More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3515 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_3515  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
393 aa  800    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000186871 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3449  glycosyl transferase group 1  96.88 
 
 
394 aa  768    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2890  glycosyl transferase, group 1  63.54 
 
 
409 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.036478 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3833  glycosyl transferase, group 1  60.1 
 
 
397 aa  494  1e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.794205  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2584  glycosyl transferase, group 1  59.11 
 
 
434 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0624  glycosyl transferase, group 1 family protein  59.95 
 
 
383 aa  436  1e-121  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2753  glycosyl transferase group 1  54.99 
 
 
394 aa  425  1e-118  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4489  glycosyl transferase group 1  44.22 
 
 
417 aa  326  5e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3605  glycosyl transferase, group 1  45.15 
 
 
405 aa  320  3e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.1788 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4414  glycosyl transferase, group 1  43.96 
 
 
397 aa  311  1e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.63782  normal  0.431195 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4294  glycosyl transferase group 1  43 
 
 
405 aa  302  8.000000000000001e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.458687 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0334  glycosyl transferase group 1  47.14 
 
 
411 aa  299  6e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.145244 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  27.93 
 
 
394 aa  131  3e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1510  glycosyl transferase, group 1  30.45 
 
 
415 aa  114  4.0000000000000004e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2141  glycosyltransferase  25.24 
 
 
416 aa  102  9e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00102383  normal  0.405566 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2473  glycosyl transferase group 1  35.93 
 
 
403 aa  101  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  25.58 
 
 
401 aa  99  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0690  glycosyl transferase, group 1  30.42 
 
 
394 aa  99  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0756  glycosyl transferase group 1  29.83 
 
 
445 aa  98.6  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.621398  hitchhiker  0.000561624 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2840  glycosyl transferase, group 1  37.12 
 
 
403 aa  98.2  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0670  glycosyl transferase, group 1  26.51 
 
 
405 aa  95.1  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26810  glycosyltransferase  30.08 
 
 
723 aa  95.1  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  29.06 
 
 
386 aa  94.7  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1805  glycosyl transferase, group 1  27.93 
 
 
372 aa  93.6  6e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2409  glycosyl transferase, group 1  26.92 
 
 
406 aa  93.2  7e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03650  glycosyltransferase  28.39 
 
 
413 aa  92  2e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.736839  normal  0.451667 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1114  glycosyltransferase (group I)  27.8 
 
 
404 aa  90.5  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0654  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
392 aa  90.5  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.871092  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2517  glycosyl transferase group 1  28.67 
 
 
405 aa  89.7  9e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.0541201 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3471  glycosyl transferase, group 1  30.46 
 
 
390 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.152793  normal  0.0339025 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0161  group 1 glycosyl transferase  25.45 
 
 
557 aa  88.2  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.725512  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3776  glycosyl transferase, group 1  28.28 
 
 
371 aa  88.6  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  23.29 
 
 
348 aa  88.2  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1920  glycosyl transferase, group 1  26.04 
 
 
481 aa  87.4  3e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0375  Glycosyltransferase-like protein  25.38 
 
 
569 aa  87  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5249  glycosyl transferase group 1  28.36 
 
 
386 aa  86.7  6e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3791  glycosyl transferase, group 1  28.93 
 
 
428 aa  86.7  7e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2959  glycosyl transferase group 1  26.09 
 
 
398 aa  86.3  8e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000811696 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3851  glycosyl transferase group 1  26.41 
 
 
575 aa  86.3  8e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0448869  normal  0.314973 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0792  glycosyl transferase group 1  23.57 
 
 
375 aa  86.3  9e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4282  glycosyl transferase group 1  30.41 
 
 
405 aa  85.9  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.870736  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4437  glycosyl transferase group 1  26.98 
 
 
387 aa  85.5  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1537  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
385 aa  85.5  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.728307 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5881  glycosyl transferase group 1  27.8 
 
 
419 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.30943  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0171  glycosyl transferase, group 1  34.09 
 
 
389 aa  85.1  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1562  glycosyl transferase, group 1  29.03 
 
 
463 aa  84.7  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.515981 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  30.87 
 
 
436 aa  84  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3248  glycosyl transferase group 1  29.72 
 
 
418 aa  83.2  0.000000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2752  glycosyl transferase, group 1  26.09 
 
