More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_4042 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_4042  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  100 
 
 		 257 aa  525  1e-148  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3957  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  98.05 
 
 		 257 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000240615  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4256  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  80.16 
 
 		 257 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000382453  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3413  chromosome segregation ATPase  74.71 
 
 		 257 aa  394  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0106  soj protein  72.37 
 
 		 257 aa  389  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3177  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  68.63 
 
 		 257 aa  355  5e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0583  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  66.15 
 
 		 257 aa  347  1e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3139  partition protein, Par-like  60.4 
 
 		 254 aa  324  9e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4491  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  58.75 
 
 		 259 aa  320  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4510  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  58.75 
 
 		 259 aa  320  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4355  chromosome segregation ATPase  58.37 
 
 		 275 aa  319  1.9999999999999998e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.901478  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4502  cobyrinic acid ac-diamide synthase  59.14 
 
 		 314 aa  317  1e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.497857 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3425  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  60.32 
 
 		 253 aa  317  1e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3553  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  59.92 
 
 		 253 aa  316  2e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23520  chromosome segregation ATPase  59.44 
 
 		 249 aa  315  5e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.502901  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2926  chromosome segregation ATPase  59.29 
 
 		 253 aa  311  4.999999999999999e-84  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5631  sporulation initiation inhibitor protein Soj  59.2 
 
 		 253 aa  309  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5328  sporulation initiation inhibitor protein Soj  59.2 
 
 		 253 aa  309  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000106044 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5333  sporulation initiation inhibitor protein Soj  59.2 
 
 		 253 aa  309  2.9999999999999997e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5161  sporulation initiation inhibitor  59.2 
 
 		 253 aa  309  2.9999999999999997e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5177  sporulation initiation inhibitor  59.2 
 
 		 253 aa  309  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5607  sporulation initiation inhibitor protein Soj  59.2 
 
 		 253 aa  309  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.907427  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5730  sporulation initiation inhibitor protein Soj  59.2 
 
 		 253 aa  309  2.9999999999999997e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5667  sporulation initiation inhibitor protein Soj  59.2 
 
 		 253 aa  309  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3321  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  58.5 
 
 		 253 aa  309  2.9999999999999997e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2568  sporulation initiation inhibitor protein  57.14 
 
 		 260 aa  309  2.9999999999999997e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0143069  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5590  sporulation initiation inhibitor protein Soj  59.2 
 
 		 253 aa  309  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000114742 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4362  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  56.13 
 
 		 253 aa  305  5.0000000000000004e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1156  ParA family chromosome partitioning ATPase  53.12 
 
 		 256 aa  304  7e-82  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.523363  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0928  chromosome segregation ATPase  53.36 
 
 		 255 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5273  cobyrinic acid ac-diamide synthase  58 
 
 		 253 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4020  cobyrinic acid ac-diamide synthase  57.6 
 
 		 253 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2516  chromosome segregation ATPase  57.6 
 
 		 253 aa  303  2.0000000000000002e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00725558  hitchhiker  0.00179458 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  57.77 
 
 		 255 aa  303  2.0000000000000002e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2377  chromosome segregation ATPase  56.8 
 
 		 258 aa  300  2e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0452  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  56.8 
 
 		 295 aa  297  1e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.402264  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0307  hypothetical protein  53.73 
 
 		 262 aa  296  2e-79  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.285877 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0007  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  55.2 
 
 		 257 aa  296  2e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4954  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  58.33 
 
 		 253 aa  296  2e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024691  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3532  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.37 
 
 		 267 aa  295  7e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.440443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2560  chromosome segregation ATPase  53.57 
 
 		 258 aa  293  2e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00888291  normal  0.241678 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2146  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.37 
 
 		 254 aa  291  8e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3935  cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.36 
 
 		 284 aa  290  2e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000549335  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1631  cobyrinic acid ac-diamide synthase  57.71 
 
 		 263 aa  290  2e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.423414  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2753  chromosome segregation ATPase  53.39 
 
 		 262 aa  290  2e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00357509  normal  0.629486 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0861  cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.34 
 
 		 262 aa  290  2e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0206  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.17 
 
 		 262 aa  290  2e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0134114  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2519  ParA family protein  52.96 
 
 		 257 aa  289  3e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000399076  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2230  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  54.94 
 
 		 254 aa  288  7e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3083  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  54.72 
 
 		 264 aa  287  1e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0561465  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3627  chromosome segregation ATPase  52.99 
 
