More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0152 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0152  ornithine carbamoyltransferase  100 
 
 		 303 aa  633  1e-180  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0205  ornithine carbamoyltransferase  89.77 
 
 		 303 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000336127 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3149  ornithine carbamoyltransferase  80.2 
 
 		 303 aa  527  1e-149  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0227  ornithine carbamoyltransferase  79.47 
 
 		 305 aa  512  1e-144  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3742  ornithine carbamoyltransferase  75.58 
 
 		 303 aa  498  1e-140  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3637  ornithine carbamoyltransferase  75.25 
 
 		 303 aa  496  1e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3172  ornithine carbamoyltransferase  74.17 
 
 		 305 aa  483  1e-135  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0370415  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2415  ornithine carbamoyltransferase  60.93 
 
 		 302 aa  394  1e-109  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1869  ornithine carbamoyltransferase  55.92 
 
 		 307 aa  372  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2492  ornithine carbamoyltransferase  52.65 
 
 		 305 aa  363  2e-99  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2465  ornithine carbamoyltransferase  57.48 
 
 		 300 aa  356  2.9999999999999997e-97  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0999  ornithine carbamoyltransferase  53.31 
 
 		 309 aa  350  2e-95  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0647018  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2286  ornithine carbamoyltransferase  54.79 
 
 		 314 aa  350  2e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.102156 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0276  ornithine carbamoyltransferase  54.28 
 
 		 315 aa  350  2e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0343  ornithine carbamoyltransferase  54.13 
 
 		 309 aa  349  3e-95  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2287  ornithine carbamoyltransferase  54.13 
 
 		 313 aa  345  5e-94  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.512601  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1101  ornithine carbamoyltransferase  54 
 
 		 303 aa  340  2e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0570  ornithine carbamoyltransferase  54.28 
 
 		 320 aa  339  2.9999999999999998e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0246  ornithine carbamoyltransferase  52.53 
 
 		 298 aa  339  4e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2532  ornithine carbamoyltransferase  52.81 
 
 		 300 aa  338  7e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.120857  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0046  ornithine carbamoyltransferase  54.03 
 
 		 300 aa  338  7e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1227  ornithine carbamoyltransferase  51.49 
 
 		 355 aa  337  9.999999999999999e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.786262  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3743  ornithine carbamoyltransferase  53.11 
 
 		 321 aa  338  9.999999999999999e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000875067 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0726  ornithine carbamoyltransferase  51.83 
 
 		 300 aa  336  2.9999999999999997e-91  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.853376  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1451  ornithine carbamoyltransferase  52.82 
 
 		 311 aa  335  3.9999999999999995e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0839  ornithine carbamoyltransferase  51.82 
 
 		 303 aa  335  3.9999999999999995e-91  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.40698 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1790  ornithine carbamoyltransferase  52.3 
 
 		 309 aa  333  2e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2430  ornithine carbamoyltransferase  51.16 
 
 		 305 aa  332  3e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3003  ornithine carbamoyltransferase  51.16 
 
 		 305 aa  332  3e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1542  ornithine carbamoyltransferase  53.33 
 
 		 308 aa  332  5e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1163  ornithine carbamoyltransferase  51.83 
 
 		 309 aa  332  5e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.100026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2915  ornithine carbamoyltransferase  51.64 
 
 		 305 aa  332  6e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.595203  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1899  ornithine carbamoyltransferase  53.02 
 
 		 300 aa  332  7.000000000000001e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2685  ornithine carbamoyltransferase  54.93 
 
 		 309 aa  331  8e-90  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.570167  normal  0.0624155 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0062  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 		 312 aa  330  1e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.366315 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2358  ornithine carbamoyltransferase  49.83 
 
 		 303 aa  330  2e-89  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.186855 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0742  ornithine carbamoyltransferase  51.49 
 
 		 312 aa  328  8e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0540  ornithine carbamoyltransferase  50.33 
 
 		 304 aa  328  8e-89  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000671603  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2178  ornithine carbamoyltransferase  50.83 
 
 		 310 aa  327  1.0000000000000001e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.280829  normal  0.684526 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0532  ornithine carbamoyltransferase  49.83 
 
 		 302 aa  326  2.0000000000000001e-88  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0521808  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0757  ornithine carbamoyltransferase  50.83 
 
 		 309 aa  324  1e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0315  ornithine carbamoyltransferase  50.66 
 
 		 305 aa  323  1e-87  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.624865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3512  ornithine carbamoyltransferase  48.51 
 
 		 302 aa  323  2e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.661553 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0529  ornithine carbamoyltransferase  50.5 
 
 		 309 aa  323  2e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3389  ornithine carbamoyltransferase  51.33 
 
 		 301 aa  323  2e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.345181  normal  0.187028 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1469  ornithine carbamoyltransferase  49.83 
 
 		 326 aa  323  3e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.808206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0675  ornithine carbamoyltransferase  49.83 
 
 		 309 aa  322  4e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2510  ornithine carbamoyltransferase  49.83 
 
 		 309 aa  322  4e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0917  ornithine carbamoyltransferase  49.83 
 
 		 309 aa  322  4e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0375  ornithine carbamoyltransferase  49.83 
 
