More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3815 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_3815  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
399 aa  811  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3719  TPR repeat-containing protein  82.84 
 
 
405 aa  651  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3329  TPR repeat-containing protein  38.81 
 
 
397 aa  262  6e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3352  TPR repeat-containing protein  40.84 
 
 
404 aa  250  2e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  2.20615e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  31.69 
 
 
820 aa  106  6e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  29.83 
 
 
847 aa  102  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3398  TPR repeat-containing protein  31.18 
 
 
274 aa  97.8  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0527752  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  31.63 
 
 
626 aa  97.4  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  29.95 
 
 
265 aa  96.7  7e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.26 
 
 
784 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.38 
 
 
818 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.93 
 
 
265 aa  94  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  3.26196e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  31.16 
 
 
649 aa  93.2  6e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.21 
 
 
988 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  31.09 
 
 
626 aa  91.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  31.09 
 
 
614 aa  91.7  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  24.69 
 
 
1737 aa  91.3  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  31.09 
 
 
614 aa  91.7  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  31.09 
 
 
614 aa  91.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  31.09 
 
 
614 aa  91.7  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  31.09 
 
 
626 aa  91.3  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  29.44 
 
 
265 aa  90.9  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  1.21078e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  27.64 
 
 
267 aa  90.9  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  1.43988e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  26.37 
 
 
392 aa  89.4  9e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.18 
 
 
2240 aa  89  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  33.53 
 
 
614 aa  89  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.25 
 
 
1056 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  27.59 
 
 
637 aa  87.4  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  31.46 
 
 
878 aa  87.4  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.02 
 
 
810 aa  87  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3333  TPR repeat-containing protein  29.03 
 
 
274 aa  87  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.34116  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1837  TPR repeat-containing protein  29.39 
 
 
344 aa  86.7  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.39 
 
 
344 aa  86.7  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  29.21 
 
 
612 aa  86.7  8e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  27.59 
 
 
615 aa  86.3  9e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  27.93 
 
 
635 aa  85.9  1e-15  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  29.21 
 
 
636 aa  86.3  1e-15  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  30.05 
 
 
448 aa  85.9  1e-15  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  26.59 
 
 
3145 aa  86.3  1e-15  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  27.93 
 
 
635 aa  85.9  1e-15  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  27.85 
 
 
611 aa  85.5  2e-15  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  31.08 
 
 
605 aa  84.7  3e-15  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  3.56395e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.91 
 
 
1022 aa  84.7  3e-15  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5110  TPR repeat-containing protein  30.06 
 
 
288 aa  84  4e-15  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163263  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  28.09 
 
 
639 aa  84  4e-15  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  28.1 
 
 
685 aa  84.3  4e-15  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  27.32 
 
 
620 aa  84  5e-15  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0424  TPR repeat-containing protein  34.36 
 
 
313 aa  83.2  8e-15  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.446862  normal  0.0100173 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1166  TPR domain-containing protein  28 
 
 
266 aa  82.8  9e-15  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.194624  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.49 
 
 
274 aa  82.8  9e-15  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0912  TPR repeat-containing protein  26.02 
 
 
748 aa  82.8  9e-15  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.795031  hitchhiker  0.00626987 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  27.84 
 
 
4079 aa  82.4  1e-14  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3414  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.96 
 
 
274 aa  82.4  1e-14  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.187348  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0689  TPR repeat-containing protein  27.75 
 
 
632 aa  81.6  2e-14  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  7.34837e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1429  PDZ/DHR/GLGF domain protein  31.01 
 
 
668 aa  82  2e-14  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  4.79067e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  25.96 
 
 
1421 aa  81.6  2e-14  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3213  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.06 
 
 
639 aa  81.3  3e-14  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  2.2774e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0446  TPR repeat-containing protein  26.2 
 
 
377 aa  81.3  3e-14  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.021695 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2414  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
589 aa  80.9  4e-14  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  29.18 
 
 
594 aa  80.5  4e-14  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  28.04 
 
 
340 aa  79.7  8e-14  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.11 
 
 
1056 aa  79.7  8e-14  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  28.87 
 
 
1979 aa  79.3  1e-13  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  26.23 
 
 
620 aa  79.3  1e-13  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3197  O-GlcNAc transferase, p110 subunit  30.72 
 
 
395 aa  79  1e-13  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.187148  normal  0.017581 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  29.57 
 
 
566 aa  79  1e-13  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  30.63 
 
 
542 aa  79.3  1e-13  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1078  TPR repeat-containing protein  26.94 
 
 
423 aa  79  1e-13  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.327406  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  25.48 
 
 
329 aa  79.3  1e-13  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1321  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
638 aa  79  2e-13  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.002861  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  24.31 
 
 
887 aa  78.6  2e-13  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2583  TPR repeat-containing protein  27.13 
 
 
729 aa  77.8  3e-13  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  26.01 
 
 
3301 aa  77.8  3e-13  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  26.29 
 
 
3172 aa  77.8  3e-13  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3697  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.48 
 
 
293 aa  77.4  4e-13  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.984045  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  23.81 
 
 
366 aa  77.4  4e-13  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  28.14 
 
 
681 aa  77.4  4e-13  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2135  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.32 
 
 
373 aa  77.4  4e-13  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204203  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  28.72 
 
 
762 aa  76.6  7e-13  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  27.11 
 
 
646 aa  76.6  7e-13  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0982  TPR domain-containing protein  29.02 
 
 
750 aa  76.3  9e-13  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.682285 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 
789 aa  76.3  9e-13  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1127  TPR domain-containing protein  30.97 
 
 
725 aa  75.9  1e-12  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  26.51 
 
 
649 aa  75.9  1e-12  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0823  TPR repeat-containing protein  30.67 
 
 
502 aa  75.9  1e-12  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  27.78 
 
 
816 aa  76.3  1e-12  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  26.51 
 
 
649 aa  75.9  1e-12  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  27.96 
 
 
795 aa  75.9  1e-12  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  28.04 
 
 
718 aa  75.1  2e-12  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3295  TPR repeat-containing protein  28.49 
 
 
311 aa  75.5  2e-12  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2606  tetratricopeptide TPR_2  25.64 
 
 
643 aa  75.5  2e-12  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 
2262 aa  75.5  2e-12  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0887  Tetratricopeptide domain protein  27.67 
 
 
1339 aa  75.1  2e-12  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.102317 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  27.39 
 
 
3560 aa  75.5  2e-12  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7517  hypothetical protein  27.23 
 
 
703 aa  74.7  2e-12  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328747  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2659  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.17 
 
 
565 aa  75.1  2e-12  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.144865 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  24.74 
 
 
561 aa  74.7  3e-12  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9475  predicted protein  29.45 
 
 
336 aa  74.7  3e-12  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2801  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 
291 aa  74.3  3e-12  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.462521  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.94 
 
 
689 aa  74.3  3e-12  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>