More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2984 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_2984  hypothetical protein  100 
 
 
160 aa  321  3e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.49788e-30 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1299  hypothetical protein  96.25 
 
 
160 aa  308  1e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000613288  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1898  hypothetical protein  66.25 
 
 
159 aa  218  3e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000581162  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1585  hypothetical protein  64.38 
 
 
159 aa  211  2.9999999999999995e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0279837  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1583  hypothetical protein  61.25 
 
 
159 aa  198  1.9999999999999998e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.324016  normal  0.240666 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0960  hypothetical protein  55.77 
 
 
161 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1666  hypothetical protein  55.62 
 
 
159 aa  173  9.999999999999999e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0922  hypothetical protein  45.62 
 
 
154 aa  130  5e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000356631  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1046  hypothetical protein  42.5 
 
 
158 aa  127  6e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708313  unclonable  0.00000000857031 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1138  hypothetical protein  42.59 
 
 
171 aa  125  3e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0279371 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1552  hypothetical protein  42.33 
 
 
162 aa  124  5e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175864  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1961  hypothetical protein  44.03 
 
 
153 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00677493  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3730  hypothetical protein  40.12 
 
 
185 aa  119  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.233176  normal  0.972926 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3192  hypothetical protein  41.03 
 
 
153 aa  118  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000184124  normal  0.0994389 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3680  hypothetical protein  43.23 
 
 
152 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000126023  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1666  protein of unknown function DUF150  45.22 
 
 
161 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000315608  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0453  protein of unknown function DUF150  40.67 
 
 
152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1099  hypothetical protein  40.38 
 
 
171 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0995  hypothetical protein  44.74 
 
 
154 aa  111  5e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000184773  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07810  hypothetical protein  40.62 
 
 
159 aa  110  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1440  protein of unknown function DUF150  39.38 
 
 
154 aa  108  4.0000000000000004e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.266374  normal  0.102283 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1159  protein of unknown function DUF150  39.74 
 
 
171 aa  108  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.710629  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1227  protein of unknown function DUF150  39.74 
 
 
171 aa  107  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2469  hypothetical protein  40.25 
 
 
156 aa  107  5e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000177785  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0695  hypothetical protein  40.62 
 
 
157 aa  105  2e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000302569  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1329  hypothetical protein  39.38 
 
 
156 aa  105  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000301231  hitchhiker  0.0000903983 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3855  hypothetical protein  38.75 
 
 
156 aa  105  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000468139  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3668  hypothetical protein  38.75 
 
 
156 aa  105  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000060287  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3558  hypothetical protein  38.75 
 
 
156 aa  105  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000119608  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3576  hypothetical protein  38.75 
 
 
156 aa  105  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000128893  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3864  hypothetical protein  38.75 
 
 
156 aa  105  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000526442  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3954  hypothetical protein  38.75 
 
 
156 aa  105  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000590574  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3639  hypothetical protein  39.38 
 
 
156 aa  104  4e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000125209  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3829  hypothetical protein  38.75 
 
 
156 aa  105  4e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.0936e-62 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2822  hypothetical protein  38.24 
 
 
152 aa  104  5e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4219  hypothetical protein  44.78 
 
 
169 aa  103  7e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000438537  normal  0.129114 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0172  hypothetical protein  41.22 
 
 
151 aa  103  9e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137373  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2691  hypothetical protein  38.24 
 
 
152 aa  103  1e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3915  hypothetical protein  38.75 
 
 
156 aa  102  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000056255  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002607  UPF0090 domain-containing protein  41.06 
 
 
151 aa  102  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000228557  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1950  hypothetical protein  39.57 
 
 
176 aa  102  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.197995  normal  0.0512088 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0815  hypothetical protein  39.87 
 
 
153 aa  102  3e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00329343 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1431  protein of unknown function DUF150  38.12 
 
 
157 aa  101  4e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000199616  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03398  hypothetical protein  39.19 
 
 
151 aa  99.8  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1066  hypothetical protein  36.13 
 
 
150 aa  98.6  4e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000674656  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1317  hypothetical protein  38.56 
 
 
150 aa  97.4  6e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01758  hypothetical protein  37.58 
 
 
165 aa  97.4  7e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.632823  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1046  hypothetical protein  34.84 
 
 
150 aa  97.1  9e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000583244  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2043  hypothetical protein  36.36 
 
 
157 aa  96.3  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0596  hypothetical protein  40.27 
 
 
151 aa  97.1  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.277868  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1151  hypothetical protein  37.18 
 
