More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_4041 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_4041  parB-like partition protein  100 
 
 		 279 aa  556  1e-157  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111922 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3956  parB-like partition protein  98.57 
 
 		 279 aa  549  1e-155  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4257  parB-like partition protein  74.38 
 
 		 278 aa  419  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000997018  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3412  chromosome segregation DNA-binding protein  69.31 
 
 		 279 aa  390  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0107  ParB-like nuclease domain-containing protein  69.66 
 
 		 269 aa  375  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3176  parB-like partition protein  61.84 
 
 		 282 aa  334  7.999999999999999e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0584  parB-like partition proteins  59.86 
 
 		 284 aa  329  3e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.654355  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3138  partition protein ParB-like  53.55 
 
 		 284 aa  297  2e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2987  stage 0 sporulation protein J  47.78 
 
 		 286 aa  251  9.000000000000001e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.157313  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2665  stage 0 sporulation protein J  47.78 
 
 		 286 aa  251  9.000000000000001e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1632  parB-like partition protein  45.26 
 
 		 305 aa  246  4e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.526467  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4490  parB-like partition protein  47.59 
 
 		 298 aa  246  4e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4509  parB-like partition protein  47.59 
 
 		 298 aa  245  4.9999999999999997e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4354  chromosome segregation DNA-binding protein  47.59 
 
 		 298 aa  245  6e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364626  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2378  chromosome segregation DNA-binding protein  48.15 
 
 		 289 aa  244  9.999999999999999e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4501  parB-like partition protein  46.34 
 
 		 298 aa  242  5e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.125529 
 
 
-
 
NC_002950  PG0141  spoOJ protein  46.62 
 
 		 289 aa  238  1e-61  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.665328 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0008  parB-like partition protein  44.13 
 
 		 281 aa  235  6e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2515  chromosome segregation DNA-binding protein  48.06 
 
 		 294 aa  233  3e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411108  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4590  parB-like partition protein  46.69 
 
 		 306 aa  233  3e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.740178  normal  0.297176 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2606  parB-like partition proteins  46.81 
 
 		 285 aa  232  4.0000000000000004e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4808  parB-like partition protein  43.26 
 
 		 322 aa  231  9e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3934  parB-like partition protein  44.93 
 
 		 295 aa  231  1e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0273178  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3049  parB-like partition protein  50.54 
 
 		 272 aa  228  9e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.622521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2940  parB-like partition protein  44.57 
 
 		 282 aa  227  2e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4361  parB-like partition protein  43.52 
 
 		 305 aa  226  4e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2045  parB-like partition protein  42.24 
 
 		 310 aa  224  9e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2403  parB-like partition protein  42.81 
 
 		 286 aa  223  2e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2567  transcriptional regulator  43.73 
 
 		 280 aa  219  3.9999999999999997e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.183752  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2868  chromosome segregation DNA-binding protein  43.1 
 
 		 299 aa  219  5e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.108879  normal  0.100087 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0168  chromosome segregation DNA-binding protein  44.33 
 
 		 298 aa  218  7e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3320  parB-like partition protein  41.5 
 
 		 302 aa  218  1e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  42.16 
 
 		 323 aa  215  5e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3424  parB-like partition protein  41.49 
 
 		 285 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0287  parB-like partition proteins  43.86 
 
 		 293 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.68713 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3209  chromosome segregation DNA-binding protein  42.96 
 
 		 288 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0293  parB-like partition protein  43.45 
 
 		 296 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145749  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0007  parB-like partition proteins  43.6 
 
 		 292 aa  213  1.9999999999999998e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0209  parB-like partition protein  41.39 
 
 		 272 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0195  chromosome partitioning protein  43.01 
 
 		 290 aa  213  3.9999999999999995e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0388  parB-like partition proteins  43.75 
 
 		 296 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.450209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2128  ParB-like partition protein  43.01 
 
 		 288 aa  212  3.9999999999999995e-54  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0433  parB-like partition proteins  44.79 
 
 		 296 aa  212  7e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0203  chromosome segregation DNA-binding protein  42 
 
 		 301 aa  211  2e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.435492 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1362  parB-like partition protein  41.64 
 
 		 286 aa  210  2e-53  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0501  parB-like partition protein  44 
 
 		 282 aa  210  3e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0029  chromosome segregation DNA-binding protein  40.27 
 
 		 305 aa  209  5e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3468  chromosome segregation DNA-binding protein  42.5 
 
 		 288 aa  209  5e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23510  parB-like partition protein  51.15 
 
 		 287 aa  209  5e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.107848  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3652  ParB family protein  45.14 
 
 		 292 aa  209  5e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0209333  unclonable  0.00000847343 
 
