16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3442 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3442  hypothetical protein  100 
 
 		 190 aa  372  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  3.6631e-29 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0819  hypothetical protein  81.58 
 
 		 183 aa  219  1.9999999999999999e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000980503  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2108  hypothetical protein  52 
 
 		 189 aa  61.2  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2597  hypothetical protein  45.95 
 
 		 217 aa  60.5  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0869  proline-rich region  44.58 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.426723  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0152  proline-rich region  45.21 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0285  hypothetical protein  55 
 
 		 111 aa  51.6  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00144128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0233  hypothetical protein  69.23 
 
 		 126 aa  47.4  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  3.86465e-19  hitchhiker  8.74497e-18 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0147  hypothetical protein  58.06 
 
 		 226 aa  46.2  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3535  hypothetical protein  57.58 
 
 		 108 aa  45.1  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0147192  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0476  hypothetical protein  55.17 
 
 		 154 aa  43.9  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6178  hypothetical protein  29.93 
 
 		 146 aa  43.9  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0536  hypothetical protein  50 
 
 		 235 aa  43.5  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.497522  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2916  hypothetical protein  40.54 
 
 		 149 aa  42.4  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1296  hypothetical protein  33.87 
 
 		 176 aa  41.6  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.143456  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5928  hypothetical protein  37.18 
 
 		 188 aa  41.6  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>