More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3781 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3686  thioredoxin reductase  98.42 
 
 		 316 aa  650    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000489943  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3781  thioredoxin reductase  100 
 
 		 316 aa  657    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4032  thioredoxin reductase  82.59 
 
 		 316 aa  556  1e-157  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000634849  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0488  thioredoxin reductase  82.54 
 
 		 316 aa  550  1e-155  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.723059  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3070  thioredoxin reductase  82.48 
 
 		 316 aa  543  1e-153  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000407332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3350  thioredoxin reductase  76.43 
 
 		 318 aa  494  1e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000709992  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3328  thioredoxin reductase  73.5 
 
 		 318 aa  488  1e-137  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2006  thioredoxin reductase  73.46 
 
 		 317 aa  474  1e-133  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1694  thioredoxin-disulfide reductase  70.38 
 
 		 317 aa  462  1e-129  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0023  thioredoxin reductase  69.21 
 
 		 316 aa  461  1e-129  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.459849  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2389  thioredoxin reductase  70.83 
 
 		 316 aa  462  1e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0722352 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3225  thioredoxin reductase  69.87 
 
 		 319 aa  463  1e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00279715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0763  thioredoxin reductase  67.51 
 
 		 319 aa  457  9.999999999999999e-129  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1119  thioredoxin reductase  70.16 
 
 		 316 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.202817  normal  0.295957 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2959  thioredoxin reductase  71.43 
 
 		 317 aa  460  9.999999999999999e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.457436  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0248  thioredoxin reductase  69.11 
 
 		 319 aa  459  9.999999999999999e-129  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1344  thioredoxin-disulfide reductase  68.91 
 
 		 320 aa  455  1e-127  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1443  thioredoxin reductase  70.55 
 
 		 352 aa  456  1e-127  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1283  thioredoxin reductase  68.91 
 
 		 320 aa  455  1e-127  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1293  thioredoxin reductase  68.69 
 
 		 320 aa  453  1.0000000000000001e-126  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.429956 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30280  thioredoxin reductase 1  69.55 
 
 		 316 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2721  thioredoxin reductase  69.43 
 
 		 317 aa  449  1e-125  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.49521  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0619  thioredoxin reductase  67.52 
 
 		 342 aa  450  1e-125  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000125941  normal  0.227908 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3383  thioredoxin reductase  69.43 
 
 		 317 aa  449  1e-125  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.281365 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1560  thioredoxin-disulfide reductase  67.85 
 
 		 320 aa  448  1e-125  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.212237  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0684  thioredoxin reductase  67.19 
 
 		 317 aa  450  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00860267  normal  0.703249 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2591  thioredoxin reductase 1  69.23 
 
 		 316 aa  451  1e-125  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.542991  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2370  thioredoxin reductase  67.52 
 
 		 316 aa  450  1e-125  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274866  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02606  thioredoxin reductase  66.56 
 
 		 319 aa  449  1e-125  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1681  thioredoxin reductase  67.74 
 
 		 323 aa  447  1e-125  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.634211  normal  0.152153 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1769  thioredoxin reductase  67.63 
 
 		 317 aa  447  1e-125  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000446804  normal  0.0215764 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00892  thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)-binding  68.27 
 
 		 321 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2755  thioredoxin reductase  68.27 
 
 		 321 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000254011  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0992  thioredoxin reductase  68.27 
 
 		 321 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000016798  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0786  thioredoxin reductase  66.77 
 
 		 320 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.148183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0809  thioredoxin reductase  66.77 
 
 		 320 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00543895  normal  0.0268826 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1762  thioredoxin reductase  66.98 
 
 		 317 aa  444  1.0000000000000001e-124  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.422622  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1731  thioredoxin reductase  68.49 
 
 		 316 aa  446  1.0000000000000001e-124  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1731  thioredoxin reductase  68.81 
 
 		 316 aa  447  1.0000000000000001e-124  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2708  thioredoxin reductase  68.27 
 
 		 321 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000108143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0803  thioredoxin reductase  67.85 
 
 		 318 aa  445  1.0000000000000001e-124  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0345  thioredoxin reductase  69.84 
 
 		 319 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0962  thioredoxin reductase  68.27 
 
 		 321 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000099736  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1838  thioredoxin reductase  66.77 
 
 		 321 aa  444  1.0000000000000001e-124  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1050  thioredoxin reductase  68.27 
 
 		 321 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000235297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4408  thioredoxin reductase  66.77 
 
 		 320 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.460867  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00899  hypothetical protein  68.27 
 
 		 321 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2424  thioredoxin reductase  68.17 
 
 		 320 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0820  thioredoxin reductase  66.77 
 
 		 320 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2441  thioredoxin reductase  68.27 
 
 		 321 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000126981  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1753  thioredoxin reductase  68.59 
 
 		 317 aa  445  1.0000000000000001e-124  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2342  thioredoxin reductase oxidoreductase protein  68.05 
 
