More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3409 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3409  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 358 aa  727    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3410  glycosyl transferase group 1  31.27 
 
 		 366 aa  155  8e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3222  glycosyl transferase, group 1  30.3 
 
 		 365 aa  149  6e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  29.68 
 
 		 377 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  28.46 
 
 		 360 aa  106  5e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  27.59 
 
 		 395 aa  102  8e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  27.34 
 
 		 377 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  25.75 
 
 		 361 aa  98.2  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  30.33 
 
 		 371 aa  98.6  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  30.2 
 
 		 371 aa  98.2  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  27.15 
 
 		 380 aa  96.3  7e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  27.9 
 
 		 370 aa  92.8  9e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2609  glycosyl transferase, group 1  30.91 
 
 		 376 aa  92  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0266657  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3891  glycosyl transferase group 1  29.13 
 
 		 377 aa  90.9  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.14972  normal  0.743624 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2159  glycosyl transferase group 1  26.28 
 
 		 420 aa  90.5  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  28.85 
 
 		 371 aa  89.7  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  29.86 
 
 		 398 aa  90.1  6e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2253  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.34 
 
 		 371 aa  89.7  8e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.531555  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01306  Glycosyl transferase, group 1  25.27 
 
 		 366 aa  88.6  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2323  glycosyl transferase, group 1  26.68 
 
 		 378 aa  89  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2126  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.54 
 
 		 366 aa  88.2  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3034  glycosyl transferase, group 1  26.7 
 
 		 360 aa  88.6  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6261  putative glycosyl transferase  27.65 
 
 		 392 aa  87.8  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.204873  normal  0.0540655 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  31.65 
 
 		 399 aa  87.8  3e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2695  glycosyl transferase group 1  29.19 
 
 		 376 aa  87.4  4e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3953  glycosyl transferase group 1  23.66 
 
 		 374 aa  87  4e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.32029  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1787  glycosyl transferase group 1  27.48 
 
 		 383 aa  86.7  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  26.09 
 
 		 385 aa  86.7  6e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0166  glycosyl transferase group 1  23.73 
 
 		 374 aa  85.5  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  27.44 
 
 		 439 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  26.36 
 
 		 376 aa  85.1  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  25.35 
 
 		 403 aa  84.7  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2004  glycosyl transferase, group 1  28.89 
 
 		 403 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6498  glycosyl transferase, group 1  27.82 
 
 		 412 aa  84.7  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4001  glycogen synthase  24.92 
 
 		 382 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0312479  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  28.61 
 
 		 385 aa  84.3  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4075  glycogen synthase  24.92 
 
 		 382 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  25.74 
 
 		 378 aa  83.6  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2725  glycosyl transferase group 1  31.02 
 
 		 380 aa  83.2  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.409624  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1140  glycosyl transferase group 1  28.07 
 
 		 386 aa  83.2  0.000000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.960546  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2820  glycosyl transferase group 1  31.23 
 
 		 380 aa  83.2  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0073  glycosyl transferase, group 1  26.02 
 
 		 448 aa  83.2  0.000000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1534  glycosyl transferase, group 1  28.17 
 
 		 411 aa  82.8  0.000000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00818879  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2639  glycosyl transferase, group 1  29.63 
 
 		 380 aa  82  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.108471  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2773  glycosyl transferase, group 1  28.52 
 
 		 430 aa  82  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0242  glycosyl transferase, group 1  27.39 
 
 		 386 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.19746 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3028  glycosyl transferase family protein  27.1 
 
 		 704 aa  82  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0494  UDP-N-acetylglucosamine  26.48 
 
 		 428 aa  81.3  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  28.3 
 
 		 389 aa  81.6  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1099  glycosyl transferase, group 1  32.24 
 
 		 380 aa  81.6  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.209796  normal  0.0258816 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2637  glycosyl transferase, group 1  26.56 
 
 		 345 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02650  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  26.63 
 
 		 431 aa  81.3  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.298746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0562  glycosyltransferase  27.43 
 
 		 416 aa  81.3  0.00000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.841887  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  32.48 
 
 		 395 aa  80.9  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1166  glycosyl transferase group 1  29.07 
 
