More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3021 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_3021  CBS domain containing membrane protein  100 
 
 
149 aa  296  5e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1262  CBS domain containing membrane protein  97.99 
 
 
149 aa  290  3e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00178252  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1882  CBS domain-containing protein  64.86 
 
 
149 aa  218  3e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000211918  hitchhiker  0.00000438045 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1801  CBS domain-containing protein  63.09 
 
 
149 aa  210  7e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0256126  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2320  CBS domain-containing protein  67.11 
 
 
150 aa  184  3e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000465345  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2529  CBS domain containing membrane protein  56.08 
 
 
149 aa  184  4e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00130386  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2260  CBS domain-containing protein  53.69 
 
 
150 aa  178  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000586041  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1004  CBS domain-containing protein  52.38 
 
 
149 aa  165  2e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024412  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0264  CBS domain-containing protein  46.26 
 
 
153 aa  134  4e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  43.92 
 
 
152 aa  133  7.000000000000001e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1201  CBS domain-containing protein  40.27 
 
 
152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000963836  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0278  CBS domain containing membrane protein  39.6 
 
 
150 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10697 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2805  CBS domain-containing membrane protein  45.14 
 
 
155 aa  123  7e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  41.38 
 
 
153 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4005  CBS domain containing protein  41.67 
 
 
153 aa  119  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3960  CBS domain containing protein  41.67 
 
 
153 aa  119  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1703  CBS domain containing membrane protein  39.86 
 
 
148 aa  118  1.9999999999999998e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311156  normal  0.0624027 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1253  CBS domain-containing protein  36.91 
 
 
150 aa  118  3e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.515572 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1883  CBS domain-containing protein  39.31 
 
 
154 aa  113  7.999999999999999e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0960  CBS domain-containing protein  38.78 
 
 
153 aa  112  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0461508  hitchhiker  0.00174257 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2046  CBS  34.9 
 
 
150 aa  110  8.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.455097  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1032  putative signal transduction protein with CBS domains  35.37 
 
 
149 aa  110  8.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0368077  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  36.36 
 
 
152 aa  109  1.0000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2338  CBS domain containing membrane protein  39.73 
 
 
247 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0305  CBS domain containing membrane protein  33.33 
 
 
147 aa  107  5e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  34.97 
 
 
152 aa  104  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  37.06 
 
 
153 aa  103  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1851  CBS domain containing membrane protein  31.08 
 
 
151 aa  101  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.309684  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  35.62 
 
 
246 aa  100  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  37.41 
 
 
230 aa  100  8e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3596  CBS domain-containing protein  36.42 
 
 
241 aa  100  8e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.247468  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5546  CBS domain containing membrane protein  37.41 
 
 
230 aa  99.4  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103522  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1597  CBS domain containing membrane protein  34.23 
 
 
151 aa  95.9  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.105679 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1925  CBS domain protein  34.23 
 
 
151 aa  95.9  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1824  CBS  33.33 
 
 
154 aa  94.4  4e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.539518 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0803  signal transduction protein  38.19 
 
 
160 aa  94.4  5e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.708068  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1887  CBS domain containing membrane protein  34.67 
 
 
153 aa  94.4  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278261  normal  0.114824 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1094  signal-transduction protein  34.69 
 
 
230 aa  92.4  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3570  CBS domain-containing protein  34.93 
 
 
246 aa  90.5  7e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5888  CBS domain-containing protein  33.56 
 
 
242 aa  89.4  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.361711  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4751  CBS domain containing membrane protein  33.57 
 
 
154 aa  88.6  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142923  hitchhiker  0.00000010565 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  33.33 
 
 
155 aa  87.8  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0774  CBS  31.97 
 
 
157 aa  86.3  1e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1134  signal transduction protein  33.79 
 
 
151 aa  85.9  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1812  CBS domain containing membrane protein  34.72 
 
 
132 aa  85.9  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1413  putative signal-transduction protein with CBS domains  34.59 
 
 
338 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4019  hypothetical protein  33.77 
 
 
339 aa  85.5  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.191976  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  33.77 
 
 
161 aa  84.7  4e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5821  signal-transduction protein  32.64 
 
 
231 aa  84  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.12685 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1873  hypothetical protein  34.67 
 
 
229 aa  84  7e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1933  CBS domain-containing protein  32.65 
 
