More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_4149 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_4059  60 kDa inner membrane insertion protein  91.59 
 
 		 537 aa  928    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.082021  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4149  60 kDa inner membrane insertion protein  100 
 
 		 536 aa  1093    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4429  60 kDa inner membrane insertion protein  60.63 
 
 		 528 aa  669    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3466  hypothetical protein  53.17 
 
 		 531 aa  551  1e-155  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.562042  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3642  60 kDa inner membrane insertion protein  52.79 
 
 		 530 aa  534  1e-150  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0951488  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3623  60 kDa inner membrane insertion protein  50.91 
 
 		 542 aa  534  1e-150  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3561  protein translocase subunit yidC  53.45 
 
 		 536 aa  530  1e-149  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3143  inner-membrane protein  41.5 
 
 		 542 aa  430  1e-119  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000171877  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2139  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  40.73 
 
 		 550 aa  381  1e-104  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2394  protein translocase subunit yidC  40.48 
 
 		 536 aa  372  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000698908  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3757  protein translocase subunit yidC  38.19 
 
 		 556 aa  366  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.189784 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1917  60 kDa inner membrane insertion protein  41.26 
 
 		 534 aa  368  1e-100  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0379054  normal  0.178209 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0888  60 kDa inner membrane insertion protein  40.59 
 
 		 539 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00675947 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3157  60 kDa inner membrane insertion protein  39.81 
 
 		 534 aa  355  2e-96  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.199862  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1967  YidC translocase/secretase  37.41 
 
 		 548 aa  335  1e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.537012  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2331  60 kDa inner membrane insertion protein  38.72 
 
 		 552 aa  335  1e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2597  60 kDa inner membrane insertion protein  35.69 
 
 		 553 aa  331  2e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.953083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2882  protein translocase subunit yidC  36.45 
 
 		 562 aa  330  3e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.208936  normal  0.460711 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0102  60 kDa inner membrane insertion protein  40.37 
 
 		 559 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2758  protein translocase subunit yidC  36.18 
 
 		 552 aa  324  2e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.174551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3098  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.3 
 
 		 550 aa  324  3e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000113724 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3099  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.4 
 
 		 554 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.462896  normal  0.0227553 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3235  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.03 
 
 		 557 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.627922  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3215  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.4 
 
 		 554 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15042  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4201  protein translocase subunit yidC  36.29 
 
 		 547 aa  319  6e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.017626 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0093  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.37 
 
 		 558 aa  317  4e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0107  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.37 
 
 		 558 aa  317  4e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0304  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.37 
 
 		 558 aa  317  4e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3895  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.36 
 
 		 567 aa  316  6e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.676329  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2844  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.37 
 
 		 558 aa  316  7e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.110043  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3397  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.37 
 
 		 558 aa  316  7e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3550  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.37 
 
 		 558 aa  316  7e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2241  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.37 
 
 		 558 aa  316  7e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3181  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.85 
 
 		 553 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.118061 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2549  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.51 
 
 		 552 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3163  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.51 
 
 		 552 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.133827  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3154  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.98 
 
 		 553 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000638548 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3986  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.61 
 
 		 552 aa  313  6.999999999999999e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3339  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.22 
 
 		 595 aa  313  6.999999999999999e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.978164  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4466  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.23 
 
 		 552 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.111062 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6520  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.45 
 
 		 555 aa  311  1e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2514  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.15 
 
 		 541 aa  311  2e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130871  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5612  inner membrane protein, 60 kDa  37.91 
 
 		 562 aa  311  2e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1230  60 kDa inner membrane insertion protein  35.06 
 
 		 550 aa  311  2e-83  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0120976  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5134  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.94 
 
 		 563 aa  310  4e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5743  putative inner membrane protein translocase component YidC  36 
 
 		 560 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00528765  normal  0.582095 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4014  protein translocase subunit yidC  33.51 
 
 		 557 aa  308  1.0000000000000001e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.308779 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0079  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.14 
 
 		 597 aa  307  3e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5213  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.19 
 
 		 560 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5309  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.24 
 
 		 560 aa  306  8.000000000000001e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.910149  normal  0.0868042 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0006  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.24 
 
 		 560 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000387778 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5444  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.23 
 
