More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3308 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_1366  preprotein translocase subunit SecY  79.63 
 
 
437 aa  728    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000833152  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2837  preprotein translocase subunit SecY  84.83 
 
 
435 aa  768    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1086  preprotein translocase subunit SecY  86.9 
 
 
435 aa  777    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.135642  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0953  preprotein translocase subunit SecY  97.7 
 
 
435 aa  853    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0415377  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0646  preprotein translocase subunit SecY  85.06 
 
 
435 aa  768    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00379524  hitchhiker  0.000000811889 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3308  preprotein translocase subunit SecY  100 
 
 
435 aa  868    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000602472 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0700  preprotein translocase subunit SecY  82.53 
 
 
435 aa  735    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.418561  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1575  preprotein translocase subunit SecY  66.21 
 
 
435 aa  627  1e-178  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0569624  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0721  preprotein translocase subunit SecY  65.75 
 
 
435 aa  605  9.999999999999999e-173  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0728  preprotein translocase, SecY subunit  65.21 
 
 
429 aa  596  1e-169  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00054251  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0099  preprotein translocase subunit SecY  58.85 
 
 
437 aa  550  1e-155  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0986849 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1931  preprotein translocase subunit SecY  61.74 
 
 
445 aa  549  1e-155  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.776856  normal  0.537809 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0867  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  61.02 
 
 
442 aa  545  1e-154  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000152006  hitchhiker  0.00837403 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2237  preprotein translocase subunit SecY  59.63 
 
 
437 aa  541  1e-153  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.104557  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1953  preprotein translocase subunit SecY  60.1 
 
 
447 aa  538  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1745  preprotein translocase subunit SecY  58.16 
 
 
437 aa  539  9.999999999999999e-153  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261464  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2038  preprotein translocase subunit SecY  59.86 
 
 
447 aa  536  1e-151  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1926  preprotein translocase subunit SecY  60.1 
 
 
447 aa  529  1e-149  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.228643  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2045  preprotein translocase, SecY subunit  59.77 
 
 
435 aa  525  1e-148  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000027617  hitchhiker  0.00154147 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2754  preprotein translocase, SecY subunit  59.62 
 
 
437 aa  524  1e-147  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0680  preprotein translocase subunit SecY  55.9 
 
 
437 aa  510  1e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3985  preprotein translocase, SecY subunit  56.33 
 
 
448 aa  501  1e-140  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00342615  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0425  preprotein translocase subunit SecY  57.35 
 
 
437 aa  494  9.999999999999999e-139  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.65116  normal  0.157207 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0517  preprotein translocase, SecY subunit  56.19 
 
 
443 aa  486  1e-136  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.120445  unclonable  0.0000000000266535 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0347  preprotein translocase, SecY subunit  56.19 
 
 
443 aa  486  1e-136  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.742267  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2305  preprotein translocase subunit SecY  55.84 
 
 
453 aa  483  1e-135  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0325321  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0315  preprotein translocase subunit SecY  55.06 
 
 
437 aa  481  1e-134  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0598799  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3318  preprotein translocase subunit SecY  55.29 
 
 
441 aa  477  1e-133  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.150394  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0474  preprotein translocase subunit SecY  53.86 
 
 
443 aa  472  1e-132  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.733359  hitchhiker  0.00000433507 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0504  preprotein translocase subunit SecY  53.86 
 
 
443 aa  471  1e-132  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000390206  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4729  preprotein translocase subunit SecY  53.86 
 
 
443 aa  473  1e-132  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0376135  normal  0.430849 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0339  preprotein translocase subunit SecY  53.97 
 
 
440 aa  474  1e-132  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000142446  unclonable  0.0000000706243 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0343  preprotein translocase, SecY subunit  54.27 
 
 
444 aa  473  1e-132  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000192463  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0507  preprotein translocase subunit SecY  53.86 
 
 
443 aa  473  1e-132  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0640452  normal  0.0135524 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2756  preprotein translocase, SecY subunit  52.68 
 
 
443 aa  472  1e-132  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.373135  normal  0.477854 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0739  preprotein translocase subunit SecY  53.88 
 
 
440 aa  470  1.0000000000000001e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00521081  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0646  preprotein translocase, SecY subunit  53.4 
 
 
444 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.617938  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4528  preprotein translocase subunit SecY  53.4 
 
 
444 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.447133  normal  0.242735 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4298  preprotein translocase subunit SecY  54.65 
 
 
446 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000258427  unclonable  0.0000000000837901 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5059  preprotein translocase subunit SecY  53.63 
 
 
442 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000898122  normal  0.284155 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4670  preprotein translocase subunit SecY  54.65 
 
 
446 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000509869  unclonable  0.0000000121988 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0178  preprotein translocase subunit SecY  54.63 
 
 
446 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000408952  hitchhiker  0.00214614 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4223  preprotein translocase subunit SecY  56.93 
 
 
436 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0505149  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5050  preprotein translocase subunit SecY  53.38 
 
 
444 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.478224  normal  0.981585 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0233  preprotein translocase subunit SecY  53.92 
 
 
446 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000181445  unclonable  0.0000105897 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4778  preprotein translocase subunit SecY  54.08 
 
 
444 aa  467  9.999999999999999e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000420552 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3889  preprotein translocase subunit SecY  52.69 
 
 
442 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000822061  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2149  preprotein translocase, SecY subunit  56.47 
 
 
448 aa  465  9.999999999999999e-131  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0576412  normal  0.122998 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00958  preprotein translocase subunit SecY  53.16 
 
