  2e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0507  ABC transporter, ATP-binding protein  42.59 
 
 		 264 aa  240  2e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2362  ABC transporter related protein  46 
 
 		 261 aa  240  2e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000588091  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0474  ABC transporter related  40.91 
 
 		 264 aa  240  2e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.753612  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2862  ABC transporter related protein  43.65 
 
 		 270 aa  239  2.9999999999999997e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1951  ABC transporter related  41.57 
 
 		 264 aa  239  5e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.168978  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3143  ABC transporter-related protein  40.91 
 
 		 264 aa  238  8e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.288919  normal  0.982216 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0823  ABC transporter ATP-binding protein  43.02 
 
 		 267 aa  237  1e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0106274 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2840  ABC transporter related  40.91 
 
 		 264 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2216  ABC transporter related  40.91 
 
 		 264 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.315955  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2829  ABC transporter related  40.91 
 
 		 264 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0235677  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1087  ABC transporter related  43.18 
 
 		 264 aa  237  2e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6159  ABC transporter, ATPase subunit  40.3 
 
 		 264 aa  236  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.395057 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2869  ABC transporter related  41.98 
 
 		 265 aa  237  2e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1947  ABC transporter related  39.77 
 
 		 264 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.477016  normal  0.349831 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1748  ABC transporter related  39.77 
 
 		 264 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2225  ABC transporter related  43.43 
 
 		 257 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0489859  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4313  ABC transporter related  40.3 
 
 		 264 aa  232  5e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.887716  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1738  ABC transporter ATP-binding protein  41.95 
 
 		 264 aa  231  6e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.924585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14370  putative ABC-transporter ATP-binding component  40.91 
 
 		 264 aa  231  7.000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1275  ABC transporter ATP-binding protein  40.91 
 
 		 264 aa  231  8.000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0621  ABC transporter, ATP-binding protein  42.86 
 
 		 245 aa  228  8e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.183641  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2104  ABC transporter component  42.05 
 
 		 264 aa  228  1e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02938  hypothetical protein  42.64 
 
 		 264 aa  225  7e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0049  ABC transporter, ATP-binding protein  38.02 
 
 		 264 aa  222  4.9999999999999996e-57  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1153  ABC transporter ATP-binding protein  46.47 
 
 		 252 aa  221  9.999999999999999e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0266393  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1819  ABC transporter related  44.58 
 
 		 254 aa  217  1e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000182766  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0207  ABC transporter related protein  44.23 
 
 		 262 aa  208  7e-53  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0044  ABC transporter related  43.48 
 
 		 251 aa  203  2e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0260  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  43.37 
 
 		 254 aa  202  5e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0269  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  41.67 
 
 		 256 aa  202  6e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.43348  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1187  ABC transporter, ATP-binding protein  41.15 
 
 		 253 aa  198  7e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.708158  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0077  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  43.78 
 
 		 251 aa  197  2.0000000000000003e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1100  ABC transporter related  40.97 
 
 		 242 aa  189  4e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3636  ABC transporter related  32.03 
 
 		 286 aa  124  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000375654  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0297  ABC transporter ATP-binding protein  32.46 
 
 		 339 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0312  ABC transporter ATP-binding protein  32.46 
 
 		 339 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1794  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  31.85 
 
 		 284 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000176304  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0343  ABC transporter, ATP-binding protein  32.46 
 
 		 339 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0281  ABC transporter, ATP-binding protein  32.09 
 
 		 339 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0385  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  34.36 
 
 		 367 aa  119  3.9999999999999996e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1738  ABC transporter related  29.96 
 
 		 244 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0319  cobalt transporter ATP-binding subunit  31.09 
 
 		 288 aa  119  4.9999999999999996e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.2074000000000003e-19 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0341  ABC transporter, ATP-binding protein  32.09 
 
 		 339 aa  118  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0385  ABC transporter, ATP-binding protein  32.09 
 
 		 339 aa  118  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0292  ABC transporter related  31.72 
 
 		 339 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4962  ABC transporter, ATP-binding protein  32.09 
 
 		 339 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3392  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  33.2 
 
 		 256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0284  ABC transporter, ATP-binding protein  31.72 
 
 		 339 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0479  ATPase  30.34 
 
 		 244 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.119209  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2540  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  34.8 
 
 		 364 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.534677 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0358  ABC transporter, ATP-binding protein  31.72 
 
 		 339 aa  116  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0244  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  29.13 
 
 		 381 aa  115  7.999999999999999e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2652  ABC transporter related  33.07 
 
 		 340 aa  115  7.999999999999999e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  30.96 
 
 		 246 aa  115  8.999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0440126  decreased coverage  0.00217746 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1034  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  32.08 
 
 		 256 aa  115  1.0000000000000001e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.634603  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1011  ABC transporter related  26.61 
 
 		 287 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000809706  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>