More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3243 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_0294  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.59 
 
 
1071 aa  786    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.565561 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3243  PAS sensor protein  100 
 
 
1323 aa  2699    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1017  multi-sensor hybrid histidine kinase  89.27 
 
 
1323 aa  2403    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0385374  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1117  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  58.7 
 
 
770 aa  573  1e-161  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1502  Histidine kinase  41.6 
 
 
919 aa  516  1e-144  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1498  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41.32 
 
 
1070 aa  502  1e-140  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.308131  normal  0.537019 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3738  Na+/proline symporter-like protein  38.72 
 
 
950 aa  499  1e-139  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2991  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41.73 
 
 
1069 aa  497  1e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2900  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.73 
 
 
1069 aa  496  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.095908  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1429  hypothetical protein  48.33 
 
 
910 aa  492  1e-137  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1230  serine phosphatase  46.95 
 
 
1100 aa  480  1e-134  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.081901 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2045  histidine kinase  41.3 
 
 
906 aa  481  1e-134  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.189516  normal  0.433786 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2045  putative GAF sensor protein  44.53 
 
 
1079 aa  477  1e-133  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0456906  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2030  histidine kinase  39.44 
 
 
927 aa  476  1e-132  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.182465 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1631  sensor histidine kinase  40.75 
 
 
903 aa  467  9.999999999999999e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.857286 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2805  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.33 
 
 
1070 aa  466  1e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21700  putative two-component sensor  31.9 
 
 
1159 aa  463  1e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1850  putative two-component sensor  31.9 
 
 
1159 aa  462  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.460329  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2650  ATP-binding region ATPase domain protein  39.92 
 
 
913 aa  456  1e-127  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.574534  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1897  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  40.87 
 
 
1088 aa  457  1e-127  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3978  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.97 
 
 
1152 aa  454  1.0000000000000001e-126  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.508831  normal  0.169335 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4149  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.25 
 
 
919 aa  452  1e-125  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.315835 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2659  serine phosphatase  38.84 
 
 
1083 aa  453  1e-125  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.623664  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2648  putative phytochrome sensor protein  43.5 
 
 
1087 aa  451  1e-125  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1904  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.11 
 
 
932 aa  449  1.0000000000000001e-124  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.636099  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1586  putative phytochrome sensor protein  43.94 
 
 
1087 aa  448  1.0000000000000001e-124  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0975529 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3779  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.17 
 
 
920 aa  443  1e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0316  sensor histidine kinase/response regulator  30.56 
 
 
1174 aa  439  1e-121  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0236  histidine kinase  40.14 
 
 
935 aa  436  1e-120  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00442274 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0715  Na+/solute symporter  40.22 
 
 
1039 aa  436  1e-120  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.723376  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2061  Na+/solute symporter  39.75 
 
 
671 aa  434  1e-120  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.274324 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2100  putative phytochrome sensor protein  42.7 
 
 
1082 aa  433  1e-119  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.758651  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35230  integral membrane sensor hybrid histidine protein kinase  30.12 
 
 
1161 aa  427  1e-118  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234785  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3460  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.9 
 
 
1175 aa  427  1e-118  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.549126 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0409  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.6 
 
 
1171 aa  424  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0666  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.41 
 
 
917 aa  426  1e-117  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.220304  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3284  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.55 
 
 
1168 aa  421  1e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.431447 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0663  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.65 
 
 
1172 aa  423  1e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.564919 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5184  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.04 
 
 
939 aa  420  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.584953  normal  0.0776559 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5112  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.23 
 
 
901 aa  407  1.0000000000000001e-112  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0252  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.03 
 
 
1174 aa  407  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.854881  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0224  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.16 
 
 
1167 aa  405  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1660  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  29.43 
 
 
1156 aa  395  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0486727  normal  0.0112915 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0169  Na+/solute symporter  37.36 
 
 
894 aa  388  1e-106  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0827667  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1803  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.36 
 
 
894 aa  387  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.27583 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2428  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.53 
 
 
945 aa  385  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.396366 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1408  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.63 
 
 
897 aa  379  1e-103  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.263667  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1474  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.94 
 
 
894 aa  374  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0869  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.56 
 
 
1316 aa  371  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0225926  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1507  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.99 
 
