More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3601 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3601  ferric uptake regulator, Fur family  100 
 
 		 144 aa  298  1e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3535  ferric uptake regulator, Fur family  99.31 
 
 		 144 aa  298  2e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0045  ferric uptake regulator family protein  60.71 
 
 		 142 aa  189  9e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2987  FUR family transcriptional regulator  59.69 
 
 		 139 aa  174  4e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0184  ferric uptake regulator, Fur family  35.82 
 
 		 143 aa  99  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.567959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12385  ferric uptake regulation protein furB  34.11 
 
 		 130 aa  84.7  3e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.473792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2982  ferric uptake regulator, Fur family  35.88 
 
 		 154 aa  84.3  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000154751  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0066  ferric uptake regulator, Fur family  33.85 
 
 		 137 aa  84.3  5e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3820  ferric uptake regulator family protein  35.2 
 
 		 131 aa  84  6e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.396621  normal  0.536437 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0849  ferric uptake regulator  37.69 
 
 		 150 aa  82  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000679753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0813  ferric uptake regulator  37.69 
 
 		 150 aa  82  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000465454  normal  0.444337 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0740  ferric uptake regulator  37.69 
 
 		 150 aa  82  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000969196  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0752  ferric uptake regulator  37.69 
 
 		 150 aa  82  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000171486  normal  0.37739 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00640  ferric uptake regulator  37.69 
 
 		 148 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0211931  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2954  ferric uptake regulator, Fur family  37.69 
 
 		 148 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000269107  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2973  ferric uptake regulator  37.69 
 
 		 148 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00611688  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00631  hypothetical protein  37.69 
 
 		 148 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0172811  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0778  ferric uptake regulator  37.69 
 
 		 148 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000701006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0567  ferric uptake regulator  37.69 
 
 		 148 aa  82  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000138653  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0730  ferric uptake regulator  37.69 
 
 		 148 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177584  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0800  ferric uptake regulator  37.69 
 
 		 150 aa  82  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00301514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0711  ferric uptake regulator  37.69 
 
 		 148 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000960215  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0705  ferric uptake regulator  37.69 
 
 		 148 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000882448  normal  0.763196 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0194  ferric uptake regulator, Fur family  36.69 
 
 		 152 aa  81.3  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.207086  normal  0.440649 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1198  ferric uptake regulator  36.92 
 
 		 148 aa  81.3  0.000000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000281175  hitchhiker  0.000179243 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1301  ferric uptake regulator family protein  35.71 
 
 		 166 aa  81.3  0.000000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0281675  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2318  ferric uptake regulator, Fur family  32.06 
 
 		 152 aa  80.5  0.000000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.956105  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1117  ferric uptake regulator, Fur family  38.76 
 
 		 148 aa  80.5  0.000000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0856  zinc uptake regulator  33.61 
 
 		 129 aa  80.5  0.000000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.763265  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1842  ferric uptake regulator  34.88 
 
 		 143 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000122874  normal  0.0218944 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1206  ferric uptake regulator  39.23 
 
 		 149 aa  80.1  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000560641  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2939  ferric uptake regulator, Fur family  37.69 
 
 		 148 aa  79.7  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0253838  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2810  ferric uptake regulator  34.62 
 
 		 143 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.644684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1796  ferric uptake regulator  34.62 
 
 		 143 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0654147  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2171  ferric uptake regulator, Fur family  32.26 
 
 		 133 aa  79.3  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00854605  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3125  ferric uptake regulator  39.23 
 
 		 149 aa  80.1  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000249934  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1434  ferric uptake regulator  36.15 
 
 		 161 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000031646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2509  ferric uptake regulator  35.38 
 
 		 143 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000631479  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2622  ferric uptake regulator  35.38 
 
 		 143 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000743772  normal  0.0672977 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1842  ferric uptake regulator  35.38 
 
 		 143 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000255764  normal  0.0169118 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2502  ferric uptake regulator  35.38 
 
 		 143 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000739379  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2626  ferric uptake regulator, Fur family  35.66 
 
 		 143 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2468  ferric uptake regulator, Fur family  32.09 
 
 		 146 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0653957  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1661  ferric uptake regulator  34.62 
 
 		 143 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000966153  normal  0.373988 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2644  ferric uptake regulator family protein  35.71 
 
 		 146 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2991  ferric uptake regulator  37.21 
 
 		 148 aa  77.8  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00139405  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2902  ferric uptake regulator  37.21 
 
 		 148 aa  77.8  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  2.30182e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2189  ferric uptake regulator, Fur family  34.4 
 
 		 140 aa  77.8  0.00000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000532241  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0842  ferric uptake regulator, Fur family  31.06 
 
 		 152 aa  77.4  0.00000000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2730  ferric uptake regulator family protein  31.45 
 
