More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0037 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0037  seryl-tRNA synthetase  100 
 
 		 422 aa  867    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3236  seryl-tRNA synthetase  72.68 
 
 		 423 aa  651    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0287  seryl-tRNA synthetase  80.33 
 
 		 422 aa  712    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736944  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0108  seryl-tRNA synthetase  75.77 
 
 		 422 aa  680    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3528  seryl-tRNA synthetase  82.94 
 
 		 423 aa  719    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0089  seryl-tRNA synthetase  75.53 
 
 		 422 aa  678    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000355791 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0616  seryl-tRNA synthetase  73.4 
 
 		 422 aa  659    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0308191  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0326  seryl-tRNA synthetase  70.55 
 
 		 423 aa  605  9.999999999999999e-173  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.81003e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0014  seryl-tRNA synthetase  66.9 
 
 		 424 aa  596  1e-169  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000307933  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0013  seryl-tRNA synthetase  64.44 
 
 		 424 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000183486  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0015  seryl-tRNA synthetase  64.44 
 
 		 424 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0013  seryl-tRNA synthetase  64.44 
 
 		 424 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15266  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0016  seryl-tRNA synthetase  64.44 
 
 		 424 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0012  seryl-tRNA synthetase  64.44 
 
 		 424 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000751386  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0018  seryl-tRNA synthetase  64.44 
 
 		 424 aa  574  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0013  seryl-tRNA synthetase  64.2 
 
 		 424 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00217945  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0012  seryl-tRNA synthetase  64.44 
 
 		 424 aa  571  1.0000000000000001e-162  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000327784  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0016  seryl-tRNA synthetase  63.96 
 
 		 424 aa  572  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00101457  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5302  seryl-tRNA synthetase  63.96 
 
 		 424 aa  572  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000149119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0012  seryl-tRNA synthetase  63.48 
 
 		 424 aa  570  1e-161  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0448744  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0021  seryl-tRNA synthetase  63.98 
 
 		 427 aa  565  1e-160  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.410192  hitchhiker  0.00000214163 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4339  seryl-tRNA synthetase  62.41 
 
 		 423 aa  566  1e-160  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.619806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0013  seryl-tRNA synthetase  65.39 
 
 		 424 aa  567  1e-160  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2756  seryl-tRNA synthetase  63.59 
 
 		 424 aa  560  1e-158  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019051  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0015  seryl-tRNA synthetase  61.85 
 
 		 424 aa  558  1e-158  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00255283  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1424  seryl-tRNA synthetase  64.45 
 
 		 423 aa  561  1e-158  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21060  seryl-tRNA synthetase  62.83 
 
 		 422 aa  557  1e-157  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2626  seryl-tRNA synthetase  60.19 
 
 		 427 aa  546  1e-154  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0010  Serine--tRNA ligase  62.09 
 
 		 427 aa  546  1e-154  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0427717  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2740  seryl-tRNA synthetase  61.65 
 
 		 424 aa  541  1e-153  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.697108 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0872  seryl-tRNA synthetase  62.59 
 
 		 420 aa  544  1e-153  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000202567  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2224  seryl-tRNA synthetase  61.18 
 
 		 425 aa  541  1e-153  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0013  seryl-tRNA synthetase  61.14 
 
 		 425 aa  535  1e-151  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2381  seryl-tRNA synthetase  59.24 
 
 		 423 aa  528  1e-149  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0391  seryl-tRNA synthetase  61.7 
 
 		 432 aa  529  1e-149  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.405433  normal  0.944422 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0011  seryl-tRNA synthetase  61.23 
 
 		 427 aa  525  1e-148  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0824317  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0008  seryl-tRNA synthetase  61.15 
 
 		 421 aa  526  1e-148  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00944776  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0965  seryl-tRNA synthetase  59.48 
 
 		 426 aa  521  1e-147  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000308686  hitchhiker  0.0000000659657 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2745  seryl-tRNA synthetase  60.67 
 
 		 425 aa  523  1e-147  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0028  seryl-tRNA synthetase  60.34 
 
 		 423 aa  520  1e-146  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000346844  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1870  seryl-tRNA synthetase  59.43 
 
 		 423 aa  518  1e-146  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.961379  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0368  seryl-tRNA synthetase  58.39 
 
 		 425 aa  518  1e-146  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2031  seryl-tRNA synthetase  58.77 
 
 		 423 aa  516  1.0000000000000001e-145  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.19968  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0022  seryl-tRNA synthetase  58.35 
 
 		 422 aa  512  1e-144  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0196  seryl-tRNA synthetase  59.19 
 
 		 427 aa  511  1e-144  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0013  seryl-tRNA synthetase  57.42 
 
 		 422 aa  509  1e-143  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000021419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0014  seryl-tRNA synthetase  57.78 
 
 		 426 aa  509  1e-143  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.192456  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1006  seryl-tRNA synthetase  57.35 
 
 		 427 aa  501  1e-140  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.224003  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1073  seryl-tRNA synthetase  56.51 
 
 		 430 aa  498  1e-140  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.441533 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0014  seryl-tRNA synthetase  56.56 
 
 		 425 aa  497  1e-139  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0014  seryl-tRNA synthetase  56.56 
 
