More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0175 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0175  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 203 aa  418  1e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1731  TetR family transcriptional regulator  69.9 
 
 		 199 aa  293  1e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.206322 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3012  transcriptional regulator, TetR family  69.79 
 
 		 200 aa  286  1e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3896  transcriptional regulator, TetR family  60.3 
 
 		 199 aa  256  1e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.971829  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3981  transcriptional regulator, TetR family  60.1 
 
 		 198 aa  255  4e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000890193 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1650  TetR family transcriptional regulator  54.87 
 
 		 196 aa  220  9.999999999999999e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00305011  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2291  transcriptional regulator, TetR family  31.85 
 
 		 216 aa  95.9  4e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0413  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 227 aa  79.7  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0176  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 263 aa  79.7  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1016  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 210 aa  78.2  0.00000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00988275  normal  0.688061 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4071  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 235 aa  76.3  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.365856  normal  0.0686473 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5451  transcriptional regulator TetR family  31.9 
 
 		 241 aa  73.6  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1048  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 210 aa  72.8  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0851  TetR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 241 aa  73.2  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1007  transcription regulator protein  27.91 
 
 		 239 aa  72.8  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.605979  normal  0.178446 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2500  TetR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 234 aa  72.4  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3995  TetR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 243 aa  72  0.000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3681  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 234 aa  70.9  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1742  transcriptional regulator, TetR family  30.71 
 
 		 235 aa  71.2  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.666045  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02063  putative transcription regulator transcription regulator protein  32.2 
 
 		 224 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0495626  normal  0.936254 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2022  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 225 aa  70.5  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.613149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4502  TetR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 241 aa  70.1  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.595773 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0873  transcriptional regulator, TetR family  26.74 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.326269 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2904  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 213 aa  69.3  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5667  TetR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1459  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 203 aa  68.9  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.540117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5749  TetR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 225 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.147109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0952  TetR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 210 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0602788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33190  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 202 aa  68.9  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  35.04 
 
 		 220 aa  68.9  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1713  TetR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 210 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.312899  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2095  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 210 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0799745 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2364  TetR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 210 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2325  TetR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 210 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  30.33 
 
 		 263 aa  68.6  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2249  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 228 aa  68.2  0.00000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115177  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5516  TetR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 270 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.165925  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0938  transcriptional regulator, TetR family  26.16 
 
 		 231 aa  67.8  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0638862 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5093  transcriptional regulator, TetR family  27.92 
 
 		 233 aa  67.4  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0355233 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1237  transcriptional regulator, TetR family  27.33 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.665439 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  47.14 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0960  TetR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 206 aa  67.8  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.462033  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5697  TetR family transcriptional regulator  23.83 
 
 		 220 aa  67.8  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.197583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4901  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 209 aa  67.4  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3309  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4405  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 259 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.630882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5087  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 259 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  47.14 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5773  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 259 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.669739 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0468  Transcriptional regulator TetR  34.21 
 
 		 219 aa  67.8  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  47.14 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2666  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 213 aa  67  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2892  TetR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 227 aa  66.6  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0741527  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2134  TetR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.175968 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 204 aa  65.9  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 197 aa  65.5  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2244  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 192 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.763617 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3949  TetR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.549729 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3584  TetR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 212 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2348  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 192 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.105911 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3101  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 230 aa  63.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.359837  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0886  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 231 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1888  TetR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1153  transcriptional regulator, TetR family  29.56 
 
 		 246 aa  63.2  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.181492  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3598  TetR family transcriptional regulator  24.36 
 
 		 227 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646734  normal  0.699465 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0446  TetR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 220 aa  63.5  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1086  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 219 aa  63.2  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.535417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 217 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2158  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 244 aa  63.2  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3533  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 237 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0909277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02513  transcriptional regulator, TetR family protein  30.39 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  33.08 
 
 		 231 aa  62.8  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5281  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 257 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4259  regulatory protein TetR  27.59 
 
 		 208 aa  63.2  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.344931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4427  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 216 aa  62.8  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4062  TetR family transcriptional regulator  24.06 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0994  transcriptional regulator, TetR family  27.09 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.146386  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0560  transcriptional regulator, TetR family  22.28 
 
 		 208 aa  62  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 220 aa  62  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3958  transcriptional regulator, TetR family  32.24 
 
 		 242 aa  62  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0653  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 239 aa  62  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  42.31 
 
 		 211 aa  62  0.000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4003  transcriptional regulator, TetR family  32.24 
 
 		 242 aa  61.6  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1944  transcriptional regulator, TetR family  34.33 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00538978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1517  transcriptional regulator, TetR family  49.06 
 
 		 372 aa  61.6  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3157  TetR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 330 aa  61.6  0.000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010676  Bphyt_4571  transcriptional regulator, TetR family  24.52 
 
 		 231 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 197 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
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NC_007493  RSP_0186  TetR family transcriptional regulator  23.38 
 
 		 203 aa  60.8  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.625871  n/a   
 
 
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NC_009049  Rsph17029_1819  TetR family transcriptional regulator  23.38 
 
 		 203 aa  60.8  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.191224 
 
 
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NC_007794  Saro_1587  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0494603  n/a   
 
 
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NC_012792  Vapar_5928  transcriptional regulator, TetR family  28.16 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
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NC_009380  Strop_2967  regulatory protein, TetR  28.78 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008254  Meso_2041  TetR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  45.9 
 
 		 271 aa  61.2  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010676  Bphyt_4322  transcriptional regulator, TetR family  24.86 
 
 		 242 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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