 		 370 aa  80.5  0.00000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.365833  normal  0.27899 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1923  glycosyl transferase, group 1  24.93 
 
 		 368 aa  80.5  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.80295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0245  glycosyl transferase group 1  28.48 
 
 		 382 aa  79.7  0.00000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2765  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.79 
 
 		 365 aa  80.1  0.00000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.367187  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11043  glycosyltransferase  25.64 
 
 		 377 aa  79.7  0.00000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.265999  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3285  glycosyl transferase, group 1  40.71 
 
 		 375 aa  79.3  0.00000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.254091  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0587  glycosyl transferase group 1  23.82 
 
 		 387 aa  79.3  0.00000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3347  glycosyl transferase, group 1  40.71 
 
 		 375 aa  79.3  0.00000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0957138  normal  0.0861917 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3296  glycosyl transferase, group 1  40.71 
 
 		 375 aa  79.3  0.00000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.229381 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4231  glycogen synthase  24.04 
 
 		 382 aa  79.3  0.00000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.294207 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  26.76 
 
 		 393 aa  79.3  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1065  glycosyl transferase, group 1  27.48 
 
 		 414 aa  79  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1173  glycogen synthase  26.22 
 
 		 404 aa  79.3  0.0000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0423768 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1045  group 1 glycosyl transferase  25.89 
 
 		 353 aa  78.6  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000151909  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0398  glycosyl transferase group 1  27.53 
 
 		 448 aa  78.2  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.348364  hitchhiker  0.00367672 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3514  glycosyl transferase group 1  32.38 
 
 		 376 aa  78.2  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3098  glycosyl transferase, group 1  32.73 
 
 		 376 aa  78.6  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.034289  normal  0.933214 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2790  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 387 aa  78.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  27.43 
 
 		 436 aa  78.2  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0012  a-glycosyltransferase  25.9 
 
 		 379 aa  78.2  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1382  glycosyl transferase group 1  31 
 
 		 376 aa  78.6  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0731677  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0650  glycosyl transferase, group 1  25.2 
 
 		 439 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.303118  normal  0.416053 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  25.16 
 
 		 419 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3484  glycosyl transferase group 1  27.48 
 
 		 379 aa  77.4  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2961  glycosyl transferase, group 1  35.71 
 
 		 382 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.197137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3236  glycosyl transferase group 1  34.44 
 
 		 374 aa  77.4  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0188616  hitchhiker  0.000126621 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01302  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.5 
 
 		 359 aa  77.4  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.378301  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0407  glycosyl transferase group 1  28.49 
 
 		 750 aa  77.8  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3348  glycosyl transferase group 1  27.64 
 
 		 371 aa  77.8  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3569  glycosyl transferase, group 1  26.73 
 
 		 369 aa  77.4  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.798632  decreased coverage  0.00507344 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1193  glycosyl transferase, group 1  24.15 
 
 		 371 aa  77  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1819  glycosyl transferase group 1  32.24 
 
 		 373 aa  77  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103327  normal  0.199615 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3550  glycosyl transferase, group 1  38.13 
 
 		 378 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.750733 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1233  glycosyl transferase group 1  29.48 
 
 		 388 aa  77  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.979929 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8224  UDP-N-acetylglucosamine  25.19 
 
 		 427 aa  77  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2576  glycosyl transferase group 1  30.56 
 
 		 377 aa  76.6  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.496816  normal  0.101525 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10750  glycosyltransferase  30.12 
 
 		 399 aa  76.6  0.0000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.944872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2492  glycosyl transferase, group 1  27.22 
 
 		 371 aa  76.6  0.0000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.637644  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4580  glycosyl transferase, group 1  26.8 
 
 		 378 aa  76.6  0.0000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3059  glycosyl transferase group 1  35.03 
 
 		 374 aa  76.3  0.0000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000425383  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1189  glycosyl transferase group 1  28 
 
 		 383 aa  76.3  0.0000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1868  putative glycosyltransferase  29.76 
 
 		 376 aa  75.9  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  27.79 
 
 		 414 aa  75.5  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  23.59 
 
 		 382 aa  75.9  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2949  glycosyl transferase group 1  30.24 
 
 		 379 aa  75.5  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0244554  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  23.03 
 
 		 379 aa  75.9  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>