 
157 aa  96.7  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000962197  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0819  hypothetical protein  34.64 
 
 
153 aa  96.7  1e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3037  hypothetical protein  36.77 
 
 
181 aa  96.7  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0110897  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2710  hypothetical protein  37.16 
 
 
151 aa  95.5  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2778  hypothetical protein  39.57 
 
 
155 aa  95.9  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000007785  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2591  hypothetical protein  40.91 
 
 
206 aa  95.1  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.660768 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3350  hypothetical protein  35.33 
 
 
153 aa  94.7  4e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.223242  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0561  hypothetical protein  40.54 
 
 
153 aa  94.4  6e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3560  hypothetical protein  38.3 
 
 
196 aa  94.4  6e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1226  hypothetical protein  36.94 
 
 
168 aa  94  7e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00744714  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2829  hypothetical protein  41.72 
 
 
161 aa  94  8e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000100799  hitchhiker  0.00340048 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1690  hypothetical protein  43.24 
 
 
144 aa  94  8e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.332685  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0553  protein of unknown function DUF150  39.61 
 
 
153 aa  93.2  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.169356 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1205  protein of unknown function DUF150  33.12 
 
 
156 aa  93.6  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000854014  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1025  hypothetical protein  37.5 
 
 
153 aa  93.6  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0701268  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0041  hypothetical protein  36.81 
 
 
194 aa  92.4  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2909  hypothetical protein  38.57 
 
 
203 aa  92.4  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.829531  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1626  protein of unknown function DUF150  35.06 
 
 
154 aa  92  3e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.118173  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1001  protein of unknown function DUF150  35.04 
 
 
154 aa  91.7  4e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1602  hypothetical protein  39.86 
 
 
153 aa  91.3  5e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.781407  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0389  lipoprotein, putative  39.33 
 
 
150 aa  90.9  6e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.281265  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2201  hypothetical protein  35.62 
 
 
151 aa  90.9  7e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1162  hypothetical protein  35 
 
 
204 aa  90.9  7e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0832  hypothetical protein  35.53 
 
 
155 aa  90.1  1e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0955131  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1649  hypothetical protein  42.86 
 
 
151 aa  90.1  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000296961  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0959  hypothetical protein  36.77 
 
 
151 aa  90.5  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0670206  normal  0.152595 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1202  hypothetical protein  36.43 
 
 
151 aa  89.4  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1693  hypothetical protein  38.17 
 
 
152 aa  89.4  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3927  hypothetical protein  36.6 
 
 
220 aa  89  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2823  hypothetical protein  34.38 
 
 
204 aa  89.4  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1024  hypothetical protein  36.43 
 
 
151 aa  89  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000675581  hitchhiker  0.000125098 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1089  hypothetical protein  36.43 
 
 
151 aa  89  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00297736  normal  0.0584009 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0988  hypothetical protein  39.16 
 
 
165 aa  89  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00512206  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2836  hypothetical protein  34.64 
 
 
151 aa  89  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00113989  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1028  hypothetical protein  36.43 
 
 
151 aa  89  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0162582  hitchhiker  0.000040041 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0777  hypothetical protein  41.8 
 
 
173 aa  89  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000034015  normal  0.0524823 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03037  hypothetical protein  38.93 
 
 
150 aa  88.6  4e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3362  hypothetical protein  38.93 
 
 
150 aa  88.6  4e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0135446  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02988  hypothetical protein  38.93 
 
 
150 aa  88.6  4e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3466  hypothetical protein  38.56 
 
 
154 aa  88.2  4e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.155297  normal  0.925377 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0528  hypothetical protein  38.93 
 
 
150 aa  88.6  4e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4491  hypothetical protein  38.56 
 
 
154 aa  88.2  4e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3601  hypothetical protein  38.93 
 
 
150 aa  88.6  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.948868  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0810  hypothetical protein  34.16 
 
 
172 aa  88.2  4e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0615439  hitchhiker  0.00120973 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3655  hypothetical protein  38.93 
 
 
150 aa  88.6  4e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162114  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3856  protein of unknown function DUF150  38.03 
 
 
209 aa  88.2  5e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.113765  normal  0.0726856 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4182  hypothetical protein  39.34 
 
 
158 aa  87.8  6e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.844103 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1005  hypothetical protein  37.42 
 
 
151 aa  87.8  6e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0545714  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3563  hypothetical protein  35.62 
 
 
151 aa  87.4  7e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.380474  hitchhiker  0.00000509959 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3062  hypothetical protein  36.43 
 
 
151 aa  87.4  7e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000525096  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>