 
401 aa  83.2  0.000000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2935  glycosyl transferase group 1  27.91 
 
 
407 aa  82.8  0.000000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.577866  normal  0.524433 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2941  glycosyl transferase group 1  25.71 
 
 
414 aa  82  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  26.82 
 
 
417 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  28.63 
 
 
415 aa  82  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4468  glycosyl transferase group 1  25.36 
 
 
457 aa  81.3  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1622  glycosyl transferase group 1  25.61 
 
 
402 aa  80.9  0.00000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0293  glycosyl transferase, group 1  25.48 
 
 
406 aa  80.9  0.00000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.551542  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  27.72 
 
 
419 aa  80.9  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0231  glycosyl transferase group 1  28.71 
 
 
366 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1596  glycosyl transferase, group 1  26.49 
 
 
386 aa  79.7  0.00000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  26.45 
 
 
410 aa  79  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  24.52 
 
 
904 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0245  glycosyl transferase group 1  27.8 
 
 
396 aa  78.2  0.0000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0172332  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1998  glycosyl transferase group 1  23.34 
 
 
379 aa  78.6  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1099  glycosyl transferase, group 1  24.76 
 
 
388 aa  78.2  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27990  glycosyltransferase  27.95 
 
 
603 aa  79  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1509  glycosyl transferase, group 1  29.58 
 
 
425 aa  78.6  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2857  group 1 glycosyl transferase  25.16 
 
 
391 aa  78.2  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2394  glycosyl transferase, group 1  27.43 
 
 
395 aa  77.8  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0294  glycosyl transferase, group 1  30.69 
 
 
413 aa  77  0.0000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2434  glycosyl transferase, group 1  24 
 
 
386 aa  77  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.433213 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4161  glycosyl transferase group 1  24.61 
 
 
392 aa  77  0.0000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0012  glycosyl transferase group 1  30.42 
 
 
458 aa  76.6  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  27.08 
 
 
382 aa  76.3  0.0000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4035  glycosyl transferase group 1  27.14 
 
 
421 aa  76.3  0.0000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00411563 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3940  glycosyl transferase group 1  32.14 
 
 
402 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0767  glycosyl transferase group 1  26.44 
 
 
414 aa  75.5  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0616  glycosyltransferase, group 1  26.44 
 
 
414 aa  75.5  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0581  glycosyl transferase, group 1  24.4 
 
 
405 aa  75.9  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0604  glycosyl transferase group 1  28.31 
 
 
819 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0678  glycosyl transferase, group 1  23.99 
 
 
411 aa  75.9  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0695146  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  29.29 
 
 
366 aa  75.5  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3360  glycosyl transferase, group 1  26.91 
 
 
355 aa  75.5  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.730903 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1973  glycosyl transferase, group 1  28.51 
 
 
416 aa  74.7  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0137  glycosyl transferase, group 1  26.67 
 
 
411 aa  75.1  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0347  glycosyl transferase group 1  29.92 
 
 
369 aa  74.3  0.000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  25.58 
 
 
351 aa  74.7  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  24.83 
 
 
377 aa  74.7  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  28.63 
 
 
385 aa  74.3  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1678  glycosyl transferase, group 1  27.14 
 
 
373 aa  74.3  0.000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1385  glycosyl transferase group 1  27.72 
 
 
415 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.011099 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2841  glycosyl transferase, group 1  28.37 
 
 
420 aa  73.9  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0136  glycosyl transferase, group 1  24.21 
 
 
417 aa  73.6  0.000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  24.17 
 
 
385 aa  73.9  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3221  glycosyl transferase, group 1  29.67 
 
 
417 aa  73.6  0.000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0404695  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0773  glycosyl transferase group 1  26.8 
 
 
457 aa  73.6  0.000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2715  glycosyl transferase group 1  29.18 
 
 
375 aa  73.6  0.000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1287  glycosyl transferase group 1  26.17 
 
 
392 aa  73.6  0.000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2268  glycosyl transferase, group 1  25.2 
 
 
394 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459114  normal  0.160076 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2063  glycosyl transferase, group 1  25.7 
 
 
392 aa  73.2  0.000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08970  glycosyltransferase  29.62 
 
 
601 aa  72.8  0.000000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>