More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3424 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2271  lysyl-tRNA synthetase  84.08 
 
 		 491 aa  863    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3424  lysyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 492 aa  1008    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0836  lysyl-tRNA synthetase  98.98 
 
 		 492 aa  1001    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000359337  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3240  lysyl-tRNA synthetase  85.37 
 
 		 494 aa  885    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000008657  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0757  lysyl-tRNA synthetase  81.1 
 
 		 492 aa  832    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0478688  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1248  lysyl-tRNA synthetase  67.41 
 
 		 494 aa  706    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.88178e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2360  lysyl-tRNA synthetase, class-2  86.33 
 
 		 491 aa  881    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3014  lysyl-tRNA synthetase  80.28 
 
 		 503 aa  825    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.270584  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3742  lysyl-tRNA synthetase  60.56 
 
 		 496 aa  605  9.999999999999999e-173  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.464722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1957  lysyl-tRNA synthetase  59.48 
 
 		 513 aa  598  1e-170  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0422  lysyl-tRNA synthetase  58.22 
 
 		 511 aa  595  1e-169  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1462  lysyl-tRNA synthetase  59.63 
 
 		 499 aa  592  1e-168  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.485699  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0983  lysyl-tRNA synthetase  59.39 
 
 		 496 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0301  lysyl-tRNA synthetase  57.89 
 
 		 496 aa  578  1.0000000000000001e-163  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1804  lysyl-tRNA synthetase  59.51 
 
 		 499 aa  577  1.0000000000000001e-163  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02722  lysine tRNA synthetase, constitutive  58.57 
 
 		 505 aa  573  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.639926  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0802  lysyl-tRNA synthetase  58.57 
 
 		 505 aa  573  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000973431  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2847  lysyl-tRNA synthetase  58.47 
 
 		 484 aa  574  1.0000000000000001e-162  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3296  lysyl-tRNA synthetase  58.01 
 
 		 505 aa  572  1.0000000000000001e-162  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3216  lysyl-tRNA synthetase  58.57 
 
 		 505 aa  572  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3023  lysyl-tRNA synthetase  58.57 
 
 		 505 aa  573  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3422  lysyl-tRNA synthetase  58.13 
 
 		 505 aa  572  1.0000000000000001e-162  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.231607  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0819  lysyl-tRNA synthetase  58.57 
 
 		 505 aa  573  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3308  lysyl-tRNA synthetase  58.78 
 
 		 505 aa  574  1.0000000000000001e-162  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3049  lysyl-tRNA synthetase  58.57 
 
 		 505 aa  573  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2275  lysyl-tRNA synthetase  58.52 
 
 		 507 aa  572  1.0000000000000001e-162  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3309  lysyl-tRNA synthetase  58.57 
 
 		 505 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.97294  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3384  lysyl-tRNA synthetase  57.99 
 
 		 502 aa  573  1.0000000000000001e-162  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4180  lysyl-tRNA synthetase  58.57 
 
 		 505 aa  571  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02685  hypothetical protein  58.57 
 
 		 505 aa  573  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.803561  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04000  lysine tRNA synthetase, inducible  57.55 
 
 		 505 aa  568  1e-161  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3862  lysyl-tRNA synthetase  57.55 
 
 		 505 aa  568  1e-161  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3196  lysyl-tRNA synthetase  58.37 
 
 		 505 aa  570  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.442927  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4370  lysyl-tRNA synthetase  57.55 
 
 		 505 aa  568  1e-161  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.119358  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03962  hypothetical protein  57.55 
 
 		 505 aa  568  1e-161  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3271  lysyl-tRNA synthetase  58.37 
 
 		 505 aa  570  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5645  lysyl-tRNA synthetase  57.55 
 
 		 505 aa  568  1e-161  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3888  lysyl-tRNA synthetase  58.37 
 
 		 505 aa  571  1e-161  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3376  lysyl-tRNA synthetase  58.37 
 
 		 505 aa  570  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3274  lysyl-tRNA synthetase  58.37 
 
 		 505 aa  570  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3428  lysyl-tRNA synthetase  56.36 
 
 		 509 aa  570  1e-161  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00904218 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3208  lysyl-tRNA synthetase  58.37 
 
 		 505 aa  570  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.563866 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0888  lysyl-tRNA synthetase  56.8 
 
 		 501 aa  568  1e-161  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1152  lysyl-tRNA synthetase  55.98 
 
 		 508 aa  568  1e-160  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.562013  normal  0.115463 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0893  lysyl-tRNA synthetase, class-2  56.73 
 
 		 501 aa  565  1e-160  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5424  lysyl-tRNA synthetase  55.78 
 
 		 524 aa  565  1e-160  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4684  lysyl-tRNA synthetase  57.55 
 
 		 505 aa  567  1e-160  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3898  lysyl-tRNA synthetase  57.55 
 
 		 505 aa  567  1e-160  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5959  lysyl-tRNA synthetase  55.78 
 
 		 508 aa  565  1e-160  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4598  lysyl-tRNA synthetase  57.55 
 
 		 505 aa  567  1e-160  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.221304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2136  lysyl-tRNA synthetase  55.78 
 
 		 508 aa  565  1e-160  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.251549 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2118  lysyl-tRNA synthetase  55.78 
 
