More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_4137 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_4047  Radical SAM domain protein  93.55 
 
 		 403 aa  795    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4137  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 430 aa  899    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0029  Radical SAM domain protein  30.21 
 
 		 452 aa  158  2e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2423  radical SAM family protein  27.6 
 
 		 473 aa  155  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000017109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1460  radical SAM domain-containing protein  26.09 
 
 		 461 aa  145  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000686349  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0623  Radical SAM domain protein  27.81 
 
 		 453 aa  144  2e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000646743  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1008  Radical SAM domain protein  28.25 
 
 		 460 aa  141  3e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1786  Radical SAM domain protein  27.02 
 
 		 489 aa  140  3.9999999999999997e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0257396  hitchhiker  0.00364528 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2473  radical SAM domain-containing protein  27.75 
 
 		 458 aa  139  7e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000751779  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4492  Radical SAM domain protein  27.68 
 
 		 460 aa  137  5e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.153991  normal  0.0565392 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0679  Radical SAM domain protein  25.85 
 
 		 462 aa  135  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1754  Radical SAM domain protein  27.3 
 
 		 447 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0305986  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4919  Radical SAM domain protein  25.06 
 
 		 476 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000220499  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0871  radical SAM domain-containing protein  25.96 
 
 		 489 aa  133  5e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.128121  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0069  Radical SAM domain protein  27.37 
 
 		 452 aa  133  6.999999999999999e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000122492  hitchhiker  0.00745391 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2974  radical SAM family protein  26.7 
 
 		 477 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2206  radical SAM domain-containing protein  27.49 
 
 		 456 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000327652  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0409  radical SAM domain-containing protein  27.01 
 
 		 439 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1704  radical SAM domain-containing protein  27.09 
 
 		 485 aa  131  3e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.347799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0534  Radical SAM domain protein  24.86 
 
 		 447 aa  127  3e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00011095  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3298  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 450 aa  126  6e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000268991  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0906  radical SAM family protein  25.74 
 
 		 450 aa  126  9e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000066146  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6677  radical SAM family protein  29.04 
 
 		 470 aa  125  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.444981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2372  Radical SAM domain protein  24.14 
 
 		 463 aa  123  7e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.545422  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3029  radical SAM family protein  26.67 
 
 		 484 aa  120  4.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0038885  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3461  radical SAM domain protein  26.27 
 
 		 476 aa  120  6e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.361209 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2476  radical SAM domain-containing protein  26.2 
 
 		 476 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.187942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2308  radical SAM domain-containing protein  26.55 
 
 		 476 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.195773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2944  radical SAM domain-containing protein  26.55 
 
 		 476 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.388692  normal  0.122709 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2198  radical SAM domain-containing protein  23.48 
 
 		 457 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1909  radical SAM domain-containing protein  23.48 
 
 		 450 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00558063  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0762  Radical SAM domain protein  28.02 
 
 		 476 aa  117  5e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.502838  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0946  Radical SAM domain protein  26.12 
 
 		 492 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.21013  normal  0.166002 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0945  Radical SAM domain protein  28.26 
 
 		 453 aa  113  7.000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00793831  normal  0.0982171 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0109  Radical SAM domain protein  27.78 
 
 		 465 aa  107  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0328  Radical SAM domain protein  24.64 
 
 		 468 aa  97.4  5e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2981  Radical SAM domain protein  25.76 
 
 		 477 aa  92.4  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0847138  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2677  radical SAM domain-containing protein  25.71 
 
 		 464 aa  92  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.773927  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1133  Radical SAM domain protein  25.42 
 
 		 453 aa  90.1  6e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.318737 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1520  radical SAM domain-containing protein  24.44 
 
 		 351 aa  90.1  7e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1246  radical SAM family protein  29.1 
 
 		 432 aa  89.4  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0936067  normal  0.0177716 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1961  radical SAM domain-containing protein  26.55 
 
 		 440 aa  87.8  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2425  radical SAM domain-containing protein  27.09 
 
 		 434 aa  86.7  8e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.200383  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1962  radical SAM domain-containing protein  26.69 
 
 		 436 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1741  Radical SAM domain protein  20.92 
 
 		 728 aa  84  0.000000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0185422  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1446  radical SAM domain-containing protein  27.88 
 
 		 443 aa  79.7  0.00000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1364  radical SAM domain-containing protein  22.44 
 
 		 460 aa  79.7  0.00000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.458082  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0669  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 450 aa  78.6  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0393374  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2031  radical SAM family protein  24.63 
 
 		 481 aa  77  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0093  radical SAM domain-containing protein  25.69 
 
 		 356 aa  76.3  0.000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.488444  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2395  Radical SAM domain protein  23.42 
 
 		 394 aa  75.9  0.000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0433  radical SAM domain-containing protein  29.05 
 
