More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3804 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3709  peptide chain release factor 1  98.89 
 
 		 359 aa  727    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.231674  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3804  peptide chain release factor 1  100 
 
 		 359 aa  735    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0380  peptide chain release factor 1  80.34 
 
 		 355 aa  600  1.0000000000000001e-171  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.362441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1029  peptide chain release factor 1  80.06 
 
 		 355 aa  600  1e-170  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4061  peptide chain release factor 1  82.82 
 
 		 355 aa  594  1e-168  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.677357  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2647  peptide chain release factor 1  81.69 
 
 		 354 aa  588  1e-167  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00109947  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3104  peptide chain release factor 1  78.65 
 
 		 355 aa  579  1e-164  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2692  peptide chain release factor 1  70.25 
 
 		 356 aa  538  9.999999999999999e-153  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000179951  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0451  peptide chain release factor 1  61.52 
 
 		 357 aa  463  1e-129  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2466  peptide chain release factor 1  58.92 
 
 		 360 aa  454  1e-127  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000799175  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2176  peptide chain release factor 1  58.92 
 
 		 360 aa  454  1e-127  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000328118  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2360  peptide chain release factor 1  61.65 
 
 		 363 aa  451  1.0000000000000001e-126  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2083  peptide chain release factor 1  58.87 
 
 		 356 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00000000963425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3170  peptide chain release factor 1  60.89 
 
 		 356 aa  451  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000384415  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0389  peptide chain release factor 1  58.82 
 
 		 363 aa  450  1e-125  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.802059  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0472  peptide chain release factor 1  58.4 
 
 		 356 aa  451  1e-125  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257905  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0821  peptide chain release factor 1  57.63 
 
 		 357 aa  444  1.0000000000000001e-124  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.16719  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2493  peptide chain release factor 1  59.94 
 
 		 360 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2299  peptide chain release factor 1  60.17 
 
 		 356 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1060  peptide chain release factor 1  60.73 
 
 		 360 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1713  peptide chain release factor 1  59.09 
 
 		 355 aa  445  1.0000000000000001e-124  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0456393  normal  0.957916 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4833  peptide chain release factor 1  58.31 
 
 		 355 aa  444  1e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263816  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02573  peptide chain release factor 1  59.94 
 
 		 361 aa  439  9.999999999999999e-123  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0263327  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1444  peptide chain release factor 1  62.25 
 
 		 357 aa  437  1e-121  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1051  peptide chain release factor 1  60.11 
 
 		 360 aa  436  1e-121  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0598725  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2593  peptide chain release factor 1  61.66 
 
 		 360 aa  437  1e-121  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000361971  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4472  peptide chain release factor 1  56.9 
 
 		 359 aa  434  1e-121  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2791  peptide chain release factor 1  59.26 
 
 		 353 aa  437  1e-121  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4456  peptide chain release factor 1  59.04 
 
 		 360 aa  433  1e-120  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6577  peptide chain release factor 1  58.03 
 
 		 363 aa  434  1e-120  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.940895 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2397  peptide chain release factor 1  57.1 
 
 		 356 aa  433  1e-120  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.456174 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3522  peptide chain release factor 1  59.94 
 
 		 360 aa  432  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.217548  normal  0.148888 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2397  peptide chain release factor 1  57.95 
 
 		 355 aa  432  1e-120  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000706535  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3146  peptide chain release factor 1  59.38 
 
 		 360 aa  428  1e-119  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0205917 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0733  peptide chain release factor 1  58.47 
 
 		 360 aa  430  1e-119  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1424  peptide chain release factor 1  59.66 
 
 		 360 aa  430  1e-119  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.997988  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0949  peptide chain release factor 1  58.82 
 
 		 360 aa  429  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3044  peptide chain release factor 1  58.54 
 
 		 360 aa  431  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2064  peptide chain release factor 1  58.52 
 
 		 361 aa  429  1e-119  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.243868  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0255  peptide chain release factor 1  55.34 
 
 		 359 aa  429  1e-119  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.018292  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2721  peptide chain release factor 1  59.09 
 
 		 360 aa  429  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2474  peptide chain release factor 1  57.67 
 
 		 360 aa  429  1e-119  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0436  peptide chain release factor 1  59.38 
 
 		 360 aa  429  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0119  peptide chain release factor 1  58.52 
 
 		 361 aa  429  1e-119  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299484  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0761  peptide chain release factor 1  58.19 
 
 		 360 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.169079  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1109  peptide chain release factor 1  58.54 
 
 		 360 aa  427  1e-118  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2984  peptide chain release factor 1  60.45 
 
 		 357 aa  427  1e-118  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0774  peptide chain release factor 1  58.19 
 
 		 360 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1529  peptide chain release factor 1  58.96 
 
 		 361 aa  427  1e-118  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2337  peptide chain release factor 1  57.63 
 
 		 360 aa  427  1e-118  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3169  peptide chain release factor 1  58.99 
 