 		 309 aa  322  4e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1073  ornithine carbamoyltransferase  49.83 
 
 		 309 aa  322  4e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0921  ornithine carbamoyltransferase  49.83 
 
 		 309 aa  322  4e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0124  ornithine carbamoyltransferase  49.83 
 
 		 309 aa  322  4e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2080  ornithine carbamoyltransferase  51 
 
 		 298 aa  322  5e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3573  ornithine carbamoyltransferase  50.17 
 
 		 329 aa  322  6e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.510034  normal  0.18722 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1057  ornithine carbamoyltransferase  48.17 
 
 		 301 aa  321  8e-87  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1754  ornithine carbamoyltransferase  49.83 
 
 		 326 aa  321  9.000000000000001e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0940132  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3205  ornithine carbamoyltransferase  51.16 
 
 		 309 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.820291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0957  ornithine carbamoyltransferase  48.34 
 
 		 307 aa  320  1.9999999999999998e-86  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5885  ornithine carbamoyltransferase  50.17 
 
 		 309 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.718044 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1609  ornithine carbamoyltransferase  50.66 
 
 		 305 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0794  ornithine carbamoyltransferase  52.48 
 
 		 313 aa  320  3e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2784  ornithine carbamoyltransferase  55.92 
 
 		 309 aa  319  3.9999999999999996e-86  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2877  ornithine carbamoyltransferase  55.92 
 
 		 309 aa  319  3.9999999999999996e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1902  ornithine carbamoyltransferase  50.83 
 
 		 306 aa  319  3.9999999999999996e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.24838  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2441  ornithine carbamoyltransferase  51.5 
 
 		 303 aa  319  3.9999999999999996e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.617876  normal  0.127265 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1942  ornithine carbamoyltransferase  49.5 
 
 		 309 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2577  ornithine carbamoyltransferase  49.5 
 
 		 309 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2553  ornithine carbamoyltransferase  49.5 
 
 		 309 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0907  ornithine carbamoyltransferase  49.36 
 
 		 320 aa  318  5e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2691  ornithine carbamoyltransferase  55.59 
 
 		 309 aa  318  5e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.661116  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1461  ornithine carbamoyltransferase  48.68 
 
 		 305 aa  318  6e-86  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18610  ornithine carbamoyltransferase  50.33 
 
 		 305 aa  318  6e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0309685 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0743  ornithine carbamoyltransferase  49.5 
 
 		 309 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.511035 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3012  ornithine carbamoyltransferase  49.5 
 
 		 309 aa  318  7.999999999999999e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2675  ornithine carbamoyltransferase  49.17 
 
 		 308 aa  318  9e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0945  ornithine carbamoyltransferase  51.83 
 
 		 304 aa  317  1e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0836212  normal  0.0898024 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1731  ornithine carbamoyltransferase  51.68 
 
 		 304 aa  318  1e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0394  ornithine carbamoyltransferase  50.66 
 
 		 312 aa  317  2e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.510498 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1573  ornithine carbamoyltransferase  50.33 
 
 		 309 aa  317  2e-85  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0157636  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2317  ornithine carbamoyltransferase  51.33 
 
 		 304 aa  317  2e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0451253  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2554  ornithine carbamoyltransferase  50.17 
 
 		 308 aa  316  3e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0520201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2763  ornithine carbamoyltransferase  49.5 
 
 		 307 aa  316  3e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0732  ornithine carbamoyltransferase  49.17 
 
 		 309 aa  316  3e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0885  ornithine carbamoyltransferase  50.17 
 
 		 305 aa  315  5e-85  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00577741  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2472  ornithine carbamoyltransferase  49.17 
 
 		 309 aa  315  5e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.893068  normal  0.0170187 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3032  ornithine carbamoyltransferase  49.17 
 
 		 306 aa  315  7e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.710258  normal  0.386116 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0158  ornithine carbamoyltransferase  52.04 
 
 		 306 aa  314  9.999999999999999e-85  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2120  ornithine carbamoyltransferase  48.84 
 
 		 302 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0533894  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1120  ornithine carbamoyltransferase  51.16 
 
 		 306 aa  312  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2601  ornithine carbamoyltransferase  49.17 
 
 		 560 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.766266  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2424  ornithine carbamoyltransferase  49.83 
 
 		 308 aa  312  4.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.586584 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1079  ornithine carbamoyltransferase  51.16 
 
 		 306 aa  311  5.999999999999999e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4164  ornithine carbamoyltransferase  49.67 
 
 		 306 aa  312  5.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3901  ornithine carbamoyltransferase  49.67 
 
 		 306 aa  311  5.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1042  ornithine carbamoyltransferase  49.17 
 
 		 329 aa  311  6.999999999999999e-84  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.246407  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2830  ornithine carbamoyltransferase  49.5 
 
 		 308 aa  311  6.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.998909  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1108  ornithine carbamoyltransferase  50.5 
 
 		 306 aa  311  9e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1850  ornithine carbamoyltransferase  48.36 
 
 		 305 aa  310  2e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2430  ornithine carbamoyltransferase  48.5 
 
 		 304 aa  310  2e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>