More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3824 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3741  TPR repeat-containing protein  93.49 
 
 		 1106 aa  2031    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3824  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 1106 aa  2214    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138221 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3825  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  47.3 
 
 		 589 aa  480  1e-134  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0624707 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3742  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  46.04 
 
 		 589 aa  469  9.999999999999999e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  46.37 
 
 		 585 aa  432  1e-119  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3369  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.69 
 
 		 667 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0774784  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0461  TPR repeat-containing protein  40.97 
 
 		 627 aa  405  1e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.999909  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  36.39 
 
 		 968 aa  403  1e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3331  TPR repeat-containing protein  42.91 
 
 		 633 aa  389  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.332967  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2809  TPR repeat-containing protein  41.22 
 
 		 717 aa  378  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  34.33 
 
 		 708 aa  376  1e-102  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3037  TPR repeat-containing protein  41.04 
 
 		 717 aa  370  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2093  TPR repeat-containing protein  36.62 
 
 		 1714 aa  358  1.9999999999999998e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3854  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  44.89 
 
 		 723 aa  358  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  35.78 
 
 		 713 aa  350  7e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  36.36 
 
 		 789 aa  348  3e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  39.19 
 
 		 708 aa  346  1e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2855  hypothetical protein  38.36 
 
 		 937 aa  346  1e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  36.22 
 
 		 718 aa  345  2.9999999999999997e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  36.61 
 
 		 732 aa  340  9.999999999999999e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1509  TPR domain-containing protein  37.64 
 
 		 699 aa  339  1.9999999999999998e-91  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000367862  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  37.93 
 
 		 754 aa  333  8e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2996  TPR repeat-containing protein  37.52 
 
 		 626 aa  330  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.637966  normal  0.0209641 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3099  TPR domain-containing protein  36.25 
 
 		 776 aa  327  6e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1668  TPR domain-containing protein  36.25 
 
 		 776 aa  327  6e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.329119  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3451  TPR domain-containing protein  36.25 
 
 		 776 aa  327  6e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0799942  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  36.29 
 
 		 828 aa  327  7e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  37.56 
 
 		 754 aa  327  8.000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3873  TPR repeat-containing protein  36.08 
 
 		 776 aa  327  8.000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.661818  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0094  TPR domain-containing protein  36.08 
 
 		 821 aa  327  9e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.822931  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3955  TPR repeat-containing protein  36.08 
 
 		 776 aa  327  1e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2876  TPR domain-containing protein  36.25 
 
 		 821 aa  327  1e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  31.13 
 
 		 909 aa  325  2e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0100  TPR domain-containing protein  37.75 
 
 		 790 aa  326  2e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  31.29 
 
 		 750 aa  325  3e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3835  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.5 
 
 		 790 aa  325  3e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.304839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5619  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  34.56 
 
 		 739 aa  323  8e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.474452 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3338  TPR repeat-containing protein  38.5 
 
 		 595 aa  322  1.9999999999999998e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0863  TPR repeat-containing protein  34.13 
 
 		 647 aa  322  1.9999999999999998e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399235 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  34.42 
 
 		 828 aa  323  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  36.52 
 
 		 824 aa  322  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  34.38 
 
 		 715 aa  322  3e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  34.27 
 
 		 828 aa  321  3.9999999999999996e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2822  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  42.49 
 
 		 529 aa  316  1.9999999999999998e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1802  TPR repeat-containing protein  35.75 
 
 		 822 aa  312  2e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.984059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0148  TPR repeat-containing protein  36.98 
 
 		 619 aa  309  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0164  TPR repeat-containing protein  34.05 
 
 		 833 aa  308  3e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  33.65 
 
 		 833 aa  306  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27710  glycosyl transferase,TPR repeat protein  33.76 
 
 		 1221 aa  303  1e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0161  TPR repeat-containing protein  34.54 
 
 		 598 aa  301  4e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  30.4 
 
 		 816 aa  299  2e-79  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3269  TPR repeat-containing protein  36.22 
 
 		 693 aa  298  3e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.306934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5618  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  33.44 
 
