More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3607 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3607  precorrin-4 C11-methyltransferase  100 
 
 		 261 aa  522  1e-147  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3541  precorrin-4 C11-methyltransferase  96.93 
 
 		 261 aa  491  9.999999999999999e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0483  precorrin-4 C11-methyltransferase  83.14 
 
 		 258 aa  425  1e-118  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0039  precorrin-4 C11-methyltransferase  81.1 
 
 		 258 aa  417  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2994  precorrin-4 C11-methyltransferase  79.22 
 
 		 264 aa  407  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3231  precorrin-4 C11-methyltransferase  69.53 
 
 		 258 aa  348  5e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00900029  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2129  precorrin-4 C11-methyltransferase  56.52 
 
 		 259 aa  280  1e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738255 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1236  precorrin-4 C11-methyltransferase  53.36 
 
 		 251 aa  276  2e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1430  precorrin-4 C11-methyltransferase  53.36 
 
 		 251 aa  275  4e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0323621  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1092  precorrin-4 C11-methyltransferase  56.57 
 
 		 254 aa  264  8e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1298  precorrin-4 C11-methyltransferase  55.73 
 
 		 261 aa  263  2e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2711  precorrin-4 C11-methyltransferase  55.38 
 
 		 248 aa  263  3e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0313  precorrin-4 C11-methyltransferase  49 
 
 		 251 aa  262  4e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1294  precorrin-4 C11-methyltransferase  53.6 
 
 		 248 aa  262  4.999999999999999e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.04031 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1013  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.41 
 
 		 253 aa  260  1e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1342  precorrin-4 C11-methyltransferase  51.19 
 
 		 254 aa  258  8e-68  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0933  precorrin-4 C11-methyltransferase  50.58 
 
 		 260 aa  257  2e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00452437 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0614  precorrin-4 C11-methyltransferase  50.79 
 
 		 249 aa  256  3e-67  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00328163  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0962  precorrin-4 C11-methyltransferase  51 
 
 		 254 aa  256  4e-67  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.6045  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0934  precorrin-4 C11-methyltransferase  51.19 
 
 		 254 aa  255  5e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.23833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1747  precorrin-4 C11-methyltransferase  51.19 
 
 		 254 aa  251  7e-66  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.129763  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1265  precorrin-4 C11-methyltransferase  51.75 
 
 		 267 aa  249  3e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1011  precorrin-4 C11-methyltransferase  50.4 
 
 		 254 aa  247  1e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.04114  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1376  precorrin-4 C11-methyltransferase  50.41 
 
 		 252 aa  246  3e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2198  precorrin-4 C11-methyltransferase  51.39 
 
 		 257 aa  244  6.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.333099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1272  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.83 
 
 		 251 aa  244  9.999999999999999e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2205  precorrin-4 C11-methyltransferase  51.39 
 
 		 257 aa  244  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1716  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.8 
 
 		 253 aa  243  1.9999999999999999e-63  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2364  precorrin-4 C11-methyltransferase  51 
 
 		 257 aa  243  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2151  precorrin-4 C11-methyltransferase  50.6 
 
 		 257 aa  243  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0163963  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21210  precorrin-4 C11-methyltransferase  51 
 
 		 867 aa  241  6e-63  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2251  precorrin-4 C11-methyltransferase  51 
 
 		 257 aa  241  7e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.476505  normal  0.353064 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0059  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.43 
 
 		 256 aa  238  6.999999999999999e-62  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0934  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.03 
 
 		 250 aa  236  2e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0702  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.22 
 
 		 244 aa  235  4e-61  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0473  precorrin-4 C11-methyltransferase  50.59 
 
 		 252 aa  235  6e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0638  precorrin-4 C11-methyltransferase  51.37 
 
 		 271 aa  234  8e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0571  precorrin-4 C11-methyltransferase  51.37 
 
 		 272 aa  234  9e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.505536  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1557  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.67 
 
 		 256 aa  233  3e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2087  precorrin-3 methylase  50 
 
 		 257 aa  231  6e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3650  precorrin-4 C11-methyltransferase  53.2 
 
 		 252 aa  230  2e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.796321  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2501  precorrin-4 C11-methyltransferase  51.6 
 
 		 251 aa  230  2e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.218572 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12107  precorrin-4 C11-methyltransferase cobM  52.07 
 
 		 251 aa  226  3e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.182153  normal  0.885771 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2609  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.21 
 
 		 257 aa  224  1e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1288  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.04 
 
