More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3575 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3575  heat shock protein GrpE  100 
 
 		 186 aa  377  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3506  heat shock protein GrpE  96.22 
 
 		 188 aa  366  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.175972  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0210  heat shock protein GrpE  64.1 
 
 		 199 aa  220  9.999999999999999e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000213319  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3533  heat shock protein GrpE  63.3 
 
 		 189 aa  212  1.9999999999999998e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00974284  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0032  heat shock protein GrpE  58.03 
 
 		 200 aa  201  6e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  54.21 
 
 		 190 aa  194  4.0000000000000005e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2830  GrpE protein  54.05 
 
 		 181 aa  193  1e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140779  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0108  heat shock protein nucleotide exchange factor GrpE  55.47 
 
 		 198 aa  162  3e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000378149  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0965  heat shock protein GrpE  47.43 
 
 		 195 aa  137  1e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000249934  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3296  heat shock protein GrpE  46.52 
 
 		 195 aa  136  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0127245  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02254  heat shock protein GrpE  46.84 
 
 		 211 aa  136  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.781248  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0730  heat shock protein GrpE  46.86 
 
 		 195 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0176899  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0704  heat shock protein GrpE  46.67 
 
 		 184 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.94046  hitchhiker  0.000436359 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4594  heat shock protein GrpE  48.39 
 
 		 185 aa  135  5e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.243186 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4728  heat shock protein GrpE  47.74 
 
 		 185 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.079881  hitchhiker  0.00247949 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2974  heat shock protein GrpE  45.45 
 
 		 192 aa  134  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364467  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2887  heat shock protein GrpE  45.45 
 
 		 192 aa  134  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  6.654980000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0612  co-chaperone GrpE  45.86 
 
 		 198 aa  134  9.999999999999999e-31  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1378  heat shock protein GrpE  45.45 
 
 		 192 aa  134  9.999999999999999e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000995394  normal  0.160188 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2791  heat shock protein GrpE  47.74 
 
 		 201 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103997  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1035  GrpE protein  47.02 
 
 		 189 aa  132  3e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00038029  hitchhiker  0.000654048 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3823  co-chaperone GrpE  45.51 
 
 		 209 aa  130  9e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131676  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2992  heat shock protein GrpE  47.1 
 
 		 200 aa  130  9e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000163848  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1857  GrpE protein  46.81 
 
 		 185 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2734  heat shock protein GrpE  42.35 
 
 		 194 aa  129  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000056941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2473  protein GrpE (heat shock protein)  43.87 
 
 		 194 aa  129  3e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4729  heat shock protein GrpE  44.85 
 
 		 184 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3216  heat shock protein GrpE  44.57 
 
 		 195 aa  128  4.0000000000000003e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.116428  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3330  heat shock protein GrpE  44.52 
 
 		 209 aa  128  5.0000000000000004e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000166428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2551  GrpE protein  40.96 
 
 		 260 aa  127  8.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2732  heat shock protein GrpE  41.94 
 
 		 203 aa  127  8.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000369534  normal  0.883865 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0971  GrpE protein  47.71 
 
 		 187 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2572  heat shock protein GrpE  45.81 
 
 		 201 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000957049  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3684  heat shock protein GrpE  46.5 
 
 		 190 aa  125  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000160031  normal  0.0536804 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2805  heat shock protein GrpE  41.4 
 
 		 203 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000498857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2902  heat shock protein GrpE  40.86 
 
 		 206 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000775754  normal  0.0175654 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4506  heat shock protein GrpE  45.16 
 
 		 187 aa  125  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.316473  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1901  GrpE protein  41.24 
 
 		 218 aa  125  3e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.489852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01132  heat shock protein GrpE  44.52 
 
 		 212 aa  124  5e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1477  GrpE protein  41.82 
 
 		 240 aa  125  5e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2080  heat shock protein GrpE  40.52 
 
 		 195 aa  124  7e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4196  heat shock protein GrpE  44.52 
 
 		 187 aa  123  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00395445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3095  GrpE protein  45.51 
 
 		 210 aa  124  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0381  heat shock protein GrpE  44.52 
 
 		 200 aa  123  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.901514  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2772  heat shock protein GrpE  48.15 
 
 		 205 aa  122  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000976111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1599  heat shock protein GrpE  49.61 
 
 		 171 aa  123  2e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.388628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004293  heat shock protein GrpE  44.03 
 
 		 198 aa  123  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3625  heat shock protein GrpE  42.6 
 
