13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0056 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU0056  hypothetical protein  100 
 
 
98 aa  199  7e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0348  addiction module component, TIGR02574 family  47.95 
 
 
73 aa  77  0.00000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0032  hypothetical protein  47.3 
 
 
92 aa  72  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1939  addiction module antitoxin  54.1 
 
 
86 aa  70.1  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1443  addiction module component, TIGR02574 family  53.03 
 
 
75 aa  67.4  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1759  addiction module component, TIGR02574 family  53.03 
 
 
76 aa  65.5  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2372  addiction module component, TIGR02574 family  40.85 
 
 
77 aa  63.5  0.0000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1572  addiction module component, TIGR02574 family  50.75 
 
 
69 aa  61.2  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0061  addiction module component, TIGR02574 family  41.54 
 
 
74 aa  53.9  0.0000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0304  hypothetical protein  41.27 
 
 
72 aa  50.8  0.000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4437  addiction module component  44.64 
 
 
70 aa  48.9  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1058  addiction module component, TIGR02574 family  37.7 
 
 
75 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0907722  hitchhiker  0.0000832382 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0133  hypothetical protein  32.79 
 
 
80 aa  40.4  0.008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000453704  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>