More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3742 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_3742  ornithine carbamoyltransferase  100 
 
 
303 aa  634    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3637  ornithine carbamoyltransferase  98.35 
 
 
303 aa  624  1e-178  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0227  ornithine carbamoyltransferase  83.44 
 
 
305 aa  551  1e-156  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0152  ornithine carbamoyltransferase  75.58 
 
 
303 aa  498  1e-140  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0205  ornithine carbamoyltransferase  74.59 
 
 
303 aa  498  1e-140  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000336127 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3149  ornithine carbamoyltransferase  74.26 
 
 
303 aa  490  1e-137  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3172  ornithine carbamoyltransferase  69.54 
 
 
305 aa  460  9.999999999999999e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0370415  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2415  ornithine carbamoyltransferase  64.57 
 
 
302 aa  420  1e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0276  ornithine carbamoyltransferase  57.24 
 
 
315 aa  373  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2286  ornithine carbamoyltransferase  59.08 
 
 
314 aa  373  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.102156 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1869  ornithine carbamoyltransferase  56.15 
 
 
307 aa  374  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2465  ornithine carbamoyltransferase  57.33 
 
 
300 aa  365  1e-100  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2492  ornithine carbamoyltransferase  51.99 
 
 
305 aa  362  4e-99  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2287  ornithine carbamoyltransferase  56.44 
 
 
313 aa  360  1e-98  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.512601  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0343  ornithine carbamoyltransferase  54.13 
 
 
309 aa  360  2e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0062  ornithine carbamoyltransferase  53.47 
 
 
312 aa  358  8e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.366315 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3743  ornithine carbamoyltransferase  54.58 
 
 
321 aa  356  1.9999999999999998e-97  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000875067 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1227  ornithine carbamoyltransferase  55.45 
 
 
355 aa  354  1e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.786262  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0532  ornithine carbamoyltransferase  54.33 
 
 
302 aa  353  2e-96  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0521808  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0570  ornithine carbamoyltransferase  55.92 
 
 
320 aa  353  2e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0999  ornithine carbamoyltransferase  52.98 
 
 
309 aa  352  5e-96  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0647018  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2358  ornithine carbamoyltransferase  53.47 
 
 
303 aa  352  5e-96  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.186855 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0246  ornithine carbamoyltransferase  56.76 
 
 
298 aa  352  5.9999999999999994e-96  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0839  ornithine carbamoyltransferase  53.8 
 
 
303 aa  351  8e-96  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.40698 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0315  ornithine carbamoyltransferase  52.98 
 
 
305 aa  348  5e-95  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.624865  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3512  ornithine carbamoyltransferase  52.48 
 
 
302 aa  346  3e-94  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.661553 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0945  ornithine carbamoyltransferase  54.97 
 
 
304 aa  346  3e-94  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0836212  normal  0.0898024 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2915  ornithine carbamoyltransferase  53.95 
 
 
305 aa  346  3e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.595203  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1790  ornithine carbamoyltransferase  52.3 
 
 
309 aa  346  4e-94  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3389  ornithine carbamoyltransferase  55 
 
 
301 aa  345  5e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.345181  normal  0.187028 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0158  ornithine carbamoyltransferase  53.59 
 
 
306 aa  344  1e-93  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2685  ornithine carbamoyltransferase  53.77 
 
 
309 aa  341  8e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.570167  normal  0.0624155 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4527  ornithine carbamoyltransferase  54.15 
 
 
307 aa  340  1e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.145065 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1101  ornithine carbamoyltransferase  53.16 
 
 
303 aa  340  2e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0794  ornithine carbamoyltransferase  53.18 
 
 
313 aa  339  2.9999999999999998e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2441  ornithine carbamoyltransferase  53.16 
 
 
303 aa  339  4e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.617876  normal  0.127265 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0726  ornithine carbamoyltransferase  53.33 
 
 
300 aa  338  8e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.853376  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1057  ornithine carbamoyltransferase  50.33 
 
 
301 aa  335  5.999999999999999e-91  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18610  ornithine carbamoyltransferase  52.49 
 
 
305 aa  335  7e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0309685 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1609  ornithine carbamoyltransferase  52.16 
 
 
305 aa  335  7.999999999999999e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2317  ornithine carbamoyltransferase  54.33 
 
 
304 aa  334  9e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0451253  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0540  ornithine carbamoyltransferase  50.98 
 
 
304 aa  334  1e-90  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000671603  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1108  ornithine carbamoyltransferase  53.16 
 
 
306 aa  334  1e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3901  ornithine carbamoyltransferase  53 
 
 
306 aa  333  3e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0781  ornithine carbamoyltransferase  53.16 
 
 
306 aa  332  3e-90  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0769217  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4164  ornithine carbamoyltransferase  52.67 
 
 
306 aa  332  4e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1829  ornithine carbamoyltransferase  52.16 
 
 
312 aa  330  2e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2178  ornithine carbamoyltransferase  50.67 
 
