27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3916 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3916  flagellar hook-length control protein  100 
 
 		 656 aa  1268    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.108844 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3832  flagellar hook-length control protein  72.09 
 
 		 660 aa  746    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4207  flagellar hook-length control protein  45.45 
 
 		 604 aa  164  6e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0416  hypothetical protein  39.02 
 
 		 479 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3106  flagellar hook-length control protein  39.73 
 
 		 479 aa  126  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3432  flagellar hook-length control protein  36.41 
 
 		 570 aa  105  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3298  flagellar hook-length control protein  31.49 
 
 		 602 aa  76.3  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1186  putative flagellar hook-length control protein  27.78 
 
 		 580 aa  55.1  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3952  flagellar hook-length control protein  25.13 
 
 		 395 aa  52.8  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.253491  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0059  flagellar hook-length control protein  28 
 
 		 390 aa  52  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0575  flagellar hook-length control protein  28 
 
 		 552 aa  51.2  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0855  flagellar hook-length control protein-like protein  28.03 
 
 		 723 aa  50.1  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1329  flagellar hook-length control protein  30.97 
 
 		 495 aa  50.1  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214505  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04953  flagellar hook-length control protein  33.72 
 
 		 351 aa  50.1  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0053  hypothetical protein  26 
 
 		 383 aa  50.4  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1117  flagellar hook-length control protein  33.33 
 
 		 407 aa  49.3  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3635  flagellar hook-length control protein  36.76 
 
 		 438 aa  49.7  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.225852  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0189  flagellar hook-length control protein  33.33 
 
 		 352 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.511537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3572  flagellar hook-length control protein  32.39 
 
 		 367 aa  47.8  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.949278 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001169  flagellar hook-length control protein FliK  30.3 
 
 		 357 aa  47  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.272814  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3451  flagellar hook-length control protein  24.39 
 
 		 393 aa  47  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3583  flagellar hook-length control protein  30.49 
 
 		 334 aa  45.4  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1187  flagellar hook-length control protein  28.42 
 
 		 512 aa  44.3  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03156  hypothetical protein  31.21 
 
 		 686 aa  44.3  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2580  flagellar hook-length control protein  28.95 
 
 		 431 aa  43.9  0.009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.549964  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5119  flagellar hook-length control protein  34.83 
 
 		 446 aa  43.9  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0145364 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0438  flagellar hook-length control protein  30.36 
 
 		 504 aa  43.9  0.01  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00196038  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>