 		 276 aa  286  2e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.583516  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2878  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  55.25 
 
 		 277 aa  286  2e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.504433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2031  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  55.42 
 
 		 253 aa  286  2.9999999999999996e-76  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.491233  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0106  chromosome segregation ATPase  54.09 
 
 		 256 aa  286  2.9999999999999996e-76  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00135842  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00431  chromosome partitioning ATPase  52.17 
 
 		 257 aa  285  4e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3040  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  55.73 
 
 		 262 aa  285  5e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0037  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  54.15 
 
 		 262 aa  285  5.999999999999999e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002021  ParA family protein  51.78 
 
 		 257 aa  285  5.999999999999999e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000141399  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0288  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  52.14 
 
 		 284 aa  284  9e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.949249 
 
 
-
 
NC_004310  BR2059  chromosome partitioning protein ParA  51.56 
 
 		 265 aa  283  1.0000000000000001e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1979  chromosome partitioning protein ParA  51.56 
 
 		 265 aa  283  1.0000000000000001e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3739  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  52.96 
 
 		 257 aa  283  1.0000000000000001e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.512562  normal  0.176077 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3884  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  54.51 
 
 		 264 aa  283  2.0000000000000002e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0503158  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1723  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.57 
 
 		 256 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0031  chromosome segregation ATPase  53.12 
 
 		 259 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3469  chromosome segregation ATPase  53.54 
 
 		 264 aa  283  3.0000000000000004e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4054  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  52.78 
 
 		 262 aa  282  3.0000000000000004e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0142  SpoOJ regulator protein  50.58 
 
 		 258 aa  282  4.0000000000000003e-75  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1742  chromosome partitioning ATPase  53.31 
 
 		 257 aa  282  5.000000000000001e-75  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000936624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3928  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.38 
 
 		 264 aa  280  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.436902  normal  0.478463 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4254  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.78 
 
 		 264 aa  280  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.645482 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3355  chromosome segregation ATPase  51.59 
 
 		 268 aa  280  2e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4010  chromosome segregation ATPase  51.78 
 
 		 266 aa  280  2e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0588061 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3761  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  52.78 
 
 		 261 aa  280  2e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.242844  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2047  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.17 
 
 		 262 aa  280  2e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3314  chromosome segregation ATPase  53.75 
 
 		 264 aa  279  3e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0881849  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4907  cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.95 
 
 		 263 aa  279  3e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000134549  normal  0.16741 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2087  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.78 
 
 		 265 aa  279  3e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4249  cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.78 
 
 		 262 aa  279  3e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.261107  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0013  chromosome partitioning protein ParA  52.36 
 
 		 265 aa  278  4e-74  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0075806  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3504  chromosome segregation ATPase  51.19 
 
 		 257 aa  278  4e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.25082 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2031  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.41 
 
 		 273 aa  278  6e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.488481 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1566  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.73 
 
 		 256 aa  278  6e-74  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3318  sporulation initiation inhibitor protein Soj  52.38 
 
 		 256 aa  278  7e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1363  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  49.6 
 
 		 266 aa  278  7e-74  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2439  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  51.76 
 
 		 264 aa  278  8e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0305586  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3117  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.8 
 
 		 294 aa  278  8e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.746498  hitchhiker  0.000000304833 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0103  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  51.36 
 
 		 286 aa  278  9e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14150  chromosome segregation ATPase  54 
 
 		 294 aa  278  9e-74  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4386  chromosome partitioning protein  51.98 
 
 		 264 aa  277  1e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2988  sporulation initiation inhibitor protein soj  52.17 
 
 		 257 aa  277  1e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2666  sporulation initiation inhibitor protein soj  52.17 
 
 		 257 aa  277  1e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3202  cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.19 
 
 		 264 aa  277  1e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3965  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  51.98 
 
 		 262 aa  277  1e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.168488  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4495  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50.78 
 
 		 262 aa  277  1e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0475444  hitchhiker  0.00000632397 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4105  chromosome segregation ATPase  50.79 
 
 		 253 aa  276  2e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000593766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0095  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  51.36 
 
 		 289 aa  276  2e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0663654 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0002  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.76 
 
 		 270 aa  276  2e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0294  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.14 
 
 		 284 aa  276  2e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.163786  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02930  chromosome partitioning protein  52.53 
 
 		 265 aa  276  2e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.7551  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>