79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3495 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3495  SirA family protein  100 
 
 		 195 aa  386  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.70288e-33 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3433  SirA family protein  95.38 
 
 		 195 aa  371  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000787487  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1085  hypothetical protein  65.31 
 
 		 196 aa  251  6e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  5.60528e-18  hitchhiker  0.0000092747 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2521  hypothetical protein  64.8 
 
 		 195 aa  246  2e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.104075  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3765  SirA family protein  63.78 
 
 		 193 aa  244  4.9999999999999997e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000718423  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2448  SirA family protein  51.76 
 
 		 196 aa  206  2e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000888888  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2206  hypothetical protein  38.27 
 
 		 190 aa  152  2e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2500  hypothetical protein  38.27 
 
 		 190 aa  152  4e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0124  SirA-like  40.3 
 
 		 193 aa  149  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0144261  normal  0.614717 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3077  SirA family protein  38.19 
 
 		 199 aa  149  3e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000237941 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0303  redox protein, regulator of disulfide bond formation  40.41 
 
 		 199 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000562968  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1242  SirA family protein  41.18 
 
 		 196 aa  137  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1688  SirA family protein  38.73 
 
 		 204 aa  131  5e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.733385  normal  0.789276 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4588  SirA family protein  34.67 
 
 		 197 aa  131  6e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.282378  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1487  SirA family protein  30.59 
 
 		 223 aa  129  2.0000000000000002e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1887  SirA-like protein  39.18 
 
 		 195 aa  125  3e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25450  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  36.55 
 
 		 201 aa  123  2e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.337434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2159  SirA family protein  35.9 
 
 		 197 aa  120  9e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000102186  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1708  hypothetical protein  36.32 
 
 		 204 aa  120  9e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0132248  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0367  SirA family protein  31.98 
 
 		 199 aa  120  9.999999999999999e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11340  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  38.07 
 
 		 203 aa  119  3e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.544302  normal  0.497017 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1959  hypothetical protein  35.15 
 
 		 208 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.51951  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3402  SirA family protein  37.06 
 
 		 200 aa  111  6e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0293629 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2054  selenium metabolism protein YedF  34.67 
 
 		 196 aa  109  3e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0807  selenium metabolism protein YedF  33.98 
 
 		 211 aa  108  5e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.45173 
 
 
-
 
NC_002950  PG1888  hypothetical protein  29.7 
 
 		 204 aa  108  6e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.660532 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0677  hypothetical protein  32.49 
 
 		 197 aa  107  2e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0248  SirA family protein  32.02 
 
 		 203 aa  105  5e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.322 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1060  hypothetical protein  34.48 
 
 		 206 aa  105  6e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0361  putative transcriptional regulator  33.85 
 
 		 192 aa  104  1e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0630  selenium metabolism protein YedF  34.72 
 
 		 198 aa  100  9e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0025612  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1894  SirA family protein  35.58 
 
 		 209 aa  100  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00825245  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0368  hypothetical protein  33.17 
 
 		 214 aa  94.7  8e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.162867 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0251  SirA family protein  31 
 
 		 202 aa  93.6  2e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1678  hypothetical protein  27.18 
 
 		 190 aa  88.2  8e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1497  hypothetical protein  27.18 
 
 		 190 aa  87.8  9e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1417  hypothetical protein  32.21 
 
 		 212 aa  87.4  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.126908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1857  hypothetical protein  26.67 
 
 		 190 aa  87.4  1e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0830  hypothetical protein  37.96 
 
 		 114 aa  84.3  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000290687 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2431  selenium metabolism protein YedF  28.93 
 
 		 189 aa  82.4  0.000000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00446585  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1581  hypothetical protein  38.74 
 
 		 117 aa  79.3  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.38625  normal  0.052602 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2136  translation initiation factor IF-3  29.19 
 
 		 200 aa  79  0.00000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1780  hypothetical protein  30.37 
 
 		 200 aa  78.6  0.00000000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0463262  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0576  SirA-like protein  36.44 
 
 		 119 aa  77.8  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.676233  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0573  SirA-like protein  36.94 
 
 		 119 aa  75.5  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1779  hypothetical protein  25.39 
 
 		 199 aa  75.1  0.0000000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2893  SirA family protein  34.55 
 
 		 118 aa  69.3  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.455878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0339  hypothetical protein  25.13 
 
 		 199 aa  68.2  0.00000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.331374  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3421  hypothetical protein  35.51 
 
 		 140 aa  67.8  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00083332 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1439  SirA-like  44.44 
 
 		 72 aa  66.2  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145745  normal  0.024487 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2433  SirA family protein  40.58 
 
 		 74 aa  63.9  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0027  SirA family protein  44.26 
 
 		 70 aa  58.9  0.00000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.111426  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0063  SirA family protein  39.71 
 
 		 69 aa  53.1  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2466  hypothetical protein  35.94 
 
 		 69 aa  51.6  0.000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315359  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0855  SirA family protein  40.91 
 
 		 70 aa  51.2  0.000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.412959  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3169  SirA family protein  38.46 
 
 		 76 aa  51.2  0.000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2082  SirA family protein  44.64 
 
 		 72 aa  50.8  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2088  hypothetical protein  39.62 
 
 		 69 aa  50.1  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.35634  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1366  SirA family protein  39.39 
 
 		 70 aa  49.7  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3940  redox protein regulator of disulfide bond formation-like protein  40.54 
 
 		 74 aa  49.7  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00180546  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1310  SirA family protein  39.39 
 
 		 70 aa  48.5  0.00006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1352  hypothetical protein  37.5 
 
 		 74 aa  48.5  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0904  hypothetical protein  38.71 
 
 		 71 aa  48.1  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00947642  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0821  hypothetical protein  34.85 
 
 		 79 aa  47  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00550  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  38.24 
 
 		 68 aa  46.2  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0643  SirA family protein  37.88 
 
 		 70 aa  46.6  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1571  hypothetical protein  43.64 
 
 		 74 aa  46.6  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000229644  normal  0.442778 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0940  hypothetical protein  38.33 
 
 		 75 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596514  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1319  SirA family protein  37.88 
 
 		 70 aa  45.4  0.0006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.514232  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0248  hypothetical protein  40.91 
 
 		 73 aa  45.1  0.0008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1311  SirA family protein  32.5 
 
 		 200 aa  44.3  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1977  hypothetical protein  38.18 
 
 		 74 aa  43.9  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.73492  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2243  hypothetical protein  38.18 
 
 		 74 aa  43.9  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2339  SirA family protein  35.21 
 
 		 75 aa  43.9  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0889916  normal  0.318145 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0939  hypothetical protein  36.67 
 
 		 75 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000269274  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1524  SirA family protein  32.43 
 
 		 189 aa  42.4  0.004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0688  SirA family protein  32.2 
 
 		 75 aa  42  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1094  Ferredoxin--nitrite reductase  38.89 
 
 		 796 aa  42  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.268202  normal  0.0850268 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0561  SirA family protein  35 
 
 		 75 aa  41.2  0.01  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00147914  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>