More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3359 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_1388  hypothetical protein  64.88 
 
 
561 aa  766  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  2.98772e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3359  ABC-1 domain protein  100 
 
 
560 aa  1130  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.779537 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1088  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  60.61 
 
 
561 aa  715  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0289446  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0760  2-octaprenylphenol hydroxylase  59 
 
 
561 aa  700  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0902  ABC-1 domain protein  96.43 
 
 
560 aa  1090  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2342  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  47.25 
 
 
563 aa  548  1e-155  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000602733  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0647  hypothetical protein  39.39 
 
 
565 aa  430  1e-119  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  1.86884e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1474  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  37.61 
 
 
561 aa  406  1e-112  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.604813 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2852  ubiquinone biosynthesis protein  37.93 
 
 
559 aa  399  1e-110  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1871  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  36.53 
 
 
568 aa  399  1e-110  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00151  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  37.14 
 
 
558 aa  395  1e-109  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1648  2-octaprenylphenol hydroxylase  36.53 
 
 
559 aa  396  1e-109  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2885  ABC-1 domain protein  37.32 
 
 
582 aa  396  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0017  2-octaprenylphenol hydroxylase  39.31 
 
 
592 aa  397  1e-109  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.300768 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2071  ABC-1 domain protein  37.24 
 
 
581 aa  393  1e-108  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0987216  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5555  2-octaprenylphenol hydroxylase  37.74 
 
 
584 aa  392  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1110  ABC-1 domain protein  36.4 
 
 
599 aa  394  1e-108  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0324  ABC-1 domain protein  37.41 
 
 
581 aa  389  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0390  2-octaprenylphenol hydroxylase  39.36 
 
 
559 aa  389  1e-106  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1807  hypothetical protein  37.25 
 
 
560 aa  383  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2578  2-octaprenylphenol hydroxylase  35.34 
 
 
559 aa  383  1e-105  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152488  normal  0.0679255 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0994  2-octaprenylphenol hydroxylase  37.32 
 
 
559 aa  382  1e-105  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.380493  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1733  hypothetical protein  37.16 
 
 
557 aa  381  1e-104  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00187554  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12230  2-octaprenylphenol hydroxylase  36.19 
 
 
559 aa  369  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0168037  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0233  2-octaprenylphenol hydroxylase  36.48 
 
 
554 aa  369  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4176  hypothetical protein  37.87 
 
 
582 aa  372  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.118279  normal  0.965064 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1172  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  36.25 
 
 
558 aa  368  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3247  ABC-1 domain protein  35.84 
 
 
558 aa  365  1e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  4.74003e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1598  hypothetical protein  35.37 
 
 
591 aa  365  1e-99  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.429743  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2519  hypothetical protein  36.47 
 
 
582 aa  359  6e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.416254 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1612  ABC-1 domain protein  34.76 
 
 
557 aa  359  9e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.504596  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1973  ABC-1 domain protein  35.98 
 
 
547 aa  358  2e-97  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.921372  normal  0.103811 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4898  ABC1 family protein  32.8 
 
 
558 aa  357  3e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1005  hypothetical protein  33.52 
 
 
564 aa  357  3e-97  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0249187 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2586  ABC-1 domain protein  35.9 
 
 
562 aa  351  2e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0295  ABC-1 domain protein  32.09 
 
 
558 aa  347  3e-94  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1536  ABC-1 domain protein  38.94 
 
 
556 aa  347  3e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2561  ABC-1 domain protein  33.69 
 
 
558 aa  341  3e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1207  ABC transporter  33.09 
 
 
556 aa  340  6e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.694462  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1464  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  35.78 
 
 
555 aa  338  2e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00546242  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2664  2-octaprenylphenol hydroxylase  33.39 
 
 
573 aa  332  2e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.948881  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3956  ABC-1 domain protein  37.25 
 
 
552 aa  332  2e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.186201 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0578  hypothetical protein  38.1 
 
 
560 aa  329  7e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2205  hypothetical protein  33.58 
 
 
552 aa  323  5e-87  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1333  ABC-1 domain protein  34.31 
 
 
543 aa  320  5e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.333757 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0825  ABC-1 domain protein  29.93 
 
 
558 aa  320  5e-86  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3377  ABC-1 domain protein  35.62 
 
 
557 aa  319  8e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.118171 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1021  hypothetical protein  33.94 
 
 
556 aa  318  2e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.396117  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0769  ABC-1 domain protein  33.94 
 