 
-
 
NC_002978  WD1218  ParB family protein  41.45 
 
 		 283 aa  208  7e-53  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3552  parB-like partition protein  41.2 
 
 		 289 aa  208  7e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2591  parB-like partition protein  42.61 
 
 		 294 aa  208  9e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.107076 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4385  chromosome partitioning protein  42.71 
 
 		 292 aa  207  1e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3193  parB-like partition protein  46.01 
 
 		 274 aa  207  1e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0094  ParB-like partition protein  42.66 
 
 		 293 aa  207  2e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0639944 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04091  ParB family protein  46.18 
 
 		 292 aa  207  2e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00869743  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2333  parB-like protein partition proteins  47 
 
 		 281 aa  206  2e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.99663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39730  chromosome segregation DNA-binding protein  38.56 
 
 		 328 aa  207  2e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0606  ParB family protein  43.24 
 
 		 297 aa  206  3e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2086  parB-like partition protein  42.81 
 
 		 292 aa  205  8e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3883  parB-like partition protein  44.56 
 
 		 295 aa  205  8e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0441095  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0035  parB-like partition proteins  43.21 
 
 		 304 aa  204  9e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4248  parB-like partition protein  44.33 
 
 		 294 aa  204  9e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00203372  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0001  ParB family chromosome partitioning protein  40 
 
 		 281 aa  204  9e-52  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.642229  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28480  ParB-like partition protein  45.06 
 
 		 422 aa  204  9e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.327957  hitchhiker  0.00126502 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3458  chromosome partitioning protein parB  41.61 
 
 		 299 aa  204  1e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0015  parB-like partition protein  43.15 
 
 		 304 aa  204  1e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0146438  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0001  parB-like partition protein  45.26 
 
 		 290 aa  203  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184934 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5303  parB-like partition protein  45.26 
 
 		 290 aa  203  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157969  normal  0.0415765 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7092  parB-like partition protein  42.37 
 
 		 331 aa  204  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290774  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4470  parB-like partition protein  45.89 
 
 		 294 aa  203  2e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000450981  hitchhiker  0.00000000228393 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3313  ParB-like partition protein  43.77 
 
 		 286 aa  203  3e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.267567  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5208  parB-like partition protein  44.6 
 
 		 290 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0347  chromosome segregation DNA-binding protein  38.98 
 
 		 299 aa  202  3e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2154  chromosome segregation DNA-binding protein  39.8 
 
 		 321 aa  203  3e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2595  parB-like partition protein  43.48 
 
 		 280 aa  202  4e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0581078  normal  0.0919239 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4494  ParB family protein  44.52 
 
 		 294 aa  202  5e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00131449  hitchhiker  0.00000708734 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0929  chromosome segregation DNA-binding protein  41.41 
 
 		 283 aa  202  5e-51  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3082  ParB-like partition protein  44.6 
 
 		 291 aa  202  7e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0110147  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0014  chromosome partitioning protein ParB  39.04 
 
 		 303 aa  201  8e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.110445  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2058  chromosome partitioning protein ParB  42.46 
 
 		 293 aa  201  9e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1978  chromosome partitioning protein ParB  42.46 
 
 		 293 aa  201  9e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5272  parB-like partition protein  40.14 
 
 		 283 aa  201  9e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5439  parB-like partition protein  43.97 
 
 		 290 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5666  stage 0 sporulation protein J  40.79 
 
 		 283 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3116  parB-like partition protein  44.14 
 
 		 282 aa  201  9.999999999999999e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.469679  hitchhiker  0.0000000669867 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5630  stage 0 sporulation protein J  40.43 
 
 		 283 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5589  stage 0 sporulation protein J  40.43 
 
 		 283 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000816094 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5176  stage 0 sporulation protein J  40.43 
 
 		 283 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1837  parB-like partition protein  43.81 
 
 		 305 aa  200  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0869216  normal  0.672881 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4019  parB-like partition protein  40.5 
 
 		 283 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0102  parB-like partition proteins  41.61 
 
 		 294 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0115  chromosome segregation DNA-binding protein  39.06 
 
 		 295 aa  201  1.9999999999999998e-50  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002022  chromosome (plasmid) partitioning protein ParB/stage 0 sporulation protein J  40.34 
 
 		 293 aa  200  1.9999999999999998e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000100798  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0862  parB-like partition protein  41.4 
 
 		 293 aa  200  3e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3760  parB-like partition proteins  42.52 
 
 		 294 aa  200  3e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0200998  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1407  parB-like partition protein  40.26 
 
 		 297 aa  199  3e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.238658 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4303  parB-like partition proteins  43.9 
 
 		 290 aa  199  3e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.279457  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00430  chromosome partitioning protein  40.69 
 
 		 293 aa  199  3e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>