154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3743 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3743  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 		 98 aa  195  2.0000000000000003e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3786  DNA polymerase beta domain protein region  53.06 
 
 		 97 aa  91.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.123289  normal  0.700807 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0548  nucleotidyltransferase family protein  51.11 
 
 		 93 aa  88.2  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1803  DNA polymerase beta domain protein region  49.43 
 
 		 96 aa  85.5  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0949  DNA polymerase beta subunit  45.45 
 
 		 102 aa  83.6  9e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.878884  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0409  DNA polymerase beta subunit  50 
 
 		 96 aa  82  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0506  DNA polymerase beta subunit  46.81 
 
 		 96 aa  79.7  0.00000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0867  DNA polymerase beta domain protein region  44.68 
 
 		 96 aa  78.2  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0547  DNA polymerase beta subunit  44.68 
 
 		 100 aa  77.8  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.790238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2529  DNA polymerase beta subunit  43.56 
 
 		 104 aa  77.4  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0400211 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0296  DNA polymerase beta domain protein region  38.78 
 
 		 97 aa  77  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.499305 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1948  DNA polymerase beta domain protein region  41.84 
 
 		 96 aa  76.6  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.506279 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1959  DNA polymerase beta domain protein region  41.84 
 
 		 96 aa  76.6  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.332639 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1188  DNA polymerase beta domain protein region  47.83 
 
 		 113 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2532  DNA polymerase beta subunit  44.21 
 
 		 104 aa  75.9  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0127103 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1784  nucleotidyltransferase  42.71 
 
 		 97 aa  72.8  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3213  DNA polymerase beta domain protein region  40.82 
 
 		 96 aa  73.2  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3147  DNA polymerase beta domain protein region  42.7 
 
 		 96 aa  72  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.949814 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0088  DNA polymerase beta subunit  42.11 
 
 		 103 aa  72  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0340868 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3557  DNA polymerase beta subunit  40 
 
 		 254 aa  71.6  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0946906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0627  DNA polymerase beta subunit  43.43 
 
 		 101 aa  71.6  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0052  DNA polymerase beta subunit  43.43 
 
 		 101 aa  71.6  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0550488  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0900  DNA polymerase beta subunit  44.21 
 
 		 103 aa  71.2  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000013918 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0638  nucleotidyltransferase  48.31 
 
 		 101 aa  70.9  0.000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2757  nucleotidyltransferase family protein  37.93 
 
 		 102 aa  68.9  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0028  nucleotidyltransferase family protein  43.18 
 
 		 96 aa  69.3  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.422617  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3676  DNA polymerase beta domain protein region  40.21 
 
 		 132 aa  68.9  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.839378  normal  0.137366 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1075  DNA polymerase beta domain protein region  42.5 
 
 		 97 aa  69.3  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.796392  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1148  DNA polymerase beta subunit  41.49 
 
 		 115 aa  68.6  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0348  DNA polymerase beta subunit  46.07 
 
 		 94 aa  68.6  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0157  DNA polymerase beta domain protein region  44.19 
 
 		 109 aa  68.6  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1877  DNA polymerase beta domain protein region  38.3 
 
 		 96 aa  67.8  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1851  DNA polymerase beta domain protein region  38.3 
 
 		 96 aa  67.8  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3039  DNA polymerase beta domain protein region  38.95 
 
 		 99 aa  67  0.00000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0053  DNA polymerase beta subunit  38.89 
 
 		 102 aa  66.2  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0582464  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0626  DNA polymerase beta subunit  38.89 
 
 		 102 aa  66.2  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.717752  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1694  DNA polymerase beta subunit  41.05 
 
 		 97 aa  65.9  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.366424  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0369  DNA polymerase beta subunit  36.08 
 
 		 105 aa  65.9  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.832865  normal  0.194305 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1162  DNA polymerase beta subunit  44.58 
 
 		 100 aa  64.7  0.0000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0241  DNA polymerase beta subunit  37.89 
 
 		 99 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0444  nucleotidyltransferase  41.33 
 
 		 98 aa  63.5  0.0000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.190147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0929  DNA polymerase beta domain protein region  36.84 
 
 		 96 aa  63.2  0.000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.887181  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0686  DNA polymerase beta subunit  45.33 
 
 		 96 aa  62.8  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5818  DNA polymerase beta domain protein region  39.13 
 
 		 96 aa  62.8  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0548  DNA polymerase beta domain protein region  38.95 
 
 		 102 aa  62.4  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3031  DNA polymerase beta subunit  37.65 
 
 		 96 aa  61.2  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.424813  normal  0.471509 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1203  DNA polymerase beta domain protein region  40.43 
 
 		 102 aa  61.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4165  DNA polymerase beta subunit  39.6 
 
 		 109 aa  61.2  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0829  DNA polymerase beta subunit  34.83 
 
 		 98 aa  60.8  0.000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.141069  normal  0.412533 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3299  DNA polymerase beta domain protein region  38.46 
 