 		 560 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3087  60 kDa inner membrane insertion protein  34.62 
 
 		 545 aa  303  4.0000000000000003e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.863197  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.2 
 
 		 553 aa  302  1e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9905  normal  0.344368 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4485  60 kDa inner membrane insertion protein  33.91 
 
 		 551 aa  302  1e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00386094  hitchhiker  0.00000000260158 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4257  60 kDa inner membrane insertion protein  34.72 
 
 		 545 aa  301  2e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000606394  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00436  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.76 
 
 		 540 aa  301  2e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002016  OxaI/YidC membrane insertion protein  36.35 
 
 		 540 aa  300  5e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000829805  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3074  hypothetical protein  34.42 
 
 		 556 aa  299  9e-80  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1023  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.84 
 
 		 610 aa  299  1e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0964  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.84 
 
 		 610 aa  298  1e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0004  inner membrane protein, 60 kDa  35.7 
 
 		 541 aa  298  2e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3458  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.63 
 
 		 554 aa  298  2e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2930  hypothetical protein  33.33 
 
 		 556 aa  297  3e-79  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0003  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.23 
 
 		 541 aa  297  3e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0110357  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52450  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.77 
 
 		 557 aa  297  4e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3757  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.63 
 
 		 554 aa  296  5e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6369  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.92 
 
 		 578 aa  295  1e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4063  60 kDa inner membrane insertion protein  33.7 
 
 		 542 aa  293  4e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000239208  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3940  protein translocase subunit yidC  35.69 
 
 		 541 aa  293  5e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000301662  unclonable  0.0000000000640431 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0028  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.62 
 
 		 545 aa  291  1e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.15409  normal  0.0935166 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3316  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.6 
 
 		 575 aa  292  1e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.783784  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0006  protein translocase subunit yidC  35.51 
 
 		 541 aa  291  1e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000101193  unclonable  0.0000000000873101 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2122  inner membrane protein oxaA  34.36 
 
 		 566 aa  291  2e-77  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4620  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.2 
 
 		 581 aa  291  2e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0201  60 kDa inner membrane protein  34.17 
 
 		 566 aa  291  2e-77  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3613  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.75 
 
 		 555 aa  291  2e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4032  protein translocase subunit yidC  35.51 
 
 		 541 aa  291  2e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000158142  hitchhiker  0.000218645 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5377  YidC translocase/secretase  33.22 
 
 		 605 aa  291  3e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137275  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73410  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.16 
 
 		 578 aa  290  4e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.431479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4113  60 kDa inner membrane insertion protein  33.53 
 
 		 569 aa  289  7e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.731862  normal  0.125371 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2197  60 kDa inner membrane insertion protein  36.13 
 
 		 551 aa  289  1e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.297594  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4002  60 kDa inner membrane insertion protein  34.55 
 
 		 541 aa  289  1e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000355464  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1831  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.39 
 
 		 518 aa  288  2e-76  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2776  60 kDa inner membrane insertion protein  34.36 
 
 		 569 aa  288  2e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.395944  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4176  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.81 
 
 		 548 aa  288  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4054  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.81 
 
 		 548 aa  287  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0899835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4126  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.75 
 
 		 548 aa  287  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.222064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4069  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.81 
 
 		 548 aa  287  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00340238  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4616  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.09 
 
 		 543 aa  286  4e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.159313  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4233  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.81 
 
 		 548 aa  287  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.11489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3611  60 kDa inner membrane insertion protein  35.16 
 
 		 566 aa  287  4e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3037  inner membrane protein, 60 kDa  35.52 
 
 		 545 aa  286  7e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4035  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.9 
 
 		 543 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.247258  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4380  60 kDa inner membrane insertion protein  35.51 
 
 		 541 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000064378  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4325  YidC translocase/secretase  35.51 
 
 		 541 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000679014  unclonable  0.00000000000486692 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4521  60 kDa inner membrane insertion protein  35.51 
 
 		 541 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000305334  hitchhiker  0.000938862 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4379  60 kDa inner membrane insertion protein  35.51 
 
 		 541 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000322788  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3866  60 kDa inner membrane insertion protein  33.7 
 
 		 542 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000155519  unclonable  0.00000398144 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4293  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.69 
 
 		 544 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.016276  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>