More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3307 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_3307  adenylate kinase  100 
 
 
214 aa  429  1e-119  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000165316 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0954  adenylate kinase  96.26 
 
 
214 aa  412  1e-114  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.338741  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1087  adenylate kinase  68.54 
 
 
217 aa  304  7e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.171059  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0722  adenylate kinase  64.62 
 
 
216 aa  284  9e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.940289  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2836  adenylate kinase  62.15 
 
 
217 aa  273  1.0000000000000001e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0701  adenylate kinase  61.95 
 
 
220 aa  271  8.000000000000001e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0297411  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1367  adenylate kinase  60.85 
 
 
214 aa  270  1e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00134255  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1338  adenylate kinase  59.15 
 
 
213 aa  269  2e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.389991  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1237  adenylate kinase  58.69 
 
 
214 aa  269  2.9999999999999997e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000920741  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0647  adenylate kinase  62.5 
 
 
222 aa  266  1e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00892777  hitchhiker  0.00000105788 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0132  adenylate kinase  58.17 
 
 
216 aa  263  2e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00113447  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1576  adenylate kinases  59.43 
 
 
213 aa  263  2e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00457177  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1718  adenylate kinase  55.4 
 
 
213 aa  257  8e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0086  adenylate kinase  57.28 
 
 
215 aa  257  1e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00306231  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6028  adenylate kinase  55.87 
 
 
217 aa  252  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.16698 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1725  adenylate kinase  56.6 
 
 
215 aa  253  2.0000000000000002e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000477664  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0125  adenylate kinase  56.25 
 
 
216 aa  251  8.000000000000001e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000166818  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0126  adenylate kinase  56.73 
 
 
216 aa  251  8.000000000000001e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000253561  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0603  adenylate kinase  55.4 
 
 
217 aa  251  8.000000000000001e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0128  adenylate kinase  56.73 
 
 
217 aa  250  1e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0162  adenylate kinase  56.25 
 
 
216 aa  249  2e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000036841  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0131  adenylate kinase  56.25 
 
 
216 aa  249  2e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000890423  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5174  adenylate kinase  56.25 
 
 
216 aa  249  3e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000620291  unclonable  1.1738e-25 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1810  adenylate kinase  52.15 
 
 
215 aa  248  6e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0152  adenylate kinase  55.77 
 
 
216 aa  248  6e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00506864  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0131  adenylate kinase  56.94 
 
 
216 aa  246  2e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000156427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0127  adenylate kinase  56.94 
 
 
216 aa  246  2e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000429626  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0125  adenylate kinase  56.94 
 
 
216 aa  246  2e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0141617  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0131  adenylate kinase  56.94 
 
 
216 aa  246  2e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000118062  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2297  adenylate kinase  52.15 
 
 
215 aa  246  2e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2256  adenylate kinase  52.15 
 
 
215 aa  246  2e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0268599  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0144  adenylate kinase  56.94 
 
 
216 aa  246  2e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.24496e-61 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0583  adenylate kinase  53.52 
 
 
217 aa  243  9.999999999999999e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3646  adenylate kinase  52.63 
 
 
217 aa  242  3e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000547337  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1163  adenylate kinase  57.35 
 
 
211 aa  242  3.9999999999999997e-63  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0529729  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0443  adenylate kinase  55.66 
 
 
217 aa  241  5e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0215  Adenylate kinase  55.14 
 
 
214 aa  241  6e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0779  adenylate kinase  51.42 
 
 
214 aa  240  1e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000192318  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01370  Adenylate kinase  51.4 
 
 
216 aa  239  2e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000615524  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1925  adenylate kinase  54.67 
 
 
224 aa  239  2e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2439  adenylate kinase  55.14 
 
 
217 aa  239  2.9999999999999997e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0887  adenylate kinase  53.3 
 
 
217 aa  238  4e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.037956  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0327  adenylate kinase  53.99 
 
 
217 aa  238  5e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000417947 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1504  adenylate kinases  51.92 
 
 
215 aa  237  8e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0025  adenylate kinase  52.36 
 
 
215 aa  236  2e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000610793  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2693  adenylate kinase  52.94 
 
 
216 aa  236  2e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2378  adenylate kinase  52.94 
 
 
216 aa  236  2e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5145  adenylate kinase  53.3 
 
 
219 aa  234  8e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.498584 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2066  adenylate kinase  53 
 
 
214 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16700  adenylate kinase  51.38 
 
