267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3094 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3094  DNA-3-methyladenine glycosylase I  100 
 
 		 198 aa  406  1e-113  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1181  DNA-3-methyladenine glycosylase I  91.92 
 
 		 198 aa  380  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3518  DNA-3-methyladenine glycosylase I  71.79 
 
 		 202 aa  295  2e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.104093  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0058  DNA-3-methyladenine glycosylase I  74.32 
 
 		 194 aa  290  8e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3581  DNA-3-methyladenine glycosylase I  74.73 
 
 		 191 aa  290  1e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0567  DNA-3-methyladenine glycosylase I  69.73 
 
 		 191 aa  271  3e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118693  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0358  DNA-3-methyladenine glycosylase I  62.43 
 
 		 191 aa  251  6e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2227  DNA-3-methyladenine glycosylase I  67.22 
 
 		 199 aa  250  1e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.62127  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1686  DNA-3-methyladenine glycosylase  56.99 
 
 		 212 aa  249  2e-65  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00244866  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0493  DNA-3-methyladenine glycosylase I  56.99 
 
 		 204 aa  249  3e-65  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000244091  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0672  hypothetical protein  60.22 
 
 		 190 aa  248  3e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0656  hypothetical protein  59.68 
 
 		 190 aa  245  3e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0570  DNA-3-methyladenine glycosylase I  58.33 
 
 		 183 aa  245  4e-64  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.890211 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3701  DNA-3-methyladenine glycosylase I  60.8 
 
 		 197 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1473  DNA-3-methyladenine glycosylase I  58.47 
 
 		 190 aa  241  6e-63  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.333166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2514  DNA-3-methyladenine glycosylase I  60 
 
 		 196 aa  239  1e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4216  DNA-3-methyladenine glycosylase I  59.12 
 
 		 186 aa  240  1e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.779924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0590  DNA-3-methyladenine glycosylase I  59.02 
 
 		 193 aa  235  3e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.444252  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1888  DNA-3-methyladenine glycosylase I  61.08 
 
 		 200 aa  234  4e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2619  DNA-3-methyladenine glycosylase I  60.33 
 
 		 191 aa  234  6e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.3294  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04565  DNA-3-methyladenine glycosidase I  57.38 
 
 		 189 aa  233  1.0000000000000001e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.902141  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0050  DNA-3-methyladenine glycosylase I  55.14 
 
 		 190 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.184428  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1605  DNA-3-methyladenine glycosylase I  55.62 
 
 		 186 aa  228  5e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.665009  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1887  DNA-3-methyladenine glycosylase I  57.37 
 
 		 196 aa  228  6e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4105  DNA-3-methyladenine glycosylase I  62.78 
 
 		 192 aa  228  6e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2725  DNA-3-methyladenine glycosylase I  59.78 
 
 		 187 aa  228  6e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0491  DNA-3-methyladenine glycosylase I  59.57 
 
 		 202 aa  227  7e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.902381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0153  DNA-3-methyladenine glycosylase I  57.92 
 
 		 194 aa  224  5.0000000000000005e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0555  DNA-3-methyladenine glycosylase I  57.75 
 
 		 214 aa  223  1e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.870987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3559  DNA-3-methyladenine glycosylase I  56.74 
 
 		 187 aa  221  4.9999999999999996e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.284448 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2374  DNA-3-methyladenine glycosylase I  55.68 
 
 		 208 aa  221  7e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.218826 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1101  DNA-3-methyladenine glycosylase I  55.85 
 
 		 198 aa  219  9.999999999999999e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1176  DNA-3-methyladenine glycosylase I  57.69 
 
 		 207 aa  219  1.9999999999999999e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.734996  normal  0.819045 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0016  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.82 
 
 		 196 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000166004 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0058  DNA-3-methyladenine glycosylase I  55.25 
 
 		 212 aa  219  1.9999999999999999e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0794  DNA-3-methyladenine glycosylase I  56.5 
 
 		 186 aa  219  3e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1991  DNA-3-methyladenine glycosylase I  56.45 
 
 		 220 aa  218  3e-56  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0957402  normal  0.0568343 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0040  DNA-3-methyladenine glycosylase I  55.49 
 
 		 186 aa  216  2e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0211  DNA-3-methyladenine glycosylase  50.54 
 
 		 210 aa  216  2e-55  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1277  DNA-3-methyladenine glycosidase I  57.95 
 
 		 193 aa  216  2e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4020  DNA-3-methyladenine glycosylase I  55.43 
 
 		 208 aa  215  4e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3064  DNA-3-methyladenine glycosylase 1  60.67 
 
 		 189 aa  214  5e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1255  DNA-3-methyladenine glycosylase I  55.56 
 