 
896 aa  373  1e-101  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.808684  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0898  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.73 
 
 
1172 aa  371  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.149338  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  40.04 
 
 
2051 aa  365  4e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417988  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2693  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.7 
 
 
893 aa  360  7e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.194917  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0939  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  37.03 
 
 
1168 aa  360  9.999999999999999e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2508  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.6 
 
 
784 aa  348  6e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.033945 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2148  Cache sensor hybrid histidine kinase  38.25 
 
 
937 aa  346  1e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0090  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  37.97 
 
 
1163 aa  347  1e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3169  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.26 
 
 
1168 aa  343  1e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6547  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.28 
 
 
865 aa  341  5.9999999999999996e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.325935 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0274  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.3 
 
 
1169 aa  338  2.9999999999999997e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.41273  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0921  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.85 
 
 
1169 aa  338  3.9999999999999995e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.306622  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6237  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  43.4 
 
 
721 aa  336  1e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.703753 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0523  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  35.92 
 
 
1179 aa  333  2e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.183484 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3975  Cache sensor hybrid histidine kinase  38.75 
 
 
811 aa  330  1.0000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000222358  hitchhiker  0.00723661 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4564  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.89 
 
 
1169 aa  330  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.519353  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0860  putative two-component hybrid sensor histidine kinase and response regulator  33.59 
 
 
1169 aa  329  3e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0827695 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0058  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.97 
 
 
1170 aa  326  1e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.950876  normal  0.562732 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02752  two-component system sensor protein  37.06 
 
 
1150 aa  326  2e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0165  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.15 
 
 
1168 aa  324  8e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.53132  normal  0.851256 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3900  sensory box histidine kinase/response regulator  39.17 
 
 
1157 aa  323  9.999999999999999e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1585  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  36.5 
 
 
1158 aa  323  9.999999999999999e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.484303 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4823  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.51 
 
 
1169 aa  323  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1292  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.65 
 
 
1159 aa  322  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0372313  normal  0.867611 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4025  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.65 
 
 
1159 aa  322  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0792472  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1250  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.24 
 
 
1158 aa  321  5e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0252543 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0837  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.56 
 
 
1168 aa  320  7.999999999999999e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.303418 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4529  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.67 
 
 
989 aa  320  9e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1695  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.43 
 
 
1159 aa  320  1e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.948496  normal  0.574545 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2348  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.43 
 
 
1145 aa  320  2e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4135  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.06 
 
 
922 aa  319  2e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000370631  normal  0.0140414 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1235  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.99 
 
 
989 aa  316  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172784  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6560  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.78 
 
 
720 aa  315  3.9999999999999997e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441976  normal  0.646619 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5087  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.46 
 
 
1058 aa  314  5.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4079  sensor histidine kinase/response regulator  38.56 
 
 
1161 aa  311  6.999999999999999e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2742  sensor histidine kinase/response regulator  34.62 
 
 
1145 aa  309  2.0000000000000002e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1864  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.9 
 
 
1159 aa  309  2.0000000000000002e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0562222 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1762  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  37.73 
 
 
1146 aa  308  4.0000000000000004e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.468259  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0849  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.17 
 
 
981 aa  307  7e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.000864337  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1753  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.36 
 
 
1146 aa  306  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1749  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.18 
 
 
1146 aa  306  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0353406  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3398  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.42 
 
 
1202 aa  305  4.0000000000000003e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.613847  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1792  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.36 
 
 
1146 aa  305  5.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.103598  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2531  histidine kinase  35.01 
 
 
1146 aa  304  6.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.014523  hitchhiker  0.00504999 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2361  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.16 
 
 
1146 aa  303  2e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00248753 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2724  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.09 
 
 
1140 aa  302  3e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.178694  hitchhiker  0.00103188 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0620  two component sensor kinase/response regulator hybrid  34.72 
 
 
1169 aa  301  4e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4538  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.21 
 
 
1172 aa  301  6e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3255  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.83 
 
 
1177 aa  301  6e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0680649  normal  0.187811 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3211  histidine kinase  38.72 
 
 
781 aa  300  2e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.306218  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2557  histidine kinase  35.46 
 
 
1142 aa  298  3e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.257497  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>