 		 626 aa  223  4e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4477  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.03 
 
 		 610 aa  222  6e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00717843  normal  0.120162 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2521  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.98 
 
 		 250 aa  221  8e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.14903 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1014  precorrin-4 C11-methyltransferase  49 
 
 		 626 aa  221  8e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3139  precorrin-4 C11-methyltransferase  50.62 
 
 		 243 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2484  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.98 
 
 		 250 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2529  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.98 
 
 		 250 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.527305 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1853  precorrin-4 C11-methyltransferase  51.03 
 
 		 247 aa  219  5e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2213  precorrin-3 methylase  50 
 
 		 250 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.578417  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1262  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.85 
 
 		 252 aa  216  2.9999999999999998e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25920  precorrin-3 methylase  50.79 
 
 		 250 aa  215  5e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0297541  normal  0.071417 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3384  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.21 
 
 		 253 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215023  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3136  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.26 
 
 		 272 aa  214  8e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.749873 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1024  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.84 
 
 		 281 aa  213  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.249462  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0114  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.91 
 
 		 262 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.177043  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1300  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.46 
 
 		 252 aa  212  3.9999999999999995e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1885  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.41 
 
 		 261 aa  212  3.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.804703  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0640  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.22 
 
 		 257 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.194872  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0211  cobalamin biosynthesis protein CbiG/precorrin-4 C11-methyltransferase  44.35 
 
 		 614 aa  212  4.9999999999999996e-54  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6035  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.23 
 
 		 275 aa  211  9e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0564  precorrin-4 C11-methyltransferase  53.04 
 
 		 246 aa  211  1e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.518716  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1521  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.63 
 
 		 261 aa  211  1e-53  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000101409 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1351  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.43 
 
 		 259 aa  210  2e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3184  precorrin-4 C11-methyltransferase  50.2 
 
 		 259 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1375  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.85 
 
 		 257 aa  210  2e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286247 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2779  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.06 
 
 		 284 aa  209  3e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.25946  normal  0.0736251 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2163  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.21 
 
 		 274 aa  209  3e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.233438 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0994  Precorrin-4 C(11)-methyltransferase  46.15 
 
 		 299 aa  209  4e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1578  precorrin-4 C11-methyltransferase  50 
 
 		 242 aa  208  6e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00147705  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1564  precorrin-4 C11-methyltransferase  50.21 
 
 		 242 aa  208  6e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.253118  normal  0.214845 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1596  precorrin-4 C11-methyltransferase  50.41 
 
 		 242 aa  208  8e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.727098  normal  0.416998 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1523  precorrin-4 C11-methyltransferase  50 
 
 		 280 aa  208  9e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00837984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0050  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.88 
 
 		 255 aa  207  1e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2374  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.44 
 
 		 259 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2779  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.22 
 
 		 250 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.545494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1177  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.22 
 
 		 305 aa  207  2e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3278  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.83 
 
 		 253 aa  206  3e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.696559  normal  0.9588 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2314  precorrin-4 C11-methyltransferase  51.29 
 
 		 259 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0491012  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2300  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.64 
 
 		 273 aa  205  5e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.366203  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3737  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.62 
 
 		 275 aa  205  6e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1249  precorrin-4 C11-methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase  49.38 
 
 		 241 aa  205  6e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.230063  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7180  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.53 
 
 		 252 aa  204  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.987588  normal  0.0970048 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1872  Precorrin-4 C(11)-methyltransferase  46.34 
 
 		 287 aa  203  2e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.222642 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3103  precorrin-4 C11-methyltransferase  46 
 
 		 248 aa  203  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4829  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.79 
 
 		 242 aa  203  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0449828 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0801  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.96 
 
 		 266 aa  204  2e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1198  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.79 
 
 		 242 aa  203  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1651  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.79 
 
 		 242 aa  203  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1678  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.79 
 
 		 242 aa  203  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0635313  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5685  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.19 
 
 		 260 aa  203  3e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0876668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2530  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.03 
 
 		 250 aa  202  5e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00855327 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0620  precorrin-4 C11-methyltransferase protein  45.28 
 
 		 271 aa  201  7e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.263132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2446  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.46 
 
 		 261 aa  201  7e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.130726  normal  0.124304 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1721  Precorrin-4 C(11)-methyltransferase  47.35 
 
 		 240 aa  201  7e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1693  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.06 
 
 		 269 aa  201  8e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.301759 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2394  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.59 
 
 		 241 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>