19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0164 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU0164  hypothetical protein  100 
 
 
120 aa  246  1e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0215  hypothetical protein  91.67 
 
 
120 aa  231  4e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.250298  hitchhiker  5.80905e-14 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1871  hypothetical protein  36.75 
 
 
119 aa  70.5  8e-12  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.482968  normal  0.159127 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1051  hypothetical protein  36.97 
 
 
120 aa  60.8  5e-09  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000141356 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0496  hypothetical protein  36 
 
 
115 aa  53.1  1e-06  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2219  hypothetical protein  31.58 
 
 
123 aa  53.5  1e-06  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.246381 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7320  hypothetical protein  29.76 
 
 
115 aa  53.1  1e-06  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1985  hypothetical protein  28 
 
 
114 aa  52  2e-06  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1854  hypothetical protein  33.33 
 
 
124 aa  51.6  3e-06  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0869  hypothetical protein  32.53 
 
 
115 aa  51.2  4e-06  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.170288 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1418  hypothetical protein  32.22 
 
 
113 aa  48.5  3e-05  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1728  hypothetical protein  32.22 
 
 
113 aa  48.5  3e-05  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.267724  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0551  hypothetical protein  29.27 
 
 
113 aa  47  9e-05  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.295838  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0613  hypothetical protein  26.83 
 
 
113 aa  46.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2968  hypothetical protein  28.05 
 
 
113 aa  46.6  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0486  hypothetical protein  30.77 
 
 
127 aa  45.4  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.407371  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0030  hypothetical protein  30.1 
 
 
110 aa  43.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2968  hypothetical protein  31.97 
 
 
131 aa  42.4  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1905  hypothetical protein  32.14 
 
 
134 aa  41.2  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>