 		 150 aa  77.4  0.00000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3002  ferric uptake regulator family protein  34.88 
 
 		 153 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000499535  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2263  ferric uptake regulator  35.38 
 
 		 143 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4359  FUR family transcriptional regulator  30 
 
 		 137 aa  77  0.00000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.291339  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4181  FUR family transcriptional regulator  30 
 
 		 137 aa  77  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4019  FUR family transcriptional regulator  30 
 
 		 137 aa  77  0.00000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.642016  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4029  FUR family transcriptional regulator  30 
 
 		 137 aa  77  0.00000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742096  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4413  transcriptional regulator, Fur family  30 
 
 		 137 aa  77  0.00000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000236646  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4503  FUR family transcriptional regulator  30 
 
 		 137 aa  77  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.606254  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4301  transcriptional regulator, Fur family  30 
 
 		 137 aa  77  0.00000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.08025e-17 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2543  ferric-uptake regulator  31.2 
 
 		 187 aa  77  0.00000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.37741  normal  0.402703 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1587  ferric uptake regulator, Fur family  34.11 
 
 		 143 aa  77  0.00000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000012945  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1061  FUR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 149 aa  76.6  0.0000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.304588  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3458  zinc uptake regulator  32 
 
 		 131 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.455544  normal  0.210399 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3447  zinc uptake regulator  32 
 
 		 131 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0819749  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2338  ferric uptake regulator  33.85 
 
 		 169 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.807618  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4397  transcriptional regulator, Fur family  29.23 
 
 		 137 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.108592  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1562  ferric uptake regulator, Fur family  31.82 
 
 		 147 aa  76.3  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3510  zinc uptake regulator  32 
 
 		 131 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.11469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0603  ferric uptake regulator family protein  33.83 
 
 		 138 aa  75.9  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.401566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0839  transcriptional regulator, Fur family  29.23 
 
 		 128 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.442755  hitchhiker  0.000379655 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1772  ferric uptake regulator, Fur family  31.71 
 
 		 141 aa  75.5  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.431388  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2745  ferric uptake regulator, Fur family  28.12 
 
 		 138 aa  75.9  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1593  ferric uptake regulator  35.38 
 
 		 143 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000083166  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2717  ferric uptake regulator family protein  32.8 
 
 		 134 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.519221 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1905  ferric uptake regulator family protein  30.83 
 
 		 140 aa  75.5  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4538  ferric uptake regulator family protein  31.2 
 
 		 134 aa  75.9  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0148082  normal  0.344615 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0322  ferric uptake regulator  37.21 
 
 		 148 aa  75.5  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000135806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2477  ferric uptake regulator family protein  32.37 
 
 		 143 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0153326  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1599  ferric uptake regulator, Fur family  32.54 
 
 		 135 aa  75.5  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.4089  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1236  ferric uptake regulator  35.88 
 
 		 148 aa  75.1  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000206726  normal  0.895859 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1937  ferric uptake regulator  35.38 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1641  ferric uptake regulator  35.38 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000188037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1716  ferric uptake regulator  35.38 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000280206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1716  ferric uptake regulator  35.38 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000468341  normal  0.147817 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1379  ferric uptake regulation protein Fur  31.78 
 
 		 143 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.404925  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3007  ferric uptake regulator family protein  29.23 
 
 		 137 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.830794  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1555  ferric uptake regulator family protein  32.35 
 
 		 149 aa  74.3  0.0000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1586  ferric-uptake regulator  32.35 
 
 		 149 aa  74.3  0.0000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.501887  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0061  zinc uptake regulator  31.47 
 
 		 142 aa  74.3  0.0000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3007  ferric uptake regulator, Fur family  31.3 
 
 		 143 aa  73.9  0.0000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2445  ferric uptake regulator family protein  34.68 
 
 		 143 aa  73.9  0.0000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164453  normal  0.662654 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0885  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  37.6 
 
 		 142 aa  73.9  0.0000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1194  ferric-uptake regulator  31.34 
 
 		 159 aa  73.9  0.0000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2442  ferric uptake regulator, Fur family  29.69 
 
 		 131 aa  73.9  0.0000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000168746 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3230  ferric uptake regulator, Fur family  26.61 
 
 		 150 aa  73.6  0.0000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0854036  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1481  ferric uptake regulator family protein  33.33 
 
 		 140 aa  73.6  0.0000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.268678  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2638  zinc uptake regulator  28.24 
 
 		 154 aa  73.2  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.777884  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2085  zinc uptake regulator  29.03 
 
 		 138 aa  73.6  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0873  ferric uptake regulator, Fur family protein  33.33 
 
 		 142 aa  73.2  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4555  ferric uptake regulator family protein  32.12 
 
 		 145 aa  72.8  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>