 		 508 aa  565  1e-160  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414372  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1032  lysyl-tRNA synthetase  56.59 
 
 		 501 aa  566  1e-160  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.565305  normal  0.238368 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1410  lysyl-tRNA synthetase  55.94 
 
 		 520 aa  567  1e-160  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0649  lysyl-tRNA synthetase  57.84 
 
 		 505 aa  565  1e-160  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1741  hypothetical protein  57.38 
 
 		 496 aa  561  1.0000000000000001e-159  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0865  lysyl-tRNA synthetase  57.64 
 
 		 505 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1365  lysyl-tRNA synthetase  55.38 
 
 		 532 aa  561  1.0000000000000001e-159  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.040149  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1561  lysyl-tRNA synthetase  55.78 
 
 		 513 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.274992 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2234  lysyl-tRNA synthetase  54.9 
 
 		 504 aa  563  1.0000000000000001e-159  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1034  lysyl-tRNA synthetase  56.36 
 
 		 515 aa  562  1.0000000000000001e-159  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.269597 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0958  lysyl-tRNA synthetase  56.28 
 
 		 514 aa  561  1.0000000000000001e-159  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0760523 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2028  lysyl-tRNA synthetase  55.58 
 
 		 508 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0288  lysyl-tRNA synthetase  55.73 
 
 		 514 aa  563  1.0000000000000001e-159  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2155  lysyl-tRNA synthetase  55.58 
 
 		 508 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.351617  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1204  lysyl-tRNA synthetase  55.69 
 
 		 518 aa  562  1.0000000000000001e-159  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.325374  normal  0.0127653 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00071  lysyl-tRNA synthetase  55.38 
 
 		 505 aa  560  1e-158  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.381624  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1741  hypothetical protein  57.17 
 
 		 496 aa  560  1e-158  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0163  lysyl-tRNA synthetase  54.51 
 
 		 488 aa  560  1e-158  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000142799  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2723  lysyl-tRNA synthetase  55.58 
 
 		 508 aa  558  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1883  lysyl-tRNA synthetase  55.78 
 
 		 508 aa  560  1e-158  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5248  lysyl-tRNA synthetase  55.29 
 
 		 519 aa  561  1e-158  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.178625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0893  lysyl-tRNA synthetase  56.28 
 
 		 514 aa  561  1e-158  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.246749  normal  0.0933962 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2571  lysyl-tRNA synthetase  55.17 
 
 		 518 aa  559  1e-158  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158431  normal  0.0253603 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3250  lysyl-tRNA synthetase  55.09 
 
 		 515 aa  559  1e-158  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.273416 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1028  lysyl-tRNA synthetase  56.07 
 
 		 510 aa  555  1e-157  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.296051  normal  0.894371 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1700  lysyl-tRNA synthetase  55.38 
 
 		 508 aa  556  1e-157  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.816716  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2207  lysyl-tRNA synthetase  55.38 
 
 		 508 aa  556  1e-157  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2848  lysyl-tRNA synthetase  56.03 
 
 		 501 aa  556  1e-157  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.266623 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1070  lysyl-tRNA synthetase  55.67 
 
 		 516 aa  557  1e-157  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2993  lysyl-tRNA synthetase  55.38 
 
 		 501 aa  555  1e-157  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0726  lysyl-tRNA synthetase  57.14 
 
 		 504 aa  557  1e-157  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000447446  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2591  lysyl-tRNA synthetase  55.38 
 
 		 508 aa  557  1e-157  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1480  lysyl-tRNA synthetase  55.38 
 
 		 508 aa  556  1e-157  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0797  lysyl-tRNA synthetase  56.03 
 
 		 509 aa  556  1e-157  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0164991 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2603  lysyl-tRNA synthetase  55.09 
 
 		 515 aa  558  1e-157  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.494017  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3111  lysyl-tRNA synthetase  55.38 
 
 		 508 aa  556  1e-157  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0600  lysyl-tRNA synthetase  55.38 
 
 		 508 aa  555  1e-157  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.834751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2645  lysyl-tRNA synthetase  55.38 
 
 		 508 aa  556  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.929733  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1501  lysyl-tRNA synthetase  58.3 
 
 		 500 aa  551  1e-156  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1311  lysyl-tRNA synthetase  58.3 
 
 		 500 aa  551  1e-156  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00484413 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1060  lysyl-tRNA synthetase  58.22 
 
 		 499 aa  553  1e-156  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.175669  normal  0.441756 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0883  lysyl-tRNA synthetase  56.62 
 
 		 505 aa  552  1e-156  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3620  lysyl-tRNA synthetase  54.42 
 
 		 516 aa  552  1e-156  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1450  lysyl-tRNA synthetase  55.17 
 
 		 512 aa  553  1e-156  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.499845 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1477  lysyl-tRNA synthetase  55.28 
 
 		 502 aa  553  1e-156  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0701287  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3851  lysyl-tRNA synthetase  56.62 
 
 		 505 aa  552  1e-156  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0982146 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16530  lysyl-tRNA synthetase  57.61 
 
 		 501 aa  554  1e-156  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.530256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0924  lysyl-tRNA synthetase  56.62 
 
 		 505 aa  552  1e-156  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1217  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  55.71 
 
 		 502 aa  549  1e-155  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00362482  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>