More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3821 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
1739 aa  3606  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2932  glycosyl transferase group 1  50.56 
 
 
442 aa  362  3e-98  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3753  methyltransferase type 11  50.28 
 
 
2490 aa  362  4e-98  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3164  glycosyl transferase group 1  50 
 
 
442 aa  359  3e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2168  glycosyl transferase, group 1  49.3 
 
 
1770 aa  352  3e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.377633 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0349  glycosyl transferase, group 1  44.88 
 
 
1043 aa  343  2e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0126249  normal  0.0342304 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4068  group 1 glycosyl transferase  45.5 
 
 
501 aa  338  5e-91  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.736051  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  57.75 
 
 
2401 aa  315  5e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0128  glycosyl transferase family 2  50.57 
 
 
1077 aa  264  9e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  48.18 
 
 
703 aa  247  1e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  42.31 
 
 
1340 aa  234  8e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  44.94 
 
 
994 aa  234  1e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  42.05 
 
 
700 aa  225  7e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  43.03 
 
 
1106 aa  223  2e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4593  glycosyl transferase family 2  41.75 
 
 
1032 aa  223  3e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3218  glycosyl transferase family protein  39.83 
 
 
902 aa  194  1e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0552261  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00973  glycosyltransferase  39.58 
 
 
860 aa  192  5e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0115  glycosyl transferase family protein  39.34 
 
 
892 aa  179  4e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.411081  normal  0.6079 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2849  glycosyl transferase family protein  40.37 
 
 
824 aa  175  6e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0578  glycosyl transferase family protein  38.17 
 
 
525 aa  173  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0851  glycosyl transferase family protein  36.93 
 
 
1152 aa  159  6e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2348  glycosyl transferase  35.47 
 
 
1837 aa  157  1e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3336  glycosyl transferase family protein  38.6 
 
 
1268 aa  150  2e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0054  glycosyl transferase family 2  35.18 
 
 
557 aa  149  5e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2183  glycosyl transferase family protein  35.98 
 
 
995 aa  148  1e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.610183  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2737  glycosyl transferase family protein  39.91 
 
 
482 aa  147  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0308026  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0326  glycosyl transferase, group 1  35.4 
 
 
375 aa  146  4e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.221475  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3184  glycosyl transferase group 1  36.73 
 
 
337 aa  144  2e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.262966  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2593  glycosyl transferase group 1  35.9 
 
 
354 aa  143  3e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  34.18 
 
 
624 aa  142  5e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2999  glycosyl transferase family 2  35.32 
 
 
988 aa  142  7e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1485  glycosyl transferase, group 2 family protein  41.07 
 
 
427 aa  142  7e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0313881  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1948  glycosyl transferase family 2  34.68 
 
 
721 aa  140  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0315  glycosyl transferase family protein  34.2 
 
 
775 aa  139  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.177291 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  35.46 
 
 
1162 aa  137  2e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3374  glycosyl transferase family 2  29.04 
 
 
1435 aa  137  2e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  35.66 
 
 
1644 aa  136  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1250  glycosyl transferase WbyK, group 1 family protein  32.08 
 
 
337 aa  136  3e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  1.57678e-08  hitchhiker  1.31869e-13 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  35.77 
 
 
1644 aa  136  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0907  glycosyl transferase family protein  36.77 
 
 
415 aa  136  3e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00249013  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1213  glycosyl transferase family protein  37.75 
 
 
683 aa  136  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3042  glycosyl transferase WbyK, group 1 family protein  32.08 
 
 
337 aa  136  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2280  glycosyl transferase group 1  35.81 
 
 
367 aa  136  4e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00320483  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  33.2 
 
 
679 aa  135  5e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4203  glycosyl transferase family 2  32.83 
 
 
841 aa  135  6e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.138699 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2225  glycosyl transferase family 2  32.67 
 
 
717 aa  135  7e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.432582 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1887  glycosyl transferase family 2  33.58 
 
 
353 aa  135  8e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0754  glycosyl transferase family 2  35.09 
 
 
691 aa  135  9e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.235056 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6344  glycosyl transferase family 2  33.2 
 
 
822 aa  134  1e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0187449  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0791  glycosyl transferase family 2  36.45 
 