 		 189 aa  122  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.42288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3479  heat shock protein GrpE  44.52 
 
 		 209 aa  123  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000435816  normal  0.0401789 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1274  heat shock protein GrpE  41.4 
 
 		 206 aa  123  2e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000125429  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0069  GrpE protein  40.74 
 
 		 217 aa  123  2e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.311586  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1524  heat shock protein GrpE  45.81 
 
 		 206 aa  122  3e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62990  heat shock protein GrpE  45.16 
 
 		 186 aa  121  6e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142705  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  47.01 
 
 		 208 aa  120  8e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1986  GrpE protein  47.41 
 
 		 204 aa  120  8e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1356  heat shock protein GrpE  45.16 
 
 		 206 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000827789  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3005  heat shock protein GrpE  45.16 
 
 		 206 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000767299  decreased coverage  0.0000000711999 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4484  GrpE protein  46.88 
 
 		 244 aa  120  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2008  heat shock protein GrpE  37.17 
 
 		 199 aa  120  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2003  heat shock protein GrpE  41.72 
 
 		 199 aa  120  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1342  heat shock protein GrpE  45.16 
 
 		 206 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000163417  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1379  heat shock protein GrpE  45.16 
 
 		 206 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000798826  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3363  GrpE protein  44.2 
 
 		 245 aa  118  3.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00347236  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5482  heat shock protein GrpE  43.23 
 
 		 189 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.601194  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0762  heat shock protein GrpE  42.04 
 
 		 189 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0546948  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2570  heat shock protein GrpE  42.86 
 
 		 178 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1456  heat shock protein GrpE  48.06 
 
 		 172 aa  115  3e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.022256  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42980  heat shock protein GrpE  43.95 
 
 		 187 aa  115  3e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3217  heat shock protein GrpE  42.86 
 
 		 178 aa  115  3.9999999999999997e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2812  GrpE protein  36.22 
 
 		 210 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0237715  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0459  GrpE protein  43.35 
 
 		 193 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.585573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1513  heat shock protein GrpE  48.06 
 
 		 200 aa  115  3.9999999999999997e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2881  GrpE protein  43.28 
 
 		 181 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.274349  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01184  heat shock protein GrpE  47.29 
 
 		 172 aa  115  3.9999999999999997e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.200342  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2437  heat shock protein GrpE  46.67 
 
 		 200 aa  114  6e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000045112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0584  GrpE protein  45.52 
 
 		 225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3042  heat shock protein GrpE  43.04 
 
 		 207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.27806  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2766  heat shock protein GrpE  39.66 
 
 		 196 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000506874  normal  0.0900785 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02502  heat shock protein  39.66 
 
 		 197 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000506013  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02466  hypothetical protein  39.66 
 
 		 197 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000587917  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3965  GrpE protein  46.9 
 
 		 192 aa  112  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.54707 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3002  heat shock protein GrpE  39.66 
 
 		 197 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  7.86694e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2772  heat shock protein GrpE  39.66 
 
 		 197 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  5.080719999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2898  heat shock protein GrpE  39.66 
 
 		 196 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000538048  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3853  heat shock protein GrpE  40.45 
 
 		 197 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000510847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1070  heat shock protein GrpE  39.66 
 
 		 197 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal  0.0707842 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1061  Ribulose-phosphate 3-epimerase  39.66 
 
 		 197 aa  112  3e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000037652  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1194  GrpE protein  41.1 
 
 		 201 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.422814 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2497  GrpE protein  36.21 
 
 		 192 aa  111  5e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127852  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4329  GrpE protein  44.09 
 
 		 242 aa  111  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.134987  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0649  heat shock protein GrpE  43.67 
 
 		 195 aa  111  6e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.127631  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  45.86 
 
 		 213 aa  111  7.000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2635  heat shock protein GrpE  46.97 
 
 		 181 aa  110  9e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3963  heat shock protein GrpE  46.21 
 
 		 194 aa  110  9e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.107722 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2499  heat shock protein GrpE  46.97 
 
 		 202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0710839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1381  heat shock protein GrpE  40.3 
 
 		 208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00117514  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0667  heat shock protein GrpE  46.21 
 
 		 181 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.151401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1306  heat shock protein GrpE  46.97 
 
 		 178 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0644  heat shock protein GrpE  46.21 
 
 		 181 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1442  heat shock protein GrpE  39.55 
 
 		 204 aa  110  2.0000000000000002e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.105191  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>