 		 365 aa  75.9  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.293902  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0105  radical SAM domain-containing protein  24.69 
 
 		 290 aa  75.9  0.000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.287918  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2600  Radical SAM domain protein  28.74 
 
 		 486 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1561  radical SAM domain-containing protein  24.13 
 
 		 455 aa  75.1  0.000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1605  radical SAM domain-containing protein  22.19 
 
 		 415 aa  73.6  0.000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0350  radical SAM domain-containing protein  27.81 
 
 		 372 aa  73.6  0.000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.763056  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2734  radical SAM family protein  25.51 
 
 		 446 aa  73.2  0.000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0668  radical SAM domain-containing protein  23.04 
 
 		 449 aa  73.2  0.000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.204384  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2438  Radical SAM domain protein  22.55 
 
 		 447 aa  72.4  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1457  radical SAM domain-containing protein  23.58 
 
 		 442 aa  72.8  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1502  radical SAM domain-containing protein  23.58 
 
 		 442 aa  72.8  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0399675  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2722  Radical SAM domain protein  23.58 
 
 		 487 aa  72.4  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0383  radical SAM domain-containing protein  25.61 
 
 		 380 aa  72.8  0.00000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000167403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2370  Radical SAM domain protein  22.28 
 
 		 462 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1828  Radical SAM domain protein  32.64 
 
 		 445 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00146977 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0616  anaerobic sulfatase-maturase  23.08 
 
 		 370 aa  72  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.512735  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1340  radical SAM domain-containing protein  22.93 
 
 		 467 aa  70.9  0.00000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.768611  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1560  radical SAM family protein  27.08 
 
 		 388 aa  70.9  0.00000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.101502  normal  0.842747 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2880  radical SAM family protein  25.67 
 
 		 383 aa  70.5  0.00000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0341  Radical SAM domain protein  28.11 
 
 		 358 aa  70.5  0.00000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000860608  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1353  radical SAM domain-containing protein  30.38 
 
 		 429 aa  70.9  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.973606  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1058  radical SAM domain-containing protein  24.13 
 
 		 455 aa  70.5  0.00000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3007  Radical SAM domain protein  28.24 
 
 		 431 aa  70.9  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.486348 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1479  Radical SAM domain protein  30.15 
 
 		 414 aa  70.5  0.00000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4275  Radical SAM domain protein  22.22 
 
 		 474 aa  70.1  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0262219  normal  0.0188195 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3364  radical SAM domain-containing protein  23.65 
 
 		 484 aa  70.5  0.00000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.155713  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2359  radical SAM domain-containing protein  22.25 
 
 		 450 aa  70.1  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.288415  hitchhiker  0.00183234 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2391  Radical SAM domain protein  31.25 
 
 		 446 aa  70.1  0.00000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000244115  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0349  radical SAM domain-containing protein  23.18 
 
 		 427 aa  69.3  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3080  arylsulfatase regulator  24.23 
 
 		 438 aa  69.3  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.482835  normal  0.0699226 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0479  radical SAM domain-containing protein  23.97 
 
 		 471 aa  69.7  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0678  radical SAM domain-containing protein  32.72 
 
 		 464 aa  69.3  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.628302  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0575  Radical SAM domain protein  30 
 
 		 434 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1837  Radical SAM domain protein  27.74 
 
 		 518 aa  69.3  0.0000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.654863  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0515  radical SAM domain-containing protein  23.87 
 
 		 400 aa  69.3  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000107878  hitchhiker  0.000774187 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  26.67 
 
 		 480 aa  68.9  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1357  radical SAM domain-containing protein  30.38 
 
 		 298 aa  68.6  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.241565  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0349  hypothetical protein  24.4 
 
 		 367 aa  68.2  0.0000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.267481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2101  Radical SAM domain protein  29.86 
 
 		 369 aa  68.2  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  24.86 
 
 		 384 aa  67.8  0.0000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2456  radical SAM domain-containing protein  23.88 
 
 		 470 aa  67.8  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0417  radical SAM family protein  24.93 
 
 		 457 aa  67  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0042  radical SAM family protein  21.1 
 
 		 452 aa  67  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.467834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1098  arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase)-like protein  26.99 
 
 		 275 aa  67  0.0000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.852177  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2197  radical SAM domain-containing protein  25.47 
 
 		 368 aa  67  0.0000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0685  radical SAM domain-containing protein  23.5 
 
 		 499 aa  66.2  0.0000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00827758 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0045  Radical SAM domain protein  22.32 
 
 		 374 aa  65.9  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.120726  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1372  radical SAM domain-containing protein  27.46 
 
 		 356 aa  65.5  0.000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.618298 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  23.97 
 
 		 565 aa  64.7  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>