More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3300 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3300  ribosomal protein L17  100 
 
 		 168 aa  331  2e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0299881 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0654  50S ribosomal protein L17  77.02 
 
 		 178 aa  232  2.0000000000000002e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.686686  hitchhiker  0.0000313712 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2830  50S ribosomal protein L17  69.23 
 
 		 175 aa  227  6e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215711  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1093  50S ribosomal protein L17  83.59 
 
 		 184 aa  226  9e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0961  ribosomal protein L17  100 
 
 		 144 aa  212  1.9999999999999998e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.463077  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1374  50S ribosomal protein L17  77.6 
 
 		 124 aa  203  1e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00863011  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0707  50S ribosomal protein L17  74.8 
 
 		 127 aa  197  7e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000951753  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0729  50S ribosomal protein L17  69.7 
 
 		 155 aa  193  8.000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1583  ribosomal protein L17  55.56 
 
 		 151 aa  172  1.9999999999999998e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.296544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0734  50S ribosomal protein L17  66.38 
 
 		 208 aa  160  6e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2991  50S ribosomal protein L17  55.24 
 
 		 141 aa  157  6e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0631685  normal  0.808566 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0723  50S ribosomal protein L17  57.46 
 
 		 141 aa  157  6e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.556575  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1869  50S ribosomal protein L17  59.38 
 
 		 141 aa  156  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1921  50S ribosomal protein L17  62.18 
 
 		 146 aa  154  4e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.195833  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0328  50S ribosomal protein L17  55.4 
 
 		 138 aa  154  4e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.997979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1011  50S ribosomal protein L17  60.16 
 
 		 141 aa  154  5.0000000000000005e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.264601 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0896  50S ribosomal protein L17  66.97 
 
 		 112 aa  154  7e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000178462  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1933  50S ribosomal protein L17  54.55 
 
 		 140 aa  153  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0721548  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1357  50S ribosomal protein L17  59.38 
 
 		 140 aa  152  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139721  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2430  50S ribosomal protein L17  63.96 
 
 		 112 aa  152  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1455  50S ribosomal protein L17  59.38 
 
 		 140 aa  152  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.026202  normal  0.30678 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1653  50S ribosomal protein L17P  58.59 
 
 		 143 aa  152  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2992  50S ribosomal protein L17  49.34 
 
 		 142 aa  150  5e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.40506 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1981  50S ribosomal protein L17  58.54 
 
 		 142 aa  150  5.9999999999999996e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1639  50S ribosomal protein L17  55.04 
 
 		 137 aa  150  5.9999999999999996e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0620252  normal  0.0662611 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0315  ribosomal protein L17  66.97 
 
 		 112 aa  150  1e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.123635  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1208  50S ribosomal protein L17  58.54 
 
 		 142 aa  150  1e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178196  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1171  50S ribosomal protein L17  58.54 
 
 		 142 aa  150  1e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.198804  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0320  ribosomal protein L17  58.12 
 
 		 128 aa  147  5e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2663  50S ribosomal protein L17  59.66 
 
 		 140 aa  147  6e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0402474  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2040  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 140 aa  146  1.0000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.631241  normal  0.819045 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2761  ribosomal protein L17  49.66 
 
 		 139 aa  146  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.336822 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2617  50S ribosomal protein L17  52.8 
 
 		 172 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0618  50S ribosomal protein L17  56.25 
 
 		 138 aa  145  2.0000000000000003e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2303  ribosomal protein L17  61.82 
 
 		 113 aa  145  4.0000000000000006e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0265603  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0873  50S ribosomal protein L17P  60 
 
 		 126 aa  144  4.0000000000000006e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000802536  normal  0.0321624 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0280  50S ribosomal protein L17  51.35 
 
 		 141 aa  144  6e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.39249 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0484  50S ribosomal protein L17P  56.41 
 
 		 137 aa  144  8.000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4478  ribosomal protein L17  53.97 
 
 		 229 aa  143  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0807204  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0079  50S ribosomal protein L17  57.26 
 
 		 129 aa  143  1e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0451  50S ribosomal protein L17  61.26 
 
 		 112 aa  142  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000198381  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3153  50S ribosomal protein L17  57.26 
 
 		 131 aa  142  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5153  ribosomal protein L17  62.5 
 
 		 179 aa  142  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.186095 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0135  50S ribosomal protein L17  58.97 
 
 		 120 aa  142  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0310  50S ribosomal protein L17  53.79 
 
 		 138 aa  142  3e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.43624 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3290  50S ribosomal protein L17  57.26 
 
 		 131 aa  142  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0257  50S ribosomal protein L17  58.62 
 
 		 131 aa  141  4e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1570  50S ribosomal protein L17  52.52 
 
 		 138 aa  141  4e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.207942  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3733  50S ribosomal protein L17  58.62 
 
 		 131 aa  141  4e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00317992  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0254  ribosomal protein L17  60.55 
 