 
434 aa  468  9.999999999999999e-131  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0058755  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0857  preprotein translocase subunit SecY  53.16 
 
 
442 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0299  preprotein translocase subunit SecY  56.09 
 
 
440 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000631755  hitchhiker  0.00000321163 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0441  preprotein translocase subunit SecY  53.27 
 
 
443 aa  465  9.999999999999999e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09050  preprotein translocase subunit SecY  53.16 
 
 
442 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.224184 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1384  preprotein translocase subunit SecY  52.76 
 
 
443 aa  464  1e-129  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.378018 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0787  preprotein translocase subunit SecY  54.21 
 
 
442 aa  464  1e-129  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0142235  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3423  preprotein translocase subunit SecY  55.2 
 
 
436 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.23916 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1565  preprotein translocase subunit SecY  52.53 
 
 
443 aa  461  9.999999999999999e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.112443  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0621  preprotein translocase subunit SecY  54.07 
 
 
439 aa  458  9.999999999999999e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.468859  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1006  preprotein translocase subunit SecY  51.95 
 
 
446 aa  461  9.999999999999999e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38875  hitchhiker  0.00669682 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0333  preprotein translocase, SecY subunit  52.41 
 
 
445 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.110878  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001722  preprotein translocase SecY subunit  53.95 
 
 
444 aa  455  1e-127  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000228975  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0393  preprotein translocase subunit SecY  54.21 
 
 
439 aa  457  1e-127  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0413341  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0401  preprotein translocase subunit SecY  54.21 
 
 
439 aa  457  1e-127  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1009  preprotein translocase subunit SecY  53.16 
 
 
439 aa  457  1e-127  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00114462  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0168  preprotein translocase subunit SecY  53.44 
 
 
446 aa  457  1e-127  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000114541  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1042  preprotein translocase subunit SecY  53.96 
 
 
439 aa  457  1e-127  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3929  preprotein translocase subunit SecY  54.57 
 
 
436 aa  454  1.0000000000000001e-126  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2352  preprotein translocase subunit SecY  52.91 
 
 
441 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.299181  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0251  preprotein translocase subunit SecY  53.92 
 
 
446 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0204  preprotein translocase subunit SecY  53.92 
 
 
446 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000662692  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0340  preprotein translocase subunit SecY  54.08 
 
 
443 aa  453  1.0000000000000001e-126  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00542322  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2305  preprotein translocase subunit SecY  53.66 
 
 
437 aa  454  1.0000000000000001e-126  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.773218 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0190  preprotein translocase subunit SecY  53.68 
 
 
446 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000711222  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0219  preprotein translocase subunit SecY  53.68 
 
 
446 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000744124  unclonable  0.0000000000304117 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0214  preprotein translocase subunit SecY  53.68 
 
 
446 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000092283  hitchhiker  0.00772115 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00750  preprotein translocase subunit SecY  53.72 
 
 
444 aa  452  1.0000000000000001e-126  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2986  preprotein translocase subunit SecY  51.38 
 
 
448 aa  451  1.0000000000000001e-126  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.135734  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0219  preprotein translocase subunit SecY  53.68 
 
 
446 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000110874  hitchhiker  0.00000000176689 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1928  preprotein translocase, SecY subunit  53.1 
 
 
445 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1213  preprotein translocase subunit SecY  51.26 
 
 
446 aa  451  1e-125  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2154  preprotein translocase subunit SecY  53.26 
 
 
444 aa  450  1e-125  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000317062  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4036  preprotein translocase subunit SecY  53.44 
 
 
446 aa  448  1e-125  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000184742  unclonable  0.00000000000435138 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0560  preprotein translocase, SecY subunit  52.1 
 
 
442 aa  449  1e-125  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0216  preprotein translocase subunit SecY  53.44 
 
 
446 aa  448  1e-125  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000065492  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4256  preprotein translocase subunit SecY  53.16 
 
 
443 aa  451  1e-125  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193642  unclonable  0.00000000000448849 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3739  preprotein translocase subunit SecY  53.94 
 
 
446 aa  449  1e-125  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000605107  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2668  preprotein translocase subunit SecY  54.31 
 
 
447 aa  450  1e-125  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5050  preprotein translocase subunit SecY  53.83 
 
 
437 aa  448  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.34117  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1176  preprotein translocase subunit SecY  51.26 
 
 
446 aa  450  1e-125  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0379017  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0220  preprotein translocase subunit SecY  53.44 
 
 
446 aa  448  1e-125  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000798254  hitchhiker  0.00367272 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0080  preprotein translocase subunit SecY  54.35 
 
 
441 aa  451  1e-125  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0404503  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4150  preprotein translocase subunit SecY  53.44 
 
 
446 aa  448  1e-125  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000158721  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1976  preprotein translocase subunit SecY  51.26 
 
 
446 aa  450  1e-125  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.923807  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1374  preprotein translocase, SecY subunit  52.09 
 
 
444 aa  447  1.0000000000000001e-124  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.285774  normal  0.105212 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3647  preprotein translocase subunit SecY  51.61 
 
 
443 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2304  preprotein translocase subunit SecY  55.38 
 
 
451 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1863  preprotein translocase subunit SecY  50.57 
 
 
446 aa  446  1.0000000000000001e-124  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.271597  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0718  preprotein translocase subunit SecY  50.35 
 
 
448 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.214912  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2999  preprotein translocase subunit SecY  53.55 
 
 
448 aa  444  1e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0377089  normal  0.071315 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1450  preprotein translocase subunit SecY  51.49 
 
 
446 aa  442  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.337945  normal  0.16685 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>