More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0064 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0064  integrative genetic element Gsu32, integrase  100 
 
 		 439 aa  899    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3082  phage integrase family protein  43.76 
 
 		 437 aa  367  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2279  Phage integrase  40.39 
 
 		 414 aa  313  4.999999999999999e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0066545  normal  0.0551798 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0366  integrase family protein  40.22 
 
 		 439 aa  308  9e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.134449 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3121  phage integrase family protein  40.04 
 
 		 449 aa  302  6.000000000000001e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1859  phage integrase family protein  39 
 
 		 427 aa  301  2e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0222826  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2119  integrative genetic element Gsu56, integrase  36.52 
 
 		 453 aa  283  5.000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0805  integrase family protein  36.65 
 
 		 433 aa  276  7e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00339873 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1371  phage integrase family protein  36.38 
 
 		 453 aa  266  4e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0813  integrase family protein  36.62 
 
 		 427 aa  258  2e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000471518 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2416  integrase family protein  36.38 
 
 		 443 aa  256  4e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2486  hypothetical protein  28.67 
 
 		 413 aa  167  2.9999999999999998e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1088  hypothetical protein  28.9 
 
 		 414 aa  166  6.9999999999999995e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0072  hypothetical protein  28.31 
 
 		 406 aa  166  9e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1066  hypothetical protein  28.54 
 
 		 414 aa  165  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3232  phage integrase family site specific recombinase  27.95 
 
 		 409 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0308  integrase or site-specific recombinase  28.86 
 
 		 414 aa  153  7e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0112  phage integrase family site specific recombinase  28.86 
 
 		 409 aa  152  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.246788  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0097  phage integrase family site specific recombinase  28.64 
 
 		 409 aa  151  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.89883  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6722  integrase family protein  28.88 
 
 		 413 aa  151  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1761  integrase family protein  31.7 
 
 		 361 aa  145  1e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2093  integrase family protein  29.4 
 
 		 400 aa  144  3e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0064  Phage integrase  29.76 
 
 		 420 aa  144  4e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3455  integrase family protein  26.67 
 
 		 410 aa  143  5e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3823  phage-related integrase  27.88 
 
 		 403 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1046  integrase family protein  28.7 
 
 		 410 aa  141  1.9999999999999998e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000192278  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0112  phage integrase family protein  30.4 
 
 		 413 aa  141  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.525516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3683  phage integrase family protein  28.39 
 
 		 444 aa  141  3e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1844  phage integrase family protein  27.88 
 
 		 426 aa  140  4.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0395  phage integrase family protein  29.4 
 
 		 396 aa  139  1e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.436905  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0217  phage-related integrase  28.03 
 
 		 413 aa  138  2e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.838235  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1709  putative phage integrase  27.84 
 
 		 446 aa  138  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.558135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0927  phage integrase family protein  28.7 
 
 		 425 aa  138  2e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000881827 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2650  integrase family protein  29.16 
 
 		 410 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0205154  hitchhiker  0.00000395125 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3887  integrase family protein  26.2 
 
 		 404 aa  136  7.000000000000001e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2546  phage integrase family protein  28.21 
 
 		 400 aa  136  8e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.40023  hitchhiker  0.00168033 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3935  site-specific recombinase, phage integrase family  26.91 
 
 		 420 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.191126  decreased coverage  0.00000299734 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2656  phage integrase family site specific recombinase  27.06 
 
 		 395 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000325439  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2900  phage integrase family protein  28.84 
 
 		 432 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0362  phage integrase family site specific recombinase  27.75 
 
 		 402 aa  134  3e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.613827  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1726  phage integrase family protein  27.11 
 
 		 395 aa  134  3e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004339  integrase  26.38 
 
 		 398 aa  132  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15350  putative integrase  28.21 
 
 		 400 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000770896  unclonable  1.43377e-21 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2751  integrase family protein  26.25 
 
 		 415 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.606598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0354  Phage integrase  27.75 
 
 		 402 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2489  putative integrase protein  28.25 
 
 		 417 aa  129  8.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0615  Phage integrase  27.06 
 
 		 399 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.862313  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4162  integrase family protein  27.13 
 
 		 422 aa  129  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.806899  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3396  integrase family protein  27.96 
 