 
691 aa  134  2e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.62869  normal  0.0614605 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2513  glycosyl transferase, group 1  32.61 
 
 
377 aa  134  2e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.368438  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0831  glycosyl transferase family protein  38.86 
 
 
691 aa  133  3e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.74925  normal  0.236177 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0192  glycosyl transferase family protein  35.96 
 
 
996 aa  133  4e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1129  glycosyl transferase family 2  35.08 
 
 
785 aa  132  5e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  33.77 
 
 
294 aa  132  5e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4314  glycosyl transferase family protein  32.13 
 
 
401 aa  132  6e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1949  glycosyl transferase family protein  32.27 
 
 
717 aa  132  7e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.603088  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1840  glycosyl transferase family 2  32.27 
 
 
710 aa  132  7e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0202284  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0069  glycosyl transferase family 2  41.12 
 
 
302 aa  130  2e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.866174  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1401  glycosyl transferase family protein  30.08 
 
 
808 aa  130  2e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2365  glycosyl transferase family 2  32.65 
 
 
836 aa  130  3e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00674972 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0906  glycosyl transferase family 2  33.85 
 
 
1152 aa  129  7e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15980  Glycosyl transferase, family 2  35.9 
 
 
1182 aa  128  8e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.967945  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  32.99 
 
 
370 aa  128  9e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2719  glycosyl transferase family 2  31.2 
 
 
662 aa  128  1e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0690  glycosyl transferase, group 1  34.15 
 
 
394 aa  127  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1792  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.2 
 
 
809 aa  128  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0102114 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1576  glycosyl transferase family 2  32.81 
 
 
746 aa  127  1e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0509  glycosyl transferase family 2  34.98 
 
 
1075 aa  127  2e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.253023  normal  0.0268717 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0933  glycosyl transferase family 2  33.46 
 
 
1152 aa  127  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2836  glycosyl transferase family protein  33.74 
 
 
1759 aa  126  4e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0244809 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0767  glycosyl transferase family 2  30.95 
 
 
602 aa  126  4e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2921  glycosyl transferase family protein  30.83 
 
 
880 aa  126  4e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  35.16 
 
 
318 aa  125  5e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0620  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.5 
 
 
610 aa  125  5e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0729  glycosyl transferase family protein  29.44 
 
 
586 aa  125  6e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.155064  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0114  glycosyl transferase family 2  36.68 
 
 
410 aa  125  9e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3489  glycosyl transferase family protein  34.39 
 
 
635 aa  125  9e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.0475235 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2408  glycosyl transferase family 2  32.92 
 
 
1334 aa  124  1e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3142  glycosyl transferase family 2  34.53 
 
 
430 aa  125  1e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1729  glycosyl transferase family protein  32 
 
 
728 aa  123  2e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.95068 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3223  glycosyl transferase family protein  32.85 
 
 
729 aa  123  4e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  32.62 
 
 
1486 aa  122  5e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  30.64 
 
 
370 aa  122  5e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0777  glycosyl transferase family 2  31.71 
 
 
280 aa  122  7e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0773  glycosyl transferase family protein  29.27 
 
 
369 aa  121  1e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  33.46 
 
 
298 aa  121  1e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  32.51 
 
 
299 aa  121  1e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2745  glycosyl transferase family protein  32.93 
 
 
1267 aa  121  1e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.636531  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1503  glycosyl transferase family 2  29.06 
 
 
733 aa  120  2e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4407  glycosyl transferase family protein  30.45 
 
 
1359 aa  120  2e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0775  glycosyl transferase family 2  31.91 
 
 
617 aa  121  2e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  30.48 
 
 
235 aa  120  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0929  glycosyl transferase family protein  30.8 
 
 
796 aa  120  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.283533 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3501  glycosyl transferase family 2  32.13 
 
 
310 aa  120  3e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.222757  normal  0.064344 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5204  group 1 glycosyl transferase  31.99 
 
 
364 aa  119  4e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  33.76 
 
 
303 aa  119  8e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0564  glycosyl transferase family 2  32.67 
 
 
670 aa  118  8e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.501276 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0562  glycosyl transferase family 2  30.42 
 
 
616 aa  118  9e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3434  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 
753 aa  117  2e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>