 		 363 aa  426  1e-118  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0178961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0797  peptide chain release factor 1  58.99 
 
 		 363 aa  426  1e-118  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0297796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1756  peptide chain release factor 1  57.34 
 
 		 362 aa  422  1e-117  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000801734  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2901  peptide chain release factor 1  57.98 
 
 		 360 aa  422  1e-117  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0801  peptide chain release factor 1  58.71 
 
 		 363 aa  424  1e-117  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00710906  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3833  peptide chain release factor 1  58.43 
 
 		 363 aa  421  1e-117  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2284  peptide chain release factor 1  56.03 
 
 		 362 aa  424  1e-117  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2257  peptide chain release factor 1  56.03 
 
 		 362 aa  424  1e-117  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3614  peptide chain release factor 1  58.5 
 
 		 363 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000815596  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2798  peptide chain release factor 1  58.47 
 
 		 360 aa  423  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4748  peptide chain release factor 1  58.54 
 
 		 360 aa  422  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.242955  normal  0.0645708 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0482  peptide chain release factor 1  58.82 
 
 		 360 aa  423  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.464905 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0696  peptide chain release factor 1  58.5 
 
 		 363 aa  421  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0264279  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2641  peptide chain release factor 1  58.26 
 
 		 358 aa  421  1e-117  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3546  peptide chain release factor 1  58.5 
 
 		 363 aa  421  1e-117  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00646422  hitchhiker  0.0000410243 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0769  peptide chain release factor 1  58.71 
 
 		 363 aa  423  1e-117  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.081149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2595  peptide chain release factor 1  58.82 
 
 		 360 aa  423  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.324585  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61700  peptide chain release factor 1  58.19 
 
 		 360 aa  424  1e-117  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0384277 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0510  peptide chain release factor 1  58.82 
 
 		 360 aa  423  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.206813  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0440  peptide chain release factor 1  58.52 
 
 		 360 aa  419  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.518401 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3737  peptide chain release factor 1  58.5 
 
 		 363 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0200456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2888  peptide chain release factor 1  59.38 
 
 		 360 aa  421  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.362694 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2154  peptide chain release factor 1  57.1 
 
 		 355 aa  419  1e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000509235  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1457  peptide chain release factor 1  56.37 
 
 		 364 aa  421  1e-116  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0262209  normal  0.168501 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3597  peptide chain release factor 1  58.81 
 
 		 360 aa  419  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2566  peptide chain release factor 1  57.58 
 
 		 363 aa  420  1e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0384672  normal  0.342733 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1071  peptide chain release factor 1  55.97 
 
 		 355 aa  420  1e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.471814  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2563  peptide chain release factor 1  56.55 
 
 		 362 aa  421  1e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.273749  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0950  peptide chain release factor 1  57.26 
 
 		 360 aa  420  1e-116  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.568062  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0414  peptide chain release factor 1  58.52 
 
 		 360 aa  419  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.592527  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1805  peptide chain release factor 1  59.66 
 
 		 355 aa  419  1e-116  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0117611  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2912  peptide chain release factor 1  56.7 
 
 		 361 aa  418  1e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0107492  normal  0.707414 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5314  peptide chain release factor 1  58.47 
 
 		 360 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5500  peptide chain release factor 1  54.96 
 
 		 358 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000210571  unclonable  8.0628e-26 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1725  peptide chain release factor 1  57.7 
 
 		 358 aa  417  9.999999999999999e-116  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00127994  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5456  peptide chain release factor 1  54.67 
 
 		 355 aa  414  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000128855  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3524  peptide chain release factor 1  60 
 
 		 359 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0303051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5572  peptide chain release factor 1  54.67 
 
 		 355 aa  414  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100734  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3685  peptide chain release factor 1  56.3 
 
 		 361 aa  414  9.999999999999999e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0369473  normal  0.712251 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01250  peptide chain release factor 1  55.46 
 
 		 362 aa  416  9.999999999999999e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0452  peptide chain release factor 1  54.83 
 
 		 362 aa  416  9.999999999999999e-116  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0740  peptide chain release factor 1  59.09 
 
 		 355 aa  414  9.999999999999999e-116  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.759458  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004203  peptide chain release factor 1  55.46 
 
 		 362 aa  416  9.999999999999999e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0254288  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0094  peptide chain release factor 1  59.26 
 
 		 356 aa  414  9.999999999999999e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.494548  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2930  peptide chain release factor 1  57.39 
 
 		 360 aa  413  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5452  peptide chain release factor 1  54.39 
 
 		 358 aa  413  1e-114  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000502201  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3251  peptide chain release factor 1  59.28 
 
 		 360 aa  412  1e-114  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.227833  normal  0.0955024 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3850  peptide chain release factor 1  55.24 
 
 		 355 aa  414  1e-114  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000369919  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1248  peptide chain release factor 1  55.07 
 
 		 362 aa  413  1e-114  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3645  peptide chain release factor 1  56.78 
 
 		 361 aa  413  1e-114  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304909  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>