 		 218 aa  214  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.454095  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0747  DNA-3-methyladenine glycosylase I  57.46 
 
 		 198 aa  213  9.999999999999999e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.898824  normal  0.829388 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0064  DNA-3-methyladenine glycosylase I  55.31 
 
 		 187 aa  213  9.999999999999999e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1116  DNA-3-methyladenine glycosylase I  57.07 
 
 		 217 aa  213  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.182535 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1237  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.97 
 
 		 217 aa  213  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4683  DNA-3-methyladenine glycosylase I  60.11 
 
 		 187 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0021  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.14 
 
 		 190 aa  213  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.092391  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3988  DNA-3-methyladenine glycosylase I  57.75 
 
 		 221 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.138626  decreased coverage  0.000983487 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4132  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.14 
 
 		 190 aa  212  2.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4332  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.8 
 
 		 208 aa  212  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.239227 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0810  DNA-3-methyladenine glycosylase I  55.43 
 
 		 192 aa  212  2.9999999999999995e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0581984  hitchhiker  0.00269095 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3785  DNA-3-methyladenine glycosylase  53.59 
 
 		 190 aa  211  5.999999999999999e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4549  DNA-3-methyladenine glycosylase I  56.35 
 
 		 188 aa  211  5.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3477  DNA-3-methyladenine glycosylase I  56.35 
 
 		 188 aa  211  5.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.112409 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2291  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.41 
 
 		 186 aa  211  7e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0008  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.78 
 
 		 186 aa  211  7e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2705  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.8 
 
 		 208 aa  211  7.999999999999999e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.176992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0495  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.1 
 
 		 195 aa  210  1e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03399  3-methyl-adenine DNA glycosylase I, constitutive  53.07 
 
 		 187 aa  209  2e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0163  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.07 
 
 		 187 aa  209  2e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03350  hypothetical protein  53.07 
 
 		 187 aa  209  2e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3870  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  53.07 
 
 		 187 aa  209  2e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0010  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.89 
 
 		 187 aa  209  2e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00154604  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4044  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  53.07 
 
 		 187 aa  209  2e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3749  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  53.07 
 
 		 187 aa  209  2e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0167  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  53.07 
 
 		 187 aa  209  2e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0014  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.33 
 
 		 200 aa  209  2e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0102454 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0010  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.33 
 
 		 200 aa  209  2e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0014  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.89 
 
 		 200 aa  209  2e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000164435 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0983  DNA-3-methyladenine glycosylase 1  52.51 
 
 		 192 aa  208  3e-53  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0014  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.89 
 
 		 204 aa  209  3e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0678  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.2 
 
 		 189 aa  208  4e-53  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000050702 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0008  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.33 
 
 		 198 aa  208  4e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4680  DNA-3-methyladenine glycosylase I  58.1 
 
 		 185 aa  207  6e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.651754  normal  0.992066 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0666  DNA-3-methyladenine glycosylase I protein  55 
 
 		 190 aa  207  6e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.831259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0011  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.63 
 
 		 189 aa  207  6e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00532682 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4822  DNA-3-methyladenine glycosylase I  56.35 
 
 		 213 aa  207  9e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.724787 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0057  methyladenine glycosylase  49.73 
 
 		 196 aa  207  9e-53  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3977  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  52.51 
 
 		 187 aa  207  1e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4452  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.22 
 
 		 187 aa  206  2e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.748727  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4305  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.7 
 
 		 209 aa  206  2e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3856  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  52.22 
 
 		 193 aa  206  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4925  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  52.51 
 
 		 187 aa  206  2e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.571955  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4170  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.78 
 
 		 187 aa  206  2e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3837  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  52.22 
 
 		 193 aa  206  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.363143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0010  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.43 
 
 		 191 aa  205  3e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0579886 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0015  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.72 
 
 		 188 aa  205  3e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0175  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  52.78 
 
 		 193 aa  205  4e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0018  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.43 
 
 		 191 aa  205  4e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000168083 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3921  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  51.67 
 
 		 193 aa  204  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.696634 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4025  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  51.67 
 
 		 193 aa  204  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.612137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0010  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.43 
 
 		 190 aa  205  5e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000602981 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2985  DNA-3-methyladenine glycosylase I  56.32 
 
 		 198 aa  204  5e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000233863 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0106  DNA-3-methyladenine glycosylase I  57.63 
 
 		 198 aa  204  6e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119209  normal  0.580749 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3964  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  51.67 
 
 		 193 aa  204  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.58086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0010  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.25 
 
 		 190 aa  204  7e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3828  DNA-3-methyladenine glycosylase I  55.56 
 
 		 198 aa  204  7e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.874293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4674  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.14 
 
 		 209 aa  204  8e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.818815  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>