More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_4084 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_3991  GAF sensor signal transduction histidine kinase  90.93 
 
 
441 aa  811    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4084  GAF sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
441 aa  912    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2118  GAF sensor signal transduction histidine kinase  46.57 
 
 
751 aa  320  3e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4378  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.26 
 
 
773 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2100  GAF sensor signal transduction histidine kinase  43.4 
 
 
751 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0262959 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2956  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.01 
 
 
780 aa  307  3e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.900663 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1396  multi-sensor signal transduction histidine kinase  53.21 
 
 
741 aa  296  5e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.540787  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2121  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  55.73 
 
 
1171 aa  292  7e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.48946  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2097  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  55.29 
 
 
1171 aa  290  3e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000135263 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0549  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  54.05 
 
 
712 aa  290  3e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.338238 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2025  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  56.05 
 
 
452 aa  288  2e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0535  multi-sensor signal transduction histidine kinase  51.64 
 
 
554 aa  287  2.9999999999999996e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2194  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  55.65 
 
 
452 aa  286  4e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.514859 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3572  multi-sensor signal transduction histidine kinase  55.56 
 
 
1341 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1218  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  50.18 
 
 
933 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.493639  hitchhiker  0.0000319453 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0423  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.1 
 
 
839 aa  279  9e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2778  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  50.97 
 
 
756 aa  271  2e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2423  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.52 
 
 
360 aa  265  1e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2945  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.46 
 
 
514 aa  260  4e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4041  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.63 
 
 
619 aa  258  1e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2534  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  44.64 
 
 
458 aa  256  7e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4132  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.96 
 
 
619 aa  256  7e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1594  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.74 
 
 
780 aa  253  6e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.111266  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3595  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  48.35 
 
 
408 aa  251  1e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000201785  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2590  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.01 
 
 
701 aa  251  1e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000562313  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1991  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.97 
 
 
1255 aa  249  5e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2537  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.13 
 
 
675 aa  249  6e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0595  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.28 
 
 
473 aa  243  5e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0465  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.49 
 
 
469 aa  229  1e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.814022  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3242  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.07 
 
 
441 aa  224  2e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1118  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.61 
 
 
452 aa  224  2e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000972917  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1018  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.05 
 
 
441 aa  224  3e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00729938  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0779  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.72 
 
 
434 aa  223  4e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.48 
 
 
666 aa  223  6e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0107  ATP-binding region ATPase domain protein  41.88 
 
 
540 aa  219  5e-56  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3165  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  41.03 
 
 
1306 aa  210  5e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0533  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.22 
 
 
660 aa  208  1e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.291882  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0449  ATP-binding region ATPase domain protein  41.41 
 
 
532 aa  207  4e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000148075  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0365  ATP-binding region ATPase domain protein  37.33 
 
 
553 aa  206  5e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000920812  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3536  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.22 
 
 
635 aa  206  9e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1546  hypothetical protein  40.68 
 
 
552 aa  204  3e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.148139  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1040  Signal transduction histidine kinase regulating C4-dicarboxylate transport system-like protein  39.48 
 
 
696 aa  203  4e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0290  two component sensor histidine kinase  41.94 
 
 
689 aa  201  9.999999999999999e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0894  ATP-binding region ATPase domain protein  37.25 
 
 
411 aa  199  7.999999999999999e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0168283  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2942  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.92 
 
 
930 aa  196  9e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.346474  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1921  PAS sensor protein  37 
 
 
407 aa  196  9e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1804  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.15 
 
 
592 aa  192  8e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0687  ATP-binding region ATPase domain protein  38.26 
 
 
813 aa  191  2e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0704  ATP-binding region ATPase domain protein  41.67 
 
 
471 aa  190  4e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00112286  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1876  ATP-binding region ATPase domain protein  38.17 
 
 
572 aa  190  5e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1233  PAS sensor protein  36.65 
 
 
394 aa  189  5.999999999999999e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1881  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.8 
 
 
475 aa  189  8e-47  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0900  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.57 
 
 
409 aa  189  1e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1753  sensor histidine kinase  53.67 
 
 
364 aa  186  5e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.405521 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0376  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.45 
 
 
412 aa  180  4e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.439809  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2080  ATP-binding region ATPase domain protein  37.55 
 
 
542 aa  180  4.999999999999999e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0451  anti-sigma-factor antagonist  47.51 
 
 
312 aa  180  5.999999999999999e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0985  histidine kinase  34.85 
 
 
394 aa  177  4e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0966  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.06 
 
 
556 aa  176  9.999999999999999e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2371  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50.58 
 
 
1171 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.516834  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1243  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.52 
 
 
403 aa  173  5e-42  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1363  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.4 
 
 
404 aa  171  3e-41  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2138  PAS sensor protein  38.03 
 
 
516 aa  168  2e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1854  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.63 
 
 
579 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.46631 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0986  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.41 
 
 
487 aa  167  5e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0744  ATP-binding region ATPase domain protein  35.98 
 
 
616 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2005  ATP-binding region ATPase domain protein  35.04 
 
 
617 aa  164  3e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.144674  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0036  histidine kinase  33.82 
 
 
856 aa  164  3e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.772406  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0826  histidine kinase  32.73 
 
 
529 aa  163  7e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1179  ATP-binding region ATPase domain protein  35.15 
 
 
740 aa  160  3e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0721  hypothetical protein  38.12 
 
 
246 aa  161  3e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0783179  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1990  histidine kinase  35.55 
 
 
508 aa  159  8e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.586982  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0463  histidine kinase  34.29 
 
 
465 aa  155  1e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000902576  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0979  histidine kinase  33.33 
 
 
687 aa  154  2e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1273  PAS sensor protein  32 
 
 
728 aa  152  1e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0891  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.51 
 
 
371 aa  149  7e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0839  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.18 
 
 
881 aa  141  3e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3590  putative GAF sensor protein  46.05 
 
 
231 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.443077 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3658  putative GAF sensor protein  46.05 
 
 
231 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.565782  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2895  GAF sensor signal transduction histidine kinase  49.62 
 
 
539 aa  138  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.939958  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3585  putative GAF sensor protein  46.05 
 
 
231 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.555714  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4347  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  42.59 
 
 
576 aa  135  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0230944  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0982  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.44 
 
 
377 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.537061  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2267  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.28 
 
 
403 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0108452  hitchhiker  0.000000348318 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1870  hypothetical protein  35.93 
 
 
475 aa  133  6e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3513  diguanylate cyclase with GAF sensor  40.85 
 
 
326 aa  132  9e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.668666  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3158  diguanylate cyclase  40.24 
 
 
325 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0640866 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0849  putative two component sensor kinase  32.74 
 
 
667 aa  131  2.0000000000000002e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1379  histidine kinase  33.74 
 
 
579 aa  130  6e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.138084  normal  0.0193369 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4113  diguanylate cyclase  41.77 
 
 
349 aa  129  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0357706 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0568  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.19 
 
 
503 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1665  sensory box sensor histidine kinase, putative  35.29 
 
 
403 aa  128  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3060  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  27.65 
 
 
442 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08061  hypothetical protein  25.65 
 
 
406 aa  128  2.0000000000000002e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2310  sensor histidine kinase/GAF domain-containing protein  28.57 
 
 
400 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4833  sensory box histidine kinase  33.06 
 
 
899 aa  127  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1484  sensory box sensor histidine kinase, putative  34.84 
 
 
403 aa  128  3e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5263  putative GAF sensor protein  41.88 
 
 
238 aa  127  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.338508 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1493  putative GAF sensor protein  44.14 
 
 
233 aa  127  3e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0582  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.48 
 
 
587 aa  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>