 		 425 aa  497  1e-139  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0356  seryl-tRNA synthetase  56.03 
 
 		 425 aa  491  1e-137  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1195  seryl-tRNA synthetase  57.48 
 
 		 417 aa  489  1e-137  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.877064  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0541  seryl-tRNA synthetase  58.25 
 
 		 423 aa  491  1e-137  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28180  seryl-tRNA synthetase  56.34 
 
 		 426 aa  486  1e-136  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.044076  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1776  seryl-tRNA synthetase  54.21 
 
 		 428 aa  484  1e-136  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0781762  hitchhiker  0.00882047 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1699  seryl-tRNA synthetase  56.37 
 
 		 424 aa  486  1e-136  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.849075 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1494  seryl-tRNA synthetase  56.16 
 
 		 424 aa  478  1e-134  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.457179 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2307  seryl-tRNA synthetase  56.4 
 
 		 424 aa  479  1e-134  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1189  seryl-tRNA synthetase  57.14 
 
 		 426 aa  479  1e-134  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.520559  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2596  seryl-tRNA synthetase  55.4 
 
 		 426 aa  474  1e-133  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.359075  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2419  seryl-tRNA synthetase  55.3 
 
 		 433 aa  475  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0778112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3466  seryl-tRNA synthetase  56.64 
 
 		 424 aa  476  1e-133  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344693 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2131  seryl-tRNA synthetase  53.97 
 
 		 428 aa  476  1e-133  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0131347  normal  0.0177706 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4000  seryl-tRNA synthetase  55.29 
 
 		 426 aa  472  1e-132  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.279963  hitchhiker  0.00302148 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03450  seryl-tRNA synthetase  55.29 
 
 		 427 aa  474  1e-132  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.375203 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3582  seryl-tRNA synthetase  54.23 
 
 		 426 aa  473  1e-132  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0780205  normal  0.476935 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2020  seryl-tRNA synthetase  53.04 
 
 		 428 aa  472  1e-132  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000521115  hitchhiker  0.00090554 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1129  seryl-tRNA synthetase  55.81 
 
 		 432 aa  472  1e-132  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.645427 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30330  seryl-tRNA synthetase  54.93 
 
 		 426 aa  472  1e-132  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.705305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3605  seryl-tRNA synthetase  55.76 
 
 		 426 aa  474  1e-132  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.837669 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2545  seryl-tRNA synthetase  53.43 
 
 		 428 aa  468  1.0000000000000001e-131  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1229  seryl-tRNA synthetase  55.22 
 
 		 427 aa  468  1.0000000000000001e-131  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0500  seryl-tRNA synthetase  54.21 
 
 		 433 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0912435  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0940  seryl-tRNA synthetase  54.21 
 
 		 433 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.874713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1833  seryl-tRNA synthetase  55.06 
 
 		 426 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000844174 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0979  seryl-tRNA synthetase  54.21 
 
 		 433 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0851  seryl-tRNA synthetase  53.5 
 
 		 433 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.165217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2229  seryl-tRNA synthetase  53.04 
 
 		 428 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0252643  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2211  seryl-tRNA synthetase  52.8 
 
 		 428 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000908788  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2310  seryl-tRNA synthetase  53.5 
 
 		 428 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3345  seryl-tRNA synthetase  54.23 
 
 		 426 aa  464  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0468703  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3404  seryl-tRNA synthetase  55.06 
 
 		 426 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.25013 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3175  seryl-tRNA synthetase  54.46 
 
 		 426 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.499903  normal  0.106811 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0102  seryl-tRNA synthetase  54.29 
 
 		 424 aa  468  9.999999999999999e-131  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.133347  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4082  seryl-tRNA synthetase  53.92 
 
 		 433 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.159254  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2384  seryl-tRNA synthetase  53.76 
 
 		 426 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00617953 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2160  seryl-tRNA synthetase  53.5 
 
 		 428 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0336189  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2315  seryl-tRNA synthetase  55.32 
 
 		 425 aa  466  9.999999999999999e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00701941  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2319  seryl-tRNA synthetase  52.8 
 
 		 428 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000145216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1967  seryl-tRNA synthetase  53.5 
 
 		 428 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000578776  normal  0.974041 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2009  seryl-tRNA synthetase  53.5 
 
 		 428 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000634653  hitchhiker  0.000399612 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0839  seryl-tRNA synthetase  53.69 
 
 		 433 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118464  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2054  seryl-tRNA synthetase  53.5 
 
 		 428 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00569868  hitchhiker  0.000126187 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1971  seryl-tRNA synthetase  54.95 
 
 		 427 aa  462  1e-129  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.140828  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3038  seryl-tRNA synthetase  53.69 
 
 		 433 aa  462  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1986  seryl-tRNA synthetase  53.69 
 
 		 433 aa  462  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1565  seryl-tRNA synthetase  53.56 
 
 		 433 aa  462  1e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.382494  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2479  seryl-tRNA synthetase  53.27 
 
 		 428 aa  463  1e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00110643  hitchhiker  0.00000482447 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2007  seryl-tRNA synthetase  53.5 
 
 		 428 aa  464  1e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000156378  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>