29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3514 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_3514  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
203 aa  413  9.999999999999999e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000874673 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3448  transcriptional regulator, MarR family  94.5 
 
 
201 aa  387  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3791  regulatory protein, MarR  72.08 
 
 
204 aa  301  5.000000000000001e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0625  hypothetical protein  63.87 
 
 
212 aa  258  5.0000000000000005e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2889  hypothetical protein  64.95 
 
 
202 aa  254  7e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0208213 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2752  regulatory protein, MarR  43.08 
 
 
205 aa  153  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1283  AsnC family transcriptional regulator  43.48 
 
 
192 aa  144  8.000000000000001e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0892  hypothetical protein  39.1 
 
 
198 aa  113  1.0000000000000001e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.656766  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1123  hypothetical protein  40 
 
 
191 aa  109  2.0000000000000002e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0798  AsnC family transcriptional regulator  47.56 
 
 
106 aa  67  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2316  AsnC family transcriptional regulator  39 
 
 
125 aa  65.9  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.153749 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1291  regulatory protein MarR  32.89 
 
 
170 aa  64.7  0.0000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0934  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
167 aa  63.9  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0077  transcriptional regulator, MarR family  34.78 
 
 
123 aa  62.8  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0075  hypothetical protein  35.71 
 
 
119 aa  62.4  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.492239  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0358  transcriptional regulator, MarR family  36.59 
 
 
105 aa  62.4  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0758  MarR family transcriptional regulator  37.35 
 
 
124 aa  60.8  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.663702  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0959  MarR family transcriptional regulator  24.62 
 
 
215 aa  60.1  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1236  hypothetical protein  40.85 
 
 
134 aa  58.2  0.00000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.82618  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1145  hypothetical protein  31.29 
 
 
126 aa  57.4  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1570  transcriptional regulator, MarR family  42.31 
 
 
119 aa  55.5  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587855  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1405  hypothetical protein  25.84 
 
 
208 aa  47.4  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.179835  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2656  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  40.85 
 
 
691 aa  46.2  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1359  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.36 
 
 
262 aa  45.8  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.036138  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3340  sulfate adenylyltransferase  35.37 
 
 
690 aa  45.8  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10273  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1831  transcriptional regulator, MarR family  22.4 
 
 
220 aa  43.1  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2992  MarR family transcriptional regulator  32.08 
 
 
167 aa  42.7  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1794  AsnC family transcriptional regulator  39.29 
 
 
111 aa  42.4  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0756  MarR family transcriptional regulator  40.48 
 
 
77 aa  42  0.007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.58096  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>