More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0128 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0128  primosomal protein n`  100 
 
 		 751 aa  1507    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0167  primosomal protein N'  60.91 
 
 		 752 aa  906    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00132621 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2612  primosomal protein N'  56.68 
 
 		 744 aa  812    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2810  primosomal protein N'  56.82 
 
 		 758 aa  838    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0764  primosomal protein N'  49 
 
 		 732 aa  654    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000407652  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0185  primosomal protein N'  60.91 
 
 		 752 aa  901    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0374  primosomal protein N'  60.78 
 
 		 754 aa  906    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0607469  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3337  primosomal protein n  71.18 
 
 		 746 aa  1064    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09880  primosomal protein N'  39.66 
 
 		 745 aa  577  1.0000000000000001e-163  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1758  primosomal protein N'  38.51 
 
 		 732 aa  578  1.0000000000000001e-163  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0566  replication restart DNA helicase PriA  36.83 
 
 		 815 aa  554  1e-156  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00911754  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2315  primosomal protein N'  40.11 
 
 		 747 aa  546  1e-154  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.101119  hitchhiker  0.00122833 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3737  replication restart DNA helicase PriA  43.11 
 
 		 738 aa  546  1e-154  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228486 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1951  primosome assembly protein PriA  39.75 
 
 		 801 aa  541  9.999999999999999e-153  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0779  primosomal protein N'  36.5 
 
 		 802 aa  535  1e-150  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1515  replication restart DNA helicase PriA  38.37 
 
 		 803 aa  534  1e-150  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5549  primosomal protein N'  50.25 
 
 		 858 aa  529  1e-149  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.293579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0760  primosomal protein N'  36.5 
 
 		 798 aa  531  1e-149  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000570984  hitchhiker  0.00000745488 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3719  primosome assembly protein PriA  35.55 
 
 		 801 aa  527  1e-148  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3609  primosome assembly protein PriA  35.43 
 
 		 801 aa  526  1e-148  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1061  primosome assembly protein PriA  37.84 
 
 		 804 aa  528  1e-148  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.964371  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4006  primosome assembly protein PriA  35.55 
 
 		 801 aa  527  1e-148  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3916  primosome assembly protein PriA  35.35 
 
 		 801 aa  526  1e-148  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000142044  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3882  primosome assembly protein PriA  35.43 
 
 		 801 aa  526  1e-148  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000345063 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1396  primosome assembly protein PriA  37.95 
 
 		 798 aa  526  1e-148  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2520  primosome assembly protein PriA  36.65 
 
 		 801 aa  523  1e-147  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0370343  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0315  primosome assembly protein PriA  36.34 
 
 		 796 aa  522  1e-147  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.169363  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1527  primosomal protein N'  35.28 
 
 		 818 aa  523  1e-147  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.590711  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3691  primosome assembly protein PriA  36.27 
 
 		 801 aa  524  1e-147  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1271  primosomal protein N'  36.39 
 
 		 802 aa  523  1e-147  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.58065  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1716  primosome assembly protein PriA  37.55 
 
 		 731 aa  523  1e-147  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1296  primosomal protein N'  36.39 
 
 		 802 aa  523  1e-147  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0764  primosomal protein N'  44.76 
 
 		 736 aa  517  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386533  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1173  replication restart DNA helicase PriA  44.89 
 
 		 809 aa  517  1.0000000000000001e-145  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2156  primosome assembly protein PriA  37.63 
 
 		 781 aa  517  1.0000000000000001e-145  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0770  primosomal protein N'  45.64 
 
 		 735 aa  513  1e-144  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.654251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1594  primosomal protein N'  41.64 
 
 		 735 aa  514  1e-144  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1332  primosomal protein N'  36.4 
 
 		 749 aa  512  1e-143  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000143785  normal  0.287743 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0727  replication restart DNA helicase PriA  44.49 
 
 		 736 aa  507  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.539418  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0764  primosomal protein N'  44.09 
 
 		 736 aa  506  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.129915  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1998  primosome assembly protein PriA  36.76 
 
 		 731 aa  508  9.999999999999999e-143  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0043  primosomal protein N'  38.76 
 
 		 738 aa  503  1e-141  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.401318 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1276  primosome assembly protein PriA  42.04 
 
 		 801 aa  504  1e-141  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3627  primosome assembly protein PriA  41.8 
 
 		 801 aa  499  1e-140  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3967  primosome assembly protein PriA  41.7 
 
 		 801 aa  501  1e-140  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.841786  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3911  primosome assembly protein PriA  41.8 
 
 		 801 aa  498  1e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0025  primosomal protein N'  48.02 
 
 		 679 aa  491  1e-137  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1374  primosomal protein N'  38.01 
 
 		 768 aa  485  1e-135  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228362  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2052  primosomal protein N'  46.24 
 
 		 828 aa  483  1e-135  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0856  primosomal protein N'  42.03 
 