 
228 aa  83.6  9e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.316651  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1228  signal-transduction protein  34 
 
 
339 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0490  signal transduction protein  35.33 
 
 
158 aa  83.2  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1281  signal transduction protein  32.69 
 
 
153 aa  82.4  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.366949  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0610  signal-transduction protein  35.33 
 
 
348 aa  80.9  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909822  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1902  CBS domain-containing protein  32.65 
 
 
231 aa  80.5  0.000000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0680  hypothetical protein  31.51 
 
 
249 aa  79.7  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.480825 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6307  putative signal transduction protein with CBS domains  33.78 
 
 
229 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1947  signal-transduction protein  31.76 
 
 
226 aa  79.3  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.489577  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0675  signal transduction protein  33.33 
 
 
153 aa  79  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.302021  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1023  hypothetical protein  32.19 
 
 
243 aa  79  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1630  signal-transduction protein  29.25 
 
 
233 aa  79.3  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1879  CBS  29.25 
 
 
157 aa  79.3  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3002  signal-transduction protein  33.33 
 
 
333 aa  79.3  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1395  signal transduction protein  32.69 
 
 
153 aa  78.6  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1341  CBS domain-containing protein  35.06 
 
 
154 aa  77.8  0.00000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0591  signal-transduction protein  35.66 
 
 
155 aa  77.8  0.00000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0331315  normal  0.426072 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0243  signal transduction protein  30.07 
 
 
155 aa  77  0.00000000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0646  CBS  33.11 
 
 
332 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17501  IMP dehydrogenase-like protein  29.17 
 
 
156 aa  76.6  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5760  hypothetical protein  28.77 
 
 
242 aa  76.3  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.594459 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1912  signal-transduction protein  30.41 
 
 
242 aa  75.1  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0206039  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2138  putative signal transduction protein with CBS domains  32.86 
 
 
151 aa  74.7  0.0000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1028  CBS domain containing membrane protein  27.4 
 
 
226 aa  74.3  0.0000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0495705 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2233  CBS domain-containing protein  28.57 
 
 
232 aa  73.9  0.0000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2997  signal-transduction protein  28.47 
 
 
223 aa  73.6  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1851  CBS domain-containing protein  34.72 
 
 
120 aa  72.4  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0970  CBS domain-containing protein  28.38 
 
 
155 aa  72  0.000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1524  signal transduction protein  35.21 
 
 
212 aa  72  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0592801 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2002  hypothetical protein  30.26 
 
 
154 aa  71.2  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.584772  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2966  signal-transduction protein  32.24 
 
 
132 aa  71.2  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4051  signal-transduction protein  28.77 
 
 
242 aa  71.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2202  putative signal transduction protein with CBS domains  29.73 
 
 
236 aa  70.5  0.000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0317  CBS domain-containing protein  25 
 
 
394 aa  70.5  0.000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0675  signal transduction protein  26.53 
 
 
147 aa  70.5  0.000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1490  signal transduction protein  32.86 
 
 
150 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0133707  normal  0.421198 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27290  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.57 
 
 
628 aa  68.9  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3311  CBS domain-containing protein  31.25 
 
 
141 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.881932 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4725  putative signal transduction protein with CBS domains  25.34 
 
 
243 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2812  CBS domain containing membrane protein  29.37 
 
 
201 aa  68.2  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718769  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2232  CBS domain containing membrane protein  31.65 
 
 
164 aa  68.6  0.00000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0171  signal transduction protein  31.29 
 
 
132 aa  68.6  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.900499  normal  0.567274 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1289  signal transduction protein  30.13 
 
 
153 aa  68.2  0.00000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3404  signal transduction protein  35.21 
 
 
212 aa  68.2  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.843193  normal  0.543078 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0640  CBS domain-containing protein  30.07 
 
 
150 aa  68.2  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1344  putative signal-transduction protein with CBS domains  26.03 
 
 
243 aa  67.8  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2451  CBS domain containing membrane protein  32.87 
 
 
141 aa  67  0.00000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000150568  normal  0.0113314 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1365  signal-transduction protein  24.66 
 
 
243 aa  67  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.831809  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2521  signal transduction protein  26.53 
 
 
161 aa  66.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4814  CBS domain containing membrane protein  27.59 
 
 
226 aa  65.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107222  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>