 		 112 aa  141  4e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000174355  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0077  50S ribosomal protein L17  57.26 
 
 		 131 aa  141  5e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000148079 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1939  50S ribosomal protein L17  58.12 
 
 		 168 aa  140  6e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2992  50S ribosomal protein L17  56.41 
 
 		 132 aa  140  9e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4773  50S ribosomal protein L17  52.85 
 
 		 140 aa  139  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000039604 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4030  50S ribosomal protein L17  58.62 
 
 		 131 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.544073  hitchhiker  0.000000000826999 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0222  50S ribosomal protein L17  58.62 
 
 		 131 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00692395  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0431  50S ribosomal protein L17P  53.54 
 
 		 129 aa  139  9.999999999999999e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.209959 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1389  50S ribosomal protein L17  52.67 
 
 		 138 aa  140  9.999999999999999e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.814135  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2299  ribosomal protein L17  55.56 
 
 		 126 aa  139  9.999999999999999e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.244707  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1740  50S ribosomal protein L17  50.34 
 
 		 139 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.219561  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0346  50S ribosomal protein L17  54.14 
 
 		 133 aa  140  9.999999999999999e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.239558  hitchhiker  0.000393302 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0386  50S ribosomal protein L17  50.34 
 
 		 139 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.592753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3159  50S ribosomal protein L17  51.47 
 
 		 136 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.286053  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4664  50S ribosomal protein L17  57.76 
 
 		 132 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0078942  unclonable  0.00000000898737 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3270  50S ribosomal protein L17  55.56 
 
 		 132 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368321 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4144  50S ribosomal protein L17  58.62 
 
 		 131 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0430199  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2684  50S ribosomal protein L17  62.39 
 
 		 113 aa  140  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2369  50S ribosomal protein L17  62.39 
 
 		 113 aa  140  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0521735  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0225  50S ribosomal protein L17  58.62 
 
 		 131 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000697417  unclonable  0.0000000000243576 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0220  50S ribosomal protein L17  58.62 
 
 		 131 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.827106  hitchhiker  0.00534003 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0225  50S ribosomal protein L17  58.62 
 
 		 131 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00200452  normal  0.0638706 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4293  50S ribosomal protein L17  57.76 
 
 		 132 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.285077  hitchhiker  0.0000000104065 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0225  50S ribosomal protein L17  58.62 
 
 		 131 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0682368  unclonable  0.0000000000471873 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2138  50S ribosomal protein L17  50.39 
 
 		 138 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.968449 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2175  50S ribosomal protein L17  50.39 
 
 		 138 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.283997 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2625  ribosomal protein L17  49.07 
 
 		 168 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0210  50S ribosomal protein L17  57.76 
 
 		 130 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000848705  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2923  50S ribosomal protein L17  55.56 
 
 		 132 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000719961 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2453  50S ribosomal protein L17  50.39 
 
 		 138 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0612359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01460  ribosomal protein L17  60.91 
 
 		 114 aa  139  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000310561  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0564  50S ribosomal protein L17  52.71 
 
 		 139 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.684509  normal  0.93978 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0139  50S ribosomal protein L17  57.26 
 
 		 120 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000316871  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1961  50S ribosomal protein L17  58.12 
 
 		 158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2509  50S ribosomal protein L17  53.12 
 
 		 139 aa  138  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.745035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1918  50S ribosomal protein L17  57.26 
 
 		 162 aa  138  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2046  50S ribosomal protein L17  57.26 
 
 		 164 aa  138  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0786511  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0184  50S ribosomal protein L17  57.76 
 
 		 130 aa  138  3e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000125039  hitchhiker  0.00140604 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0239  50S ribosomal protein L17  56.9 
 
 		 131 aa  138  3e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00616795  unclonable  0.00000909756 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0630  ribosomal protein L17  48.07 
 
 		 183 aa  138  4.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2190  50S ribosomal protein L17  48.53 
 
 		 136 aa  137  6e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.407841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5045  50S ribosomal protein L17  51.91 
 
 		 137 aa  137  6e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0785  50S ribosomal protein L17  53.91 
 
 		 140 aa  137  7e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.694499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0133  50S ribosomal protein L17  56.3 
 
 		 120 aa  137  7.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000340653  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0138  50S ribosomal protein L17  56.3 
 
 		 120 aa  137  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000943635  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0159  50S ribosomal protein L17  56.3 
 
 		 120 aa  137  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000799248  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0132  50S ribosomal protein L17  56.3 
 
 		 120 aa  137  7.999999999999999e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000831433  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0138  50S ribosomal protein L17  56.3 
 
 		 120 aa  137  7.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000121438  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0151  50S ribosomal protein L17  56.3 
 
 		 120 aa  137  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.34385e-50 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0169  50S ribosomal protein L17  56.3 
 
 		 120 aa  137  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000157984  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0196  50S ribosomal protein L17  57.76 
 
 		 131 aa  137  7.999999999999999e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00364658  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>