 		 414 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0054  phage integrase family site specific recombinase  26.46 
 
 		 422 aa  127  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3273  phage integrase family protein  26.9 
 
 		 401 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0956673  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2845  phage integrase family protein  26.09 
 
 		 409 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal  0.121401 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6547  integrase family protein  27.15 
 
 		 455 aa  127  5e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00352142  normal  0.0182485 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2709  putative prophage integrase  27.63 
 
 		 418 aa  126  9e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.865285 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3232  integrase family protein  26.36 
 
 		 434 aa  124  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.068813  normal  0.462781 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2073  putative integrase prophage protein  31.56 
 
 		 445 aa  124  2e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.343069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1262  integrase family protein  26.56 
 
 		 418 aa  124  3e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.528936  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4070  site-specific recombinase, phage integrase family  26.17 
 
 		 439 aa  124  4e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0496  phage integrase  27.55 
 
 		 418 aa  124  5e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2142  phage integrase  28.38 
 
 		 418 aa  123  6e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.306676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2021  phage integrase family protein  27.42 
 
 		 418 aa  123  7e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.713949  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2015  phage integrase family site specific recombinase  25.81 
 
 		 390 aa  123  8e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3410  integrase family protein  26.9 
 
 		 401 aa  122  9e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.134022  hitchhiker  0.000868318 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3112  integrase family protein  27.73 
 
 		 418 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40500  Phage integrase  32.73 
 
 		 401 aa  122  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0329  site-specific recombinase, phage integrase family protein  30.9 
 
 		 402 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0019463  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3997  integrase family protein  26.55 
 
 		 419 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3353  phage integrase family protein  27.51 
 
 		 393 aa  120  6e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1254  integrase family protein  27.71 
 
 		 406 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3149  integrase family protein  29.59 
 
 		 402 aa  119  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0299  phage integrase family site specific recombinase  30.56 
 
 		 394 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127187 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2870  integrase family protein  29.24 
 
 		 404 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2823  putative phage integrase  24.73 
 
 		 440 aa  117  3e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.339344  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5344  site-specific recombinase, phage integrase family  25.34 
 
 		 402 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0372  phage family integrase  28.83 
 
 		 422 aa  117  5e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1403  integrase family protein  29.14 
 
 		 404 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4153  phage integrase family site specific recombinase  29.63 
 
 		 397 aa  116  8.999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.448481  normal  0.0214927 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0108  integrase family protein  29.35 
 
 		 389 aa  116  8.999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1237  integrase family protein  26.98 
 
 		 401 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.184026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3983  integrase family protein  30.18 
 
 		 404 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3563  integrase family protein  25.45 
 
 		 418 aa  115  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1823  prophage P4 integrase  24.5 
 
 		 421 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0003918  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1172  integrase family protein  25.45 
 
 		 418 aa  115  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.69238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0948  putative integrase  26.67 
 
 		 385 aa  115  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2300  phage integrase family protein  27.95 
 
 		 403 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4470  putative phage integrase  30.49 
 
 		 399 aa  114  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.052147 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2767  phage integrase family protein  25.74 
 
 		 421 aa  114  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00105965 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0053  integrase family protein  27.54 
 
 		 391 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.613927 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4160  phage integrase family protein  26.92 
 
 		 419 aa  114  4.0000000000000004e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0690268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1377  integrase family protein  29.25 
 
 		 404 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.421262  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2993  integrase family protein  27.33 
 
 		 411 aa  114  5e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0241673  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3779  phage integrase family protein  26.73 
 
 		 404 aa  113  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.794944 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4002  phage integrase family site specific recombinase  27.54 
 
 		 387 aa  113  8.000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1100  site-specific recombinase, phage integrase family  24.6 
 
 		 395 aa  112  9e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2336  Phage integrase  25.49 
 
 		 426 aa  112  9e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3669  prophage CP4-like integrase  26.35 
 
 		 462 aa  112  9e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.18314  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01122  integrase  27.19 
 
 		 410 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1465  phage integrase  27.73 
 
 		 418 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0137829  normal  0.595385 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3266  site-specific recombinase, phage integrase family  29.24 
 
 		 367 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.220935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2526  Phage integrase  25.21 
 
 		 481 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000237436  normal  0.0434699 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>