 		 739 aa  298  4e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.645263 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5617  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  34.09 
 
 		 739 aa  298  5e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.277247 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3065  TPR repeat-containing protein  33.11 
 
 		 734 aa  298  5e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0065343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2869  tetratricopeptide TPR_2  35.15 
 
 		 780 aa  298  6e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0238  TPR repeat-containing protein  35.15 
 
 		 780 aa  298  6e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  29.55 
 
 		 739 aa  296  2e-78  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5235  hypothetical protein  36.22 
 
 		 797 aa  295  4e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.050699  normal  0.568835 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0785  TPR repeat-containing protein  33.55 
 
 		 796 aa  294  6e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.225465  hitchhiker  0.00421983 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3210  TPR domain-containing protein  34.02 
 
 		 781 aa  294  6e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0293  TPR repeat-containing protein  33.55 
 
 		 789 aa  293  1e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0220  TPR repeat-containing protein  34.2 
 
 		 779 aa  290  9e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.991207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3533  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  34.7 
 
 		 742 aa  289  2e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2520  methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 1116 aa  289  2e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  30.74 
 
 		 1094 aa  286  2.0000000000000002e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  38.98 
 
 		 667 aa  285  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  34.62 
 
 		 700 aa  278  4e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2569  Methyltransferase type 11  32.23 
 
 		 1143 aa  277  8e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  30.21 
 
 		 4489 aa  277  9e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3368  Tetratricopeptide domain protein  35.8 
 
 		 596 aa  272  2.9999999999999997e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1986  sulfotransferase  31.89 
 
 		 1415 aa  270  2e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.634546  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  33.5 
 
 		 1085 aa  268  5.999999999999999e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  31.55 
 
 		 3560 aa  266  1e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0051  TPR repeat-containing protein  40.35 
 
 		 633 aa  266  2e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00284913  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1582  Methyltransferase type 12  33.2 
 
 		 1144 aa  263  1e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6522  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  33.03 
 
 		 740 aa  262  2e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.722582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  29.85 
 
 		 3035 aa  258  5e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0605  tetratricopeptide domain-containing protein  33.08 
 
 		 553 aa  257  1.0000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.335277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4399  TPR repeat-containing protein  37.44 
 
 		 727 aa  250  1e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.516213 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2139  TPR repeat-containing protein  34.96 
 
 		 654 aa  250  1e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2639  tetratricopeptide TPR_2  35.46 
 
 		 552 aa  249  1e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0616  TPR repeat-containing protein  30.57 
 
 		 974 aa  249  2e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  29.16 
 
 		 761 aa  241  4e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3361  TPR repeat-containing protein  32.28 
 
 		 750 aa  240  9e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.311751 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0699  FkbM family methyltransferase  32.17 
 
 		 921 aa  236  2.0000000000000002e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25199 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1104  TPR repeat-containing protein  31.81 
 
 		 616 aa  234  9e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2288  TPR repeat-containing protein  31 
 
 		 740 aa  231  8e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0772  TPR repeat-containing protein  31.24 
 
 		 611 aa  228  4e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447572  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1162  hypothetical protein  36.84 
 
 		 633 aa  228  5.0000000000000005e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1874  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.27 
 
 		 793 aa  228  5.0000000000000005e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1202  TPR repeat-containing protein  23.39 
 
 		 632 aa  224  9e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  30.38 
 
 		 808 aa  223  9.999999999999999e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0451  TPR repeat-containing protein  33.09 
 
 		 574 aa  221  5e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.871153  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0489  TPR repeat-containing protein  30.22 
 
 		 618 aa  221  5e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0261011  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1160  hypothetical protein  37.91 
 
 		 630 aa  221  7e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.795058  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1161  hypothetical protein  37.63 
 
 		 637 aa  219  2e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.143311  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0103  TPR repeat-containing protein  37.23 
 
 		 733 aa  218  5.9999999999999996e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467133  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3428  tetratricopeptide TPR_2  32.16 
 
 		 560 aa  218  7e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0384278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3445  TPR repeat-containing protein  33.64 
 
 		 353 aa  216  1.9999999999999998e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>