 
310 aa  329  3e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.280829  normal  0.684526 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0742  ornithine carbamoyltransferase  51.82 
 
 
312 aa  329  3e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2430  ornithine carbamoyltransferase  51.01 
 
 
304 aa  328  5.0000000000000004e-89  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1163  ornithine carbamoyltransferase  52 
 
 
309 aa  328  5.0000000000000004e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.100026  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0323  ornithine carbamoyltransferase  52.49 
 
 
309 aa  328  6e-89  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2430  ornithine carbamoyltransferase  50.33 
 
 
305 aa  328  8e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3003  ornithine carbamoyltransferase  50.33 
 
 
305 aa  328  8e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1461  ornithine carbamoyltransferase  50.83 
 
 
305 aa  328  9e-89  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0921  ornithine carbamoyltransferase  50.67 
 
 
309 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0375  ornithine carbamoyltransferase  50.67 
 
 
309 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1073  ornithine carbamoyltransferase  50.67 
 
 
309 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0917  ornithine carbamoyltransferase  50.67 
 
 
309 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2510  ornithine carbamoyltransferase  50.67 
 
 
309 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0124  ornithine carbamoyltransferase  50.67 
 
 
309 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0675  ornithine carbamoyltransferase  50.67 
 
 
309 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4333  ornithine carbamoyltransferase  52.49 
 
 
306 aa  325  5e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5885  ornithine carbamoyltransferase  51.33 
 
 
309 aa  325  6e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.718044 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2080  ornithine carbamoyltransferase  51.67 
 
 
298 aa  325  8.000000000000001e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2532  ornithine carbamoyltransferase  53.93 
 
 
300 aa  325  8.000000000000001e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.120857  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0732  ornithine carbamoyltransferase  50.33 
 
 
309 aa  324  9e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1120  ornithine carbamoyltransferase  52.16 
 
 
306 aa  324  9e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105458  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2472  ornithine carbamoyltransferase  51 
 
 
309 aa  324  1e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.893068  normal  0.0170187 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1451  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 
311 aa  324  1e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1079  ornithine carbamoyltransferase  51.83 
 
 
306 aa  323  2e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0957  ornithine carbamoyltransferase  50.83 
 
 
307 aa  323  2e-87  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2577  ornithine carbamoyltransferase  51 
 
 
309 aa  323  2e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1942  ornithine carbamoyltransferase  51 
 
 
309 aa  323  2e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2553  ornithine carbamoyltransferase  51 
 
 
309 aa  323  2e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0394  ornithine carbamoyltransferase  51.62 
 
 
312 aa  322  3e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.510498 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0743  ornithine carbamoyltransferase  51 
 
 
309 aa  323  3e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.511035 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2601  ornithine carbamoyltransferase  51 
 
 
560 aa  323  3e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.766266  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3342  ornithine carbamoyltransferase  51.16 
 
 
306 aa  322  7e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0493063  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3573  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 
329 aa  321  8e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.510034  normal  0.18722 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1902  ornithine carbamoyltransferase  51.35 
 
 
306 aa  320  1.9999999999999998e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.24838  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1754  ornithine carbamoyltransferase  49.67 
 
 
326 aa  320  1.9999999999999998e-86  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0940132  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2130  ornithine carbamoyltransferase  51.16 
 
 
305 aa  320  1.9999999999999998e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1542  ornithine carbamoyltransferase  49.83 
 
 
308 aa  319  3e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0529  ornithine carbamoyltransferase  49.67 
 
 
309 aa  319  3e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2784  ornithine carbamoyltransferase  51.8 
 
 
309 aa  319  3.9999999999999996e-86  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2877  ornithine carbamoyltransferase  51.8 
 
 
309 aa  319  3.9999999999999996e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14030  ornithine carbamoyltransferase  50.5 
 
 
308 aa  318  5e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3032  ornithine carbamoyltransferase  49.67 
 
 
306 aa  318  6e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.710258  normal  0.386116 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2675  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 
308 aa  318  7e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1469  ornithine carbamoyltransferase  49.33 
 
 
326 aa  318  7e-86  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.808206  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1756  ornithine carbamoyltransferase  50.17 
 
 
323 aa  318  1e-85  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2691  ornithine carbamoyltransferase  51.8 
 
 
309 aa  317  1e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.661116  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1850  ornithine carbamoyltransferase  49.67 
 
 
305 aa  317  2e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0757  ornithine carbamoyltransferase  49.67 
 
 
309 aa  317  2e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1899  ornithine carbamoyltransferase  54.41 
 
 
300 aa  317  2e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0046  ornithine carbamoyltransferase  52.36 
 
 
300 aa  316  3e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0479  ornithine carbamoyltransferase  50.66 
 
 
306 aa  316  3e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.133467  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0386  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 
312 aa  316  4e-85  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1345  ornithine carbamoyltransferase  49.67 
 
 
312 aa  316  4e-85  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>