 		 318 aa  442  1e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.187147 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2123  thioredoxin-disulfide reductase  67.2 
 
 		 320 aa  443  1e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.165856  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0388  putative thioredoxin reductase  67.2 
 
 		 340 aa  443  1e-123  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.457738  normal  0.0960406 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0789  thioredoxin-disulfide reductase  67.2 
 
 		 320 aa  443  1e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.133485  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3078  thioredoxin-disulfide reductase  67.2 
 
 		 320 aa  443  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2289  thioredoxin reductase  68.17 
 
 		 320 aa  442  1e-123  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3045  thioredoxin-disulfide reductase  67.2 
 
 		 320 aa  443  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.403048  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1118  thioredoxin reductase  69.26 
 
 		 316 aa  443  1e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.203245 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2621  thioredoxin-disulfide reductase  67.2 
 
 		 320 aa  443  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.105399  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1991  thioredoxin-disulfide reductase  67.2 
 
 		 320 aa  443  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28230  thioredoxin-disulfide reductase  69.23 
 
 		 315 aa  442  1e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.75824  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0495  thioredoxin reductase  67.2 
 
 		 320 aa  442  1e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.287434  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2233  thioredoxin reductase  67.95 
 
 		 321 aa  443  1e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000186252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003744  thioredoxin reductase  65.61 
 
 		 319 aa  444  1e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.891826  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1959  thioredoxin reductase  65.08 
 
 		 317 aa  441  1e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000155114  normal  0.552411 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53290  thioredoxin reductase 2  66.45 
 
 		 316 aa  441  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.868588 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1758  thioredoxin reductase  67.63 
 
 		 326 aa  442  1e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.852508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2991  thioredoxin-disulfide reductase  67.2 
 
 		 320 aa  443  1e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.520991  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0974  thioredoxin reductase  67.2 
 
 		 320 aa  442  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0935  thioredoxin reductase  67.2 
 
 		 320 aa  442  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3427  thioredoxin reductase  68.15 
 
 		 319 aa  442  1e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.116946  normal  0.610265 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3213  thioredoxin reductase  68.93 
 
 		 314 aa  442  1e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.166551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01037  thioredoxin-disulfide reductase  66.34 
 
 		 322 aa  438  9.999999999999999e-123  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.088167  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2303  thioredoxin reductase  64.76 
 
 		 317 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1283  thioredoxin reductase  67.31 
 
 		 319 aa  439  9.999999999999999e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23421  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1001  thioredoxin reductase  65.71 
 
 		 345 aa  440  9.999999999999999e-123  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.24844  normal  0.15101 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2598  thioredoxin-disulfide reductase  67.2 
 
 		 320 aa  438  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000212052  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2687  thioredoxin reductase  67.2 
 
 		 320 aa  438  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.643501  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1360  thioredoxin reductase  66.13 
 
 		 332 aa  438  9.999999999999999e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5364  thioredoxin reductase  68.06 
 
 		 337 aa  439  9.999999999999999e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65514 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4077  thioredoxin reductase  66.88 
 
 		 346 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.880689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1611  thioredoxin reductase  67.2 
 
 		 320 aa  438  9.999999999999999e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000152855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0991  thioredoxin reductase  66.99 
 
 		 322 aa  439  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0860266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01640  thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)-binding protein  68.65 
 
 		 310 aa  438  9.999999999999999e-123  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00689976  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1982  thioredoxin reductase  66.56 
 
 		 328 aa  440  9.999999999999999e-123  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.343784  normal  0.438815 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1692  thioredoxin reductase 1  67.31 
 
 		 314 aa  440  9.999999999999999e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.160177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3801  thioredoxin reductase  67.73 
 
 		 328 aa  440  9.999999999999999e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0429  thioredoxin reductase  65.92 
 
 		 340 aa  438  9.999999999999999e-123  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.749384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0846  thioredoxin reductase  66.88 
 
 		 320 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2017  thioredoxin reductase  64.76 
 
 		 317 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000213161  normal  0.0579886 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1072  thioredoxin reductase  66.99 
 
 		 322 aa  439  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00976208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0834  thioredoxin reductase  66.88 
 
 		 346 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2047  thioredoxin reductase  64.76 
 
 		 317 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000827938  hitchhiker  0.00204856 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06129  thioredoxin-disulfide reductase  66.34 
 
 		 322 aa  438  9.999999999999999e-123  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.345376  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1412  thioredoxin reductase  66.99 
 
 		 322 aa  439  9.999999999999999e-123  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00718409  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1178  thioredoxin reductase  65.5 
 
 		 320 aa  434  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0887  thioredoxin reductase  65.61 
 
 		 320 aa  436  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1023  thioredoxin reductase  66.67 
 
 		 322 aa  437  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00170984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0963  thioredoxin reductase  66.67 
 
 		 322 aa  437  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000679645  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>