 
543 aa  318  2e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.477502 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2852  hypothetical protein  31.69 
 
 
537 aa  316  6e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2537  hypothetical protein  31.52 
 
 
537 aa  316  8e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5113  ABC-1 domain protein  34.19 
 
 
544 aa  315  1e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0631  hypothetical protein  37.99 
 
 
558 aa  314  3e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.206757 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5305  ABC-1 domain protein  33.81 
 
 
565 aa  312  1e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1693  ABC-1 domain protein  33.81 
 
 
565 aa  312  1e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12515  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2950  ABC-1 domain protein  33.01 
 
 
549 aa  311  2e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0240  ABC-1 domain protein  37.42 
 
 
544 aa  310  7e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1337  2-octaprenylphenol hydroxylase  34.78 
 
 
549 aa  308  1e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3020  hypothetical protein  33.46 
 
 
544 aa  306  5e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.087256 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0856  hypothetical protein  32.49 
 
 
555 aa  306  9e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2240  ABC-1 domain protein  36.77 
 
 
557 aa  305  2e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.319336  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2150  ABC-1 domain protein  36.58 
 
 
557 aa  303  6e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.181383  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1843  hypothetical protein  34.89 
 
 
549 aa  301  2e-80  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.295975  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3335  ABC-1 domain protein  31.17 
 
 
549 aa  298  2e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0521538  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1699  2-octaprenylphenol hydroxylase  36.86 
 
 
557 aa  297  3e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2767  ABC-1 domain protein  30.99 
 
 
549 aa  296  7e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0342  ABC1 family protein  31.72 
 
 
551 aa  296  8e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1817  hypothetical protein  29.88 
 
 
571 aa  295  1e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.457399  normal  0.0626146 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1941  ABC-1 domain protein  31.71 
 
 
549 aa  295  2e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2681  hypothetical protein  29.61 
 
 
547 aa  294  3e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.259023 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3494  2-octaprenylphenol hydroxylase  34.99 
 
 
530 aa  292  1e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3964  ABC-1 domain-containing protein  32.93 
 
 
561 aa  291  3e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.871344  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0868  hypothetical protein  35.03 
 
 
582 aa  290  5e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  9.24249e-08  normal  0.0678292 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02769  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  33.94 
 
 
557 aa  290  6e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368527  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0400  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  35.37 
 
 
546 aa  290  6e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3417  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  34.27 
 
 
547 aa  289  8e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0175  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  32.3 
 
 
551 aa  289  8e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.356136  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1760  ABC-1 domain-containing protein  29.72 
 
 
547 aa  288  3e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.794373  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3425  hypothetical protein  31.13 
 
 
563 aa  288  3e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.416231  normal  0.872879 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2106  hypothetical protein  33.33 
 
 
559 aa  285  2e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00766182 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3415  hypothetical protein  32.99 
 
 
560 aa  284  3e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00362763 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0745  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  33.67 
 
 
547 aa  282  9e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1207  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  35.43 
 
 
553 aa  282  1e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.842555  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3381  hypothetical protein  32.08 
 
 
578 aa  281  2e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1129  hypothetical protein  31.78 
 
 
586 aa  280  3e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.755278  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2972  hypothetical protein  34.92 
 
 
549 aa  281  3e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2820  hypothetical protein  34.92 
 
 
549 aa  281  3e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2998  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  33.7 
 
 
543 aa  278  2e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0521  2-octaprenylphenol hydroxylase  37.9 
 
 
527 aa  278  2e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.273302  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0159  ABC-1 domain protein  32.31 
 
 
561 aa  276  8e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0321  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  32.66 
 
 
546 aa  276  8e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2799  hypothetical protein  32.44 
 
 
546 aa  276  1e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0199828 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0071  2-octaprenylphenol hydroxylase  33.61 
 
 
553 aa  275  1e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0155  ABC-1 domain protein  32.1 
 
 
584 aa  275  2e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00185412  normal  0.0113585 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0222  ABC-1 domain protein  31.11 
 
 
571 aa  275  2e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.164391  normal  0.703829 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0385  2-octaprenylphenol hydroxylase  36.44 
 
 
534 aa  274  3e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.312761  normal  0.126935 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0101  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  37.36 
 
 
561 aa  273  6e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.207696  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0176  2-octaprenylphenol hydroxylase  29.45 
 
 
547 aa  272  1e-71  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0626  ABC-1 domain protein  31.66 
 
 
585 aa  272  1e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00564  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  34.63 
 
 
544 aa  270  5e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>