More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0021 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU0021  quinolinate synthetase  100 
 
 
304 aa  623  1e-177  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0447928  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3544  quinolinate synthetase  86.84 
 
 
304 aa  545  1e-154  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  8.76339e-09  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0199  quinolinate synthetase  80.92 
 
 
304 aa  524  1e-148  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  1.96344e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3519  quinolinate synthetase  77.3 
 
 
304 aa  500  1e-140  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  1.25089e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3588  quinolinate synthetase  77.3 
 
 
304 aa  500  1e-140  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3573  quinolinate synthetase  75.83 
 
 
304 aa  472  1e-132  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3586  quinolinate synthetase  74.1 
 
 
305 aa  472  1e-132  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00023844  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1727  quinolinate synthetase  67.65 
 
 
306 aa  442  1e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.08382e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0092  quinolinate synthetase  64.47 
 
 
304 aa  414  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.871893  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00620  quinolinate synthetase complex, A subunit  57.53 
 
 
301 aa  368  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0614  quinolinate synthetase  58.42 
 
 
306 aa  367  1e-100  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.853545  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0163  quinolinate synthetase  57.86 
 
 
307 aa  356  2e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.274251  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2356  quinolinate synthetase A  56.86 
 
 
304 aa  355  4e-97  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000244014  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1865  quinolinate synthetase  56.81 
 
 
304 aa  345  6e-94  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.210788 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1338  quinolinate synthetase  56.15 
 
 
302 aa  339  3e-92  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.270834  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0754  quinolinate synthetase complex, A subunit  52.36 
 
 
298 aa  338  9e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1590  quinolinate synthetase  56.15 
 
 
302 aa  335  4e-91  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0424  quinolinate synthetase complex, A subunit  54.49 
 
 
324 aa  332  4e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0685168  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3480  quinolinate synthetase complex, A subunit  54.05 
 
 
304 aa  332  7e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1474  quinolinate synthetase complex, subunit A  55.48 
 
 
302 aa  331  9e-90  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  1.28992e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0379  quinolinate synthetase complex, A subunit  56.08 
 
 
298 aa  331  9e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.447962  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1680  quinolinate synthetase  55.85 
 
 
306 aa  329  4e-89  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.100379  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2119  quinolinate synthetase complex, A subunit  55.74 
 
 
302 aa  328  5e-89  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.825722  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1212  quinolinate synthetase complex, A subunit  52.32 
 
 
303 aa  326  3e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.416438  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1600  quinolinate synthetase complex, A subunit  51.33 
 
 
304 aa  325  6e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0001  quinolinate synthetase complex, A subunit  52.72 
 
 
306 aa  315  8e-85  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1874  quinolinate synthetase complex, A subunit  52 
 
 
307 aa  311  6e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0104  quinolinate synthetase  53.02 
 
 
303 aa  311  6e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0121  quinolinate synthetase complex, A subunit  51 
 
 
303 aa  307  1e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.65603  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0382  quinolinate synthetase  47.46 
 
 
301 aa  302  6e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0376  quinolinate synthetase  47.46 
 
 
301 aa  300  2e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1757  quinolinate synthetase complex, A subunit  51.32 
 
 
303 aa  298  7e-80  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.114115  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3413  quinolinate synthetase  49.84 
 
 
334 aa  296  3e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.235688  normal  0.127536 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1164  quinolinate synthetase  50.17 
 
 
331 aa  291  6e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2413  quinolinate synthetase complex, A subunit  46.1 
 
 
308 aa  291  1e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292138  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0013  quinolinate synthetase complex, A subunit  47.85 
 
 
332 aa  290  2e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0742  quinolinate synthetase complex, A subunit  45.21 
 
 
334 aa  288  8e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0225103 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4733  quinolinate synthetase complex, A subunit  44.95 
 
 
331 aa  286  3e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.975521  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3427  quinolinate synthetase  48.52 
 
 
334 aa  285  8e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3491  quinolinate synthetase  48.52 
 
 
334 aa  283  3e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3346  quinolinate synthetase  48.52 
 
 
334 aa  281  7e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.816323  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0943  quinolinate synthetase  46.58 
 
 
308 aa  279  4e-74  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00785381  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2446  quinolinate synthetase  44.92 
 
 
323 aa  278  7e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.750352 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1239  quinolinate synthetase complex subunit A  44.41 
 
 
318 aa  278  1e-73  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0314  quinolinate synthetase  45.42 
 
 
323 aa  276  3e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.104012 
 
 
-
 
NC_002950  PG1578  quinolinate synthetase  46.75 
 
 
308 aa  275  6e-73  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0015  quinolinate synthetase  45.72 
 
 
323 aa  274  1e-72  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0180835  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1772  quinolinate synthetase complex, A subunit  44.26 
 
 
323 aa  273  2e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  8.30693e-06  normal  0.199956 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15631  quinolinate synthetase  46.36 
 
 
333 aa  273  2e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.798596 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07931  quinolinate synthetase  43.71 
 
