30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3170 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3170  hypothetical protein  100 
 
 		 187 aa  378  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1092  hypothetical protein  90.16 
 
 		 180 aa  326  1.0000000000000001e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2496  hypothetical protein  44.35 
 
 		 188 aa  104  7e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000377569  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1247  hypothetical protein  53.19 
 
 		 188 aa  99  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1763  hypothetical protein  45.65 
 
 		 183 aa  87.8  8e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.4783800000000001e-18  normal  0.040844 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0953  hypothetical protein  43.69 
 
 		 195 aa  84.3  8e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.585982 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3294  hypothetical protein  41.51 
 
 		 203 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0157417  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2263  hypothetical protein  41.76 
 
 		 213 aa  78.2  0.00000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000459083  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3620  hypothetical protein  40.66 
 
 		 184 aa  77.8  0.00000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.794068  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1752  hypothetical protein  36.46 
 
 		 173 aa  72.8  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000963449  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3095  hypothetical protein  39.58 
 
 		 214 aa  72  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0232  hypothetical protein  41.25 
 
 		 189 aa  70.5  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.12225  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1040  hypothetical protein  33.03 
 
 		 174 aa  70.1  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.194155  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1035  hypothetical protein  29.82 
 
 		 177 aa  68.6  0.00000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.214662  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0908  hypothetical protein  39.47 
 
 		 174 aa  68.2  0.00000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000542792  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1260  hypothetical protein  31.03 
 
 		 267 aa  66.6  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.541563  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1180  hypothetical protein  41.86 
 
 		 232 aa  67  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1038  hypothetical protein  33.33 
 
 		 135 aa  66.6  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1442  hypothetical protein  39.51 
 
 		 265 aa  66.2  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.658193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0766  hypothetical protein  26.79 
 
 		 255 aa  65.5  0.0000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00180926  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0384  hypothetical protein  34.51 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1431  hypothetical protein  34.74 
 
 		 145 aa  64.3  0.0000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000637648  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0131  hypothetical protein  46.97 
 
 		 213 aa  63.9  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1042  hypothetical protein  35.06 
 
 		 288 aa  62.4  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0835293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1496  hypothetical protein  35.53 
 
 		 353 aa  62.4  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1359  hypothetical protein  34.57 
 
 		 182 aa  60.1  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0526065  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1497  hypothetical protein  32.69 
 
 		 170 aa  55.8  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.844823  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0782  hypothetical protein  42.67 
 
 		 177 aa  49.7  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.674637  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1095  hypothetical protein  30.49 
 
 		 171 aa  49.7  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000152193  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1079  hypothetical protein  39.66 
 
 		 797 aa  41.2  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000689439  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>