More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3528 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_3528  phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 
484 aa  962  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3462  phosphomethylpyrimidine kinase  96.28 
 
 
484 aa  892  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3851  phosphomethylpyrimidine kinase  66.6 
 
 
497 aa  618  1e-176  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  64.38 
 
 
490 aa  594  1e-169  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2909  phosphomethylpyrimidine kinase  64.85 
 
 
497 aa  577  1e-163  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.112824 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2763  phosphomethylpyrimidine kinase  61.49 
 
 
492 aa  552  1e-156  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00755044  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2595  phosphomethylpyrimidine kinase  59.21 
 
 
494 aa  506  1e-142  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.61105  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2235  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  55.08 
 
 
479 aa  421  1e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  54.72 
 
 
270 aa  259  5e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1102  phosphomethylpyrimidine kinase  55.43 
 
 
271 aa  252  1e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0215379  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1153  phosphomethylpyrimidine kinase  50 
 
 
272 aa  251  2e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0935315  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1583  phosphomethylpyrimidine kinase  52.69 
 
 
264 aa  244  3e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.152097  normal  0.0340338 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  50 
 
 
267 aa  244  3e-63  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  50.98 
 
 
262 aa  242  1e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4453  phosphomethylpyrimidine kinase  54.09 
 
 
270 aa  238  2e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  0.352817 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3167  phosphomethylpyrimidine kinase  53.46 
 
 
263 aa  235  1e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17923  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1938  phosphomethylpyrimidine kinase  51.34 
 
 
267 aa  234  3e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0695148  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0853  phosphomethylpyrimidine kinase  49.64 
 
 
288 aa  233  6e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.114242  normal  0.0282488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  49.64 
 
 
288 aa  233  6e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0791  phosphomethylpyrimidine kinase  50.59 
 
 
270 aa  233  9e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0811  phosphomethylpyrimidine kinase  49.43 
 
 
270 aa  232  1e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46467e-47 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0804  phosphomethylpyrimidine kinase  50.59 
 
 
270 aa  232  1e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.088589  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4540  phosphomethylpyrimidine kinase  50.59 
 
 
270 aa  232  1e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.48056 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0734  phosphomethylpyrimidine kinase  49.43 
 
 
270 aa  232  1e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24669  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0700  phosphomethylpyrimidine kinase  49.43 
 
 
270 aa  232  1e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  50.99 
 
 
264 aa  232  1e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0644  phosphomethylpyrimidine kinase  49.43 
 
 
270 aa  232  1e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0552  phosphomethylpyrimidine kinase  54.55 
 
 
269 aa  231  2e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00628299 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  48.43 
 
 
264 aa  230  5e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  48.43 
 
 
264 aa  229  6e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0644  phosphomethylpyrimidine kinase  49.05 
 
 
270 aa  229  6e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0888  phosphomethylpyrimidine kinase  50.59 
 
 
270 aa  229  9e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  3.10773e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0621  phosphomethylpyrimidine kinase  49.8 
 
 
270 aa  228  2e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0650  phosphomethylpyrimidine kinase  50.2 
 
 
273 aa  227  3e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.797575  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3577  phosphomethylpyrimidine kinase  48.47 
 
 
266 aa  227  3e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.385467 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  52.49 
 
 
268 aa  227  4e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2095  phosphomethylpyrimidine kinase  53.15 
 
 
285 aa  224  2e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  46.56 
 
 
267 aa  225  2e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2517  phosphomethylpyrimidine kinase  47.45 
 
 
260 aa  224  3e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2331  phosphomethylpyrimidine kinase  49.43 
 
 
288 aa  224  3e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1397  phosphomethylpyrimidine kinase  47.49 
 
 
265 aa  223  4e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  3.85147e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0486  phosphomethylpyrimidine kinase  49.65 
 
 
284 aa  223  5e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2382  phosphomethylpyrimidine kinase  49.24 
 
 
266 aa  223  5e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.779831 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2378  phosphomethylpyrimidine kinase  48.85 
 
 
266 aa  223  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.305846  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3082  phosphomethylpyrimidine kinase  47.71 
 
 
266 aa  223  7e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.190737 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1628  phosphomethylpyrimidine kinase  51.72 
 
 
266 aa  223  8e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.522982  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2391  phosphomethylpyrimidine kinase  47.33 
 
 
266 aa  222  1e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  51.71 
 
 
268 aa  222  1e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1554  phosphomethylpyrimidine kinase  47.33 
 
 
266 aa  222  1e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  51.71 
 
 
268 aa  222  1e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1544  phosphomethylpyrimidine kinase  47.33 
 
 
266 aa  222  1e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0961  phosphomethylpyrimidine kinase  47.33 
 
 
266 aa  222  1e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2239  phosphomethylpyrimidine kinase  47.33 
 