 		 96 aa  60.8  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000315403 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0943  DNA polymerase beta subunit  40.24 
 
 		 97 aa  60.5  0.000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.744259 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1295  DNA polymerase beta domain protein region  40.4 
 
 		 99 aa  60.5  0.000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.599396  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0015  hypothetical protein  38.14 
 
 		 95 aa  60.1  0.000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0871  DNA polymerase beta domain protein region  40.22 
 
 		 99 aa  59.3  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1762  nucleotidyltransferase family protein  38.37 
 
 		 97 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.324196 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1691  DNA polymerase beta domain protein region  43.75 
 
 		 101 aa  58.9  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0274  DNA polymerase beta subunit  38.46 
 
 		 96 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122937  unclonable  0.00000800451 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2017  DNA polymerase beta domain protein region  37.37 
 
 		 103 aa  58.5  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.538218  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1637  DNA polymerase beta subunit  43.9 
 
 		 106 aa  58.2  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2704  DNA polymerase beta domain-containing protein region  40.45 
 
 		 95 aa  58.2  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.272306 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0033  transcriptional regulator, XRE family  36.56 
 
 		 169 aa  57.8  0.00000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.400371  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0374  DNA polymerase beta subunit  40.48 
 
 		 108 aa  57.4  0.00000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.509035  normal  0.373075 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0844  DNA polymerase beta subunit  45.21 
 
 		 116 aa  57.4  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.909458  normal  0.0926269 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3203  DNA polymerase beta subunit  37.36 
 
 		 98 aa  56.2  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0845  DNA polymerase beta subunit  45.78 
 
 		 96 aa  56.2  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.406591  normal  0.358781 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0587  DNA polymerase, beta-like region  33.82 
 
 		 76 aa  55.5  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.204552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0886  hypothetical protein  43.21 
 
 		 129 aa  55.8  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0454668  hitchhiker  0.00000000702025 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3457  DNA polymerase beta subunit  36.26 
 
 		 98 aa  56.2  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0288007 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2462  DNA polymerase beta subunit  38.71 
 
 		 98 aa  56.2  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.266656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1320  DNA polymerase, beta-like region  32.61 
 
 		 106 aa  55.5  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1806  DNA polymerase beta domain protein region  37.14 
 
 		 104 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.943156  normal  0.843762 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2714  DNA polymerase, beta-like region  36.17 
 
 		 110 aa  54.7  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.505964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0703  DNA polymerase beta domain protein region  37.04 
 
 		 109 aa  54.7  0.0000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000025763  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0332  DNA polymerase beta domain protein region  37.23 
 
 		 94 aa  53.9  0.0000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4370  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1164  DNA polymerase beta subunit  41.18 
 
 		 113 aa  53.9  0.0000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2495  DNA polymerase beta domain protein region  37.17 
 
 		 113 aa  53.9  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1113  DNA polymerase beta subunit  40.58 
 
 		 109 aa  53.5  0.0000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1475  DNA polymerase beta domain protein region  43.59 
 
 		 129 aa  53.5  0.0000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.125283  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0862  DNA polymerase beta domain protein region  38.38 
 
 		 101 aa  53.5  0.0000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000634599  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0479  DNA polymerase, beta-like region  38.96 
 
 		 105 aa  53.5  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2072  DNA polymerase beta domain protein region  40.22 
 
 		 97 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0110003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1789  DNA polymerase beta domain protein region  34.74 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1207  DNA polymerase beta domain protein region  37.21 
 
 		 96 aa  52.8  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0357  DNA polymerase beta subunit  37.35 
 
 		 101 aa  52.4  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0316504 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1790  DNA polymerase beta domain protein region  34.48 
 
 		 114 aa  52  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0854  DNA polymerase beta subunit  35.9 
 
 		 96 aa  52  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1934  DNA polymerase beta domain protein region  41.03 
 
 		 104 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.739683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0142  nucleotidyltransferase  44.44 
 
 		 86 aa  51.2  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2366  DNA polymerase beta subunit  37.65 
 
 		 115 aa  51.2  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.878119  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3538  DNA polymerase beta subunit  41.98 
 
 		 98 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.114192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2493  DNA polymerase beta domain-containing protein region  43.75 
 
 		 96 aa  50.8  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2705  DNA polymerase, beta-like region  37.37 
 
 		 102 aa  50.8  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.569902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0273  DNA polymerase, beta-like region  35 
 
 		 98 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288603 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0152  DNA polymerase  34.38 
 
 		 100 aa  50.4  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2453  DNA polymerase beta subunit  36.36 
 
 		 100 aa  50.4  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00090311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3960  DNA polymerase beta subunit  38.67 
 
 		 104 aa  50.8  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.886641  normal  0.332553 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2036  DNA polymerase beta domain protein region  37.23 
 
 		 98 aa  49.7  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.18823  normal  0.524072 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3117  DNA polymerase beta subunit  30.23 
 
 		 110 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1036  DNA polymerase beta domain protein region  31.46 
 
 		 96 aa  49.7  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0795086  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>