 
312 aa  271  8e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00907888 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0815  quinolinate synthetase  45.21 
 
 
325 aa  271  8e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.659444  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2202  quinolinate synthetase  46.96 
 
 
330 aa  271  8e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.189573  normal  0.759966 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1795  quinolinate synthetase complex, A subunit  45.28 
 
 
330 aa  271  9e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1456  quinolinate synthetase  46.51 
 
 
310 aa  271  1e-71  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.129815 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0787  quinolinate synthetase  45.21 
 
 
325 aa  271  1e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2150  quinolinate synthetase complex, A subunit  46.53 
 
 
311 aa  270  2e-71  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.484842  normal  0.0905755 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5129  quinolinate synthetase complex, A subunit  43.83 
 
 
329 aa  269  3e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.815133 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4715  quinolinate synthetase  46.38 
 
 
348 aa  269  4e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0705171  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0168  quinolinate synthetase complex, A subunit  47.96 
 
 
333 aa  269  4e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.243178  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2476  quinolinate synthetase complex, A subunit  49.67 
 
 
320 aa  268  8e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1991  quinolinate synthetase  44.52 
 
 
324 aa  267  1e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4593  quinolinate synthetase complex, A subunit  45.22 
 
 
346 aa  268  1e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0283  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0429  quinolinate synthetase  47.44 
 
 
323 aa  267  2e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1045  quinolinate synthetase  46.82 
 
 
323 aa  266  3e-70  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.350076  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0531  quinolinate synthetase  45.07 
 
 
308 aa  265  8e-70  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.119326  normal  0.153731 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5221  quinolinate synthetase complex, A subunit  45.57 
 
 
338 aa  265  9e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.590266  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0105  quinolinate synthetase  43 
 
 
322 aa  264  1e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1548  quinolinate synthetase complex, A subunit  44 
 
 
317 aa  263  2e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0575  quinolinate synthetase  43.38 
 
 
321 aa  263  3e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.426924 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5463  quinolinate synthetase complex, A subunit  47.64 
 
 
338 aa  262  5e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222387  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2644  quinolinate synthetase complex, A subunit  46.62 
 
 
347 aa  262  5e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.614387  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0714  quinolinate synthetase  43.33 
 
 
322 aa  262  7e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.889108  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2767  quinolinate synthetase complex, A subunit  46.28 
 
 
357 aa  261  1e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0866463  normal  0.426331 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2870  quinolinate synthetase complex, A subunit  46.62 
 
 
357 aa  261  1e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.725936  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4432  quinolinate synthetase  46.58 
 
 
350 aa  261  1e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.558643  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0535  quinolinate synthetase  42.95 
 
 
318 aa  260  2e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.159363  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0467  quinolinate synthetase  42.76 
 
 
329 aa  260  2e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2557  quinolinate synthetase  46.44 
 
 
324 aa  260  2e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.445713  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0922  quinolinate synthetase  46.15 
 
 
323 aa  259  3e-68  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.642254  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2907  quinolinate synthetase complex subunit A  43.19 
 
 
320 aa  259  3e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0575  quinolinate synthetase  44.27 
 
 
332 aa  259  4e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.120653  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0112  quinolinate synthetase  44.08 
 
 
328 aa  259  5e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0390837  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1800  quinolinate synthetase  43 
 
 
311 aa  258  8e-68  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1044  quinolinate synthetase  44.19 
 
 
310 aa  258  8e-68  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0487926  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07381  quinolinate synthetase  44.97 
 
 
328 aa  258  1e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0067481 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4055  quinolinate synthetase complex, A subunit  43.38 
 
 
310 aa  256  2e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3459  quinolinate synthetase complex, A subunit  47.71 
 
 
462 aa  256  3e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.590301  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07331  quinolinate synthetase  44.3 
 
 
304 aa  256  3e-67  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.269483  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0361  quinolinate synthetase complex, A subunit  44.82 
 
 
295 aa  255  5e-67  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4975  quinolinate synthetase complex, A subunit  43.23 
 
 
322 aa  255  7e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0089  quinolinate synthetase  42.38 
 
 
332 aa  254  1e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0678  quinolinate synthetase  42.76 
 
 
304 aa  253  2e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.657173  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1145  quinolinate synthetase  45.57 
 
 
326 aa  253  2e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0492282 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0821  quinolinate synthetase  41.58 
 
 
323 aa  252  6e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0646463  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1212  quinolinate synthetase complex, A subunit  47.92 
 
 
289 aa  251  9e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.835032 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3494  quinolinate synthetase complex, A subunit  44.37 
 
 
343 aa  251  9e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.499841  normal  0.252503 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1168  quinolinate synthetase  40.2 
 
 
319 aa  251  1e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.975309  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07511  quinolinate synthetase  42.42 
 
 
304 aa  251  1e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4591  quinolinate synthetase complex, A subunit  45.24 
 
 
333 aa  250  2e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.316858  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07311  quinolinate synthetase  43.29 
 
 
304 aa  250  2e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.708071  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>