 
266 aa  222  1e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2490  phosphomethylpyrimidine kinase  48.85 
 
 
266 aa  222  1e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1135  phosphomethylpyrimidine kinase  47.33 
 
 
266 aa  222  1e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.878652  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0928  phosphomethylpyrimidine kinase  56.37 
 
 
271 aa  222  1e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0346056  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2289  phosphomethylpyrimidine kinase  48.85 
 
 
266 aa  222  1e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.426705  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0125  phosphomethylpyrimidine kinase  50.92 
 
 
285 aa  221  2e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.713324 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1100  phosphomethylpyrimidine kinase  46.54 
 
 
270 aa  221  2e-56  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0641  phosphomethylpyrimidine kinase  46.54 
 
 
270 aa  221  2e-56  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.328033  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02031  phosphomethylpyrimidine kinase  46.95 
 
 
266 aa  221  3e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01995  hypothetical protein  46.95 
 
 
266 aa  221  3e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2710  phosphomethylpyrimidine kinase  46.56 
 
 
266 aa  220  4e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.227545  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2333  phosphomethylpyrimidine kinase  48.09 
 
 
266 aa  220  6e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0091  phosphomethylpyrimidine kinase  44.53 
 
 
270 aa  219  9e-56  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1191  phosphomethylpyrimidine kinase  47.51 
 
 
267 aa  219  9e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.16328  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3091  phosphomethylpyrimidine kinase  48.08 
 
 
266 aa  219  9e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0488797  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1225  phosphomethylpyrimidine kinase  46.15 
 
 
270 aa  219  1e-55  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1787  phosphomethylpyrimidine kinase  49.48 
 
 
308 aa  218  2e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23579  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1301  phosphomethylpyrimidine kinase  47.13 
 
 
267 aa  218  2e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.185406  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1658  phosphomethylpyrimidine kinase  53.44 
 
 
268 aa  217  3e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0210202 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2346  phosphomethylpyrimidine kinase  52.76 
 
 
266 aa  217  3e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1265  phosphomethylpyrimidine kinase  55.43 
 
 
267 aa  217  3e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2479  phosphomethylpyrimidine kinase  53.05 
 
 
268 aa  217  5e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0351011  hitchhiker  0.000627669 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1361  phosphomethylpyrimidine kinase  52.67 
 
 
268 aa  216  6e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.628466  normal  0.92591 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0372  phosphomethylpyrimidine kinase  47.81 
 
 
285 aa  216  8e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591258  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1692  phosphomethylpyrimidine kinase  50.83 
 
 
283 aa  216  8e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0788599  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1321  phosphomethylpyrimidine kinase  47.69 
 
 
266 aa  215  1e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2979  phosphomethylpyrimidine kinase  46.36 
 
 
267 aa  216  1e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1443  phosphomethylpyrimidine kinase  49.61 
 
 
269 aa  215  1e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2294  phosphomethylpyrimidine kinase  51.95 
 
 
269 aa  215  1e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3496  phosphomethylpyrimidine kinase  51.89 
 
 
268 aa  214  3e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.828772  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1935  phosphomethylpyrimidine kinase  49.82 
 
 
283 aa  214  4e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1203  phosphomethylpyrimidine kinase  47.31 
 
 
266 aa  213  4e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.564031  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1670  phosphomethylpyrimidine kinase  49.8 
 
 
260 aa  214  4e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.42362 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  49.22 
 
 
266 aa  213  6e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0914  phosphomethylpyrimidine kinase  49.61 
 
 
282 aa  213  6e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0556569  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2132  phosphomethylpyrimidine kinase  53.38 
 
 
282 aa  213  7e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.588203  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  47.31 
 
 
268 aa  212  1e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1082  phosphomethylpyrimidine kinase  49.81 
 
 
271 aa  212  1e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3018  phosphomethylpyrimidine kinase  49.82 
 
 
270 aa  212  1e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4315  phosphomethylpyrimidine kinase  49.17 
 
 
297 aa  211  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.319953  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0452  phosphomethylpyrimidine kinase  46.46 
 
 
436 aa  212  2e-53  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.70912 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10848  probable phosphomethylpyrimidine kinase (ThiD)  46.92 
 
 
269 aa  211  2e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0191434  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0706  phosphomethylpyrimidine kinase  48.63 
 
 
268 aa  211  3e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0366  phosphomethylpyrimidine kinase  49.41 
 
 
266 aa  211  3e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.437548 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0649  phosphomethylpyrimidine kinase  42.59 
 
 
267 aa  211  3e-53  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0890915  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0605  phosphomethylpyrimidine kinase  46.15 
 
 
267 aa  210  4e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2061  phosphomethylpyrimidine kinase  49.22 
 
 
260 aa  210  4e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0150754  normal  0.0985623 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1813  phosphomethylpyrimidine kinase  50.96 
 
 
275 aa  210  5e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.319911  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>