 
215 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.528673  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1207  adenylate kinase  52.8 
 
 
217 aa  231  5e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00730136 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1452  adenylate kinase  51.38 
 
 
215 aa  231  7.000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2690  adenylate kinase  51.89 
 
 
216 aa  230  1e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0131862  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2713  Adenylate kinase  52.45 
 
 
423 aa  230  1e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.690631  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1107  adenylate kinase  52.58 
 
 
216 aa  229  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.211555 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2924  adenylate kinase  47.17 
 
 
217 aa  229  3e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1753  adenylate kinase  50 
 
 
213 aa  229  3e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000121762  normal  0.119807 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3212  adenylate kinase  51.13 
 
 
217 aa  228  5e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3359  adenylate kinase  51.83 
 
 
215 aa  228  7e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.848875  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1111  adenylate kinase  52.36 
 
 
214 aa  227  1e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000158184  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1117  adenylate kinase  50.98 
 
 
218 aa  226  2e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.018146  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0763  adenylate kinase  50.22 
 
 
221 aa  226  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.758811  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2312  adenylate kinase  52.79 
 
 
215 aa  226  2e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00140159  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2987  adenylate kinase  52.38 
 
 
219 aa  225  3e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.169242  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39280  Adenylate kinase  51.83 
 
 
215 aa  226  3e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0748  adenylate kinase  50.89 
 
 
220 aa  226  3e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.552209  normal  0.468478 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3199  adenylate kinase  50.22 
 
 
221 aa  225  4e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166103  normal  0.776204 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5879  adenylate kinase  50.45 
 
 
220 aa  225  4e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.276122  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0857  adenylate kinase  50.91 
 
 
218 aa  225  4e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.258146  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2277  adenylate kinase  50.45 
 
 
220 aa  224  6e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00000360285  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1049  adenylate kinase  50.45 
 
 
220 aa  224  6e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000082609  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0927  adenylate kinase  50.45 
 
 
220 aa  224  6e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0924  adenylate kinase  50.45 
 
 
220 aa  224  6e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.123931  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1080  adenylate kinase  50.45 
 
 
220 aa  224  6e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0446063  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2154  adenylate kinase  50.45 
 
 
220 aa  224  6e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.181354  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0572  adenylate kinase  50.45 
 
 
220 aa  224  6e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000148537  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1864  adenylate kinase  52.63 
 
 
216 aa  224  6e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.492402  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1936  adenylate kinase  50.45 
 
 
220 aa  224  8e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0745182  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2572  adenylate kinase  50.45 
 
 
220 aa  224  8e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.601307 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2548  adenylate kinase  50.45 
 
 
220 aa  224  8e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0535  adenylate kinase  49.78 
 
 
221 aa  223  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.180208  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0739  adenylate kinase  49.55 
 
 
220 aa  223  2e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.139033  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4294  adenylate kinase  50 
 
 
217 aa  223  2e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00487166 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1462  adenylate kinase  51.2 
 
 
219 aa  223  2e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000718997  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1490  adenylate kinase  51.18 
 
 
227 aa  223  2e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.480063  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2847  adenylate kinase  53.11 
 
 
217 aa  221  4.9999999999999996e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.821791  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0952  adenylate kinase  48.2 
 
 
225 aa  221  4.9999999999999996e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.519364  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2466  adenylate kinase  50 
 
 
220 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041386 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3902  adenylate kinase  50 
 
 
217 aa  220  9.999999999999999e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2952  adenylate kinase  51.89 
 
 
218 aa  220  9.999999999999999e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1920  adenylate kinase  51.89 
 
 
218 aa  220  9.999999999999999e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2596  adenylate kinase  50 
 
 
220 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.69324  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4300  adenylate kinase  49.53 
 
 
217 aa  219  1.9999999999999999e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1506  adenylate kinase  49.77 
 
 
216 aa  218  5e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.614097  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0815  adenylate kinase  58.82 
 
 
215 aa  218  5e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4216  adenylate kinase  49.77 
 
 
216 aa  218  5e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.584278 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2058  adenylate kinase  49.77 
 
 
215 aa  218  6e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000332952  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1332  adenylate kinase  51.16 
 
 
215 aa  218  7e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.376737 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2235  adenylate kinase  48.87 
 
 
218 aa  218  7e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00391254  hitchhiker  0.0000168537 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1070  adenylate kinase  49.77 
 
 
216 aa  218  7.999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.283029  normal  0.107455 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>