 		 730 aa  480  1e-134  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.44655  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1987  primosomal protein N' (replication factor Y)  36.58 
 
 		 774 aa  478  1e-133  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3774  replication restart DNA helicase PriA  44.42 
 
 		 813 aa  477  1e-133  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0372203  normal  0.148217 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00727  primosome assembly protein PriA  37.08 
 
 		 733 aa  472  1e-132  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0116  primosome assembly protein PriA  38.88 
 
 		 732 aa  472  1e-132  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0337  primosomal protein N'  41.41 
 
 		 815 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.566686  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2594  primosomal protein N`  41.73 
 
 		 733 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0974  primosomal protein N'  40.85 
 
 		 661 aa  470  1.0000000000000001e-131  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000534713  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001745  helicase PriA essential for oriC/DnaA-independent DNA replication  37.06 
 
 		 733 aa  471  1.0000000000000001e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.579492  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2743  primosome assembly protein PriA  37.2 
 
 		 733 aa  470  1.0000000000000001e-131  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2251  primosome assembly protein PriA  39.18 
 
 		 734 aa  471  1.0000000000000001e-131  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.889331  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0672  primosomal protein N'  38.2 
 
 		 835 aa  472  1.0000000000000001e-131  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00593856 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0117  primosome assembly protein PriA  38.78 
 
 		 732 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4099  primosome assembly protein PriA  38.88 
 
 		 732 aa  471  1.0000000000000001e-131  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1123  primosome assembly protein PriA  36.52 
 
 		 730 aa  472  1.0000000000000001e-131  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0274294  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1233  primosomal protein N  37.79 
 
 		 802 aa  471  1.0000000000000001e-131  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0109325  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_278  primosomal protein N, (replication factor Y) (superfamily II helicase)  42.38 
 
 		 815 aa  468  9.999999999999999e-131  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0311908  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4789  primosome assembly protein PriA  39.23 
 
 		 731 aa  466  9.999999999999999e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3812  primosome assembly protein PriA  38.64 
 
 		 732 aa  467  9.999999999999999e-131  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5787  primosome assembly protein PriA  39.5 
 
 		 739 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2792  primosomal protein N'  37.75 
 
 		 745 aa  468  9.999999999999999e-131  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.240357 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1703  primosomal protein N'  37.02 
 
 		 732 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3794  primosome assembly protein PriA  39.23 
 
 		 731 aa  468  9.999999999999999e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3761  primosomal protein N'  37.62 
 
 		 731 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0169  primosome assembly protein PriA  39.42 
 
 		 732 aa  466  9.999999999999999e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4341  primosome assembly protein PriA  38.65 
 
 		 732 aa  463  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.849244  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4311  primosome assembly protein PriA  38.7 
 
 		 732 aa  464  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4425  primosome assembly protein PriA  38.65 
 
 		 732 aa  463  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.981494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4427  primosome assembly protein PriA  38.65 
 
 		 732 aa  464  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66720  primosome assembly protein PriA  39.97 
 
 		 739 aa  464  1e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0786  replication restart DNA helicase PriA  40.84 
 
 		 803 aa  463  1e-129  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.823514  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1038  primosomal protein N'  33.65 
 
 		 724 aa  461  9.999999999999999e-129  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0499  primosomal protein N'  37.94 
 
 		 731 aa  462  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3844  primosomal protein N'  37.68 
 
 		 731 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3986  primosomal protein N'  36.22 
 
 		 848 aa  462  9.999999999999999e-129  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0028  primosome assembly protein PriA  38.85 
 
 		 736 aa  461  9.999999999999999e-129  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0651  primosome assembly protein PriA  37.92 
 
 		 806 aa  459  9.999999999999999e-129  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0161  primosome assembly protein PriA  37.58 
 
 		 835 aa  459  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.139003 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3356  primosomal protein N'  36.86 
 
 		 734 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4038  primosome assembly protein PriA  37.55 
 
 		 731 aa  461  9.999999999999999e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0496  primosomal protein N'  37.68 
 
 		 731 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0475  primosomal protein N'  37.68 
 
 		 731 aa  459  1e-127  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4495  primosome assembly protein PriA  38.13 
 
 		 732 aa  457  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0183  primosome assembly protein PriA  38.11 
 
 		 732 aa  459  1e-127  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5137  primosomal protein N`  38.74 
 
 		 739 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0165  primosome assembly protein PriA  36.89 
 
 		 843 aa  455  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1308  primosomal protein N'  38.95 
 
 		 780 aa  452  1.0000000000000001e-126  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.368616 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1169  primosomal protein N'  39.68 
 
 		 811 aa  454  1.0000000000000001e-126  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.807249  normal  0.476891 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0869  primosomal protein N'  37.6 
 
 		 770 aa  452  1.0000000000000001e-126  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.162124 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0536  primosome assembly protein PriA  38.25 
 
 		 743 aa  455  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0551  primosomal protein N'  37.68 
 
 		 731 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>