More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2939 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_2939  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 
307 aa  606  9.999999999999999e-173  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1345  transcriptional regulator, ArsR family  94.41 
 
 
305 aa  553  1e-156  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.773476  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  68.98 
 
 
305 aa  418  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0357  transcriptional regulator, ArsR family  68.2 
 
 
310 aa  409  1e-113  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366158  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0039  ArsR family transcriptional regulator  68.77 
 
 
309 aa  392  1e-108  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1925  SAM-dependent methyltransferase  54.93 
 
 
306 aa  318  7e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000216904  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2302  transcriptional regulator, ArsR family  42.9 
 
 
309 aa  224  2e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2348  methyltransferase type 11  43.05 
 
 
307 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0100199  normal  0.0140968 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  42.7 
 
 
348 aa  212  7e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0040  transcriptional regulator, ArsR family  41.18 
 
 
307 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.516661  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2579  transcriptional regulator, ArsR family  40.83 
 
 
312 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2305  transcriptional regulator, ArsR family  41.96 
 
 
311 aa  186  3e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0356  ArsR family transcriptional regulator  39.07 
 
 
304 aa  181  1e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.208931  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05540  ArsR family regulatory protein  39.44 
 
 
336 aa  174  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0455  ArsR family transcriptional regulator  38.6 
 
 
334 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07110  ArsR family transcriptional regulator  38.14 
 
 
333 aa  158  8e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2926  transcriptional regulator ArsR family  38.89 
 
 
341 aa  158  9e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0650  putative transcriptional regulator  37.8 
 
 
329 aa  158  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4966  ArsR family transcriptional regulator  34.59 
 
 
330 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4839  ArsR family transcriptional regulator  34.59 
 
 
330 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  35.55 
 
 
342 aa  155  8e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4793  regulatory protein, ArsR  35.56 
 
 
331 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0119403 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5015  ArsR family transcriptional regulator  34.95 
 
 
330 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.1667 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0384  transcriptional regulator, ArsR family  35.44 
 
 
331 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1880  transcriptional regulator, ArsR family  35.33 
 
 
354 aa  153  4e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1599  methyltransferase type 11  35.33 
 
 
349 aa  152  5e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1722  methyltransferase type 11  33.01 
 
 
341 aa  152  7e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5268  ArsR family transcriptional regulator  34.86 
 
 
331 aa  152  8e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.149036  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2125  ArsR family transcriptional regulator  34.67 
 
 
339 aa  150  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.458145 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  33.56 
 
 
327 aa  149  4e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1407  ArsR family transcriptional regulator  33.01 
 
 
341 aa  149  6e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.440659  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0808  transcriptional regulator, ArsR family  35.89 
 
 
324 aa  149  7e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.203378 
 
 
-
 
NC_004310  BR1451  ArsR family transcriptional regulator  32.68 
 
 
341 aa  147  1.0000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166117  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1529  ArsR family transcriptional regulator  35.31 
 
 
337 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4920  transcriptional regulator, ArsR family  33.45 
 
 
328 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2400  methyltransferase type 11  34.75 
 
 
330 aa  147  3e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00744372 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2029  ArsR family transcriptional regulator  30.89 
 
 
337 aa  147  3e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.308683  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0500  ArsR family transcriptional regulator  33.91 
 
 
330 aa  145  6e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4035  ArsR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
312 aa  144  1e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.140406 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1067  transcriptional regulator, ArsR family  33.9 
 
 
305 aa  145  1e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.420275 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2402  ArsR family transcriptional regulator  34.81 
 
 
323 aa  145  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.275669 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2879  transcriptional regulator, ArsR family  34.11 
 
 
341 aa  143  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22791  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2101  ArsR family transcriptional regulator  35.17 
 
 
317 aa  142  9.999999999999999e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2116  methyltransferase type 11  33 
 
 
340 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.126777 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0471  ArsR family transcriptional regulator  30.14 
 
 
335 aa  140  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.421006  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2619  transcriptional regulator, ArsR family  33.44 
 
 
341 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38929  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3041  methyltransferase type 11  34.69 
 
 
333 aa  139  4.999999999999999e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3209  ArsR family transcriptional regulator  32.65 
 
 
341 aa  137  2e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2830  methyltransferase type 11  35.25 
 
 
349 aa  135  8e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.157878 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0034  ArsR family transcriptional regulator  32.04 
 
 
328 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0629975 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1121  ArsR family transcriptional regulator  33.46 
 
 
340 aa  127  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3543  transcriptional regulator, ArsR family  34.24 
 
 
335 aa  126  5e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3410  ArsR family transcriptional regulator  34.15 
 
 
329 aa  121  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0187563  normal  0.0416707 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0160  methyltransferase type 11  35.38 
 
 
322 aa  119  7e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0747842 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0155  ArsR family transcriptional regulator  35.22 
 
 
326 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.602788  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0173  transcriptional regulator, ArsR family  36.33 
 
 
326 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0162  transcriptional regulator, ArsR family  34.24 
 
 
326 aa  112  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0164  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.11 
 
 
207 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0168  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.58 
 
 
207 aa  108  9.000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2610  transcriptional regulator, ArsR family  32.24 
 
 
309 aa  105  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.184924 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01234  transcriptional regulator  31.91 
 
 
331 aa  101  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250381  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1224  methyltransferase type 11  30.98 
 
 
206 aa  97.1  3e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1232  ArsR family transcriptional regulator  29.97 
 
 
309 aa  94.4  2e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1198  SAM-dependent methyltransferase  31.35 
 
 
206 aa  94.7  2e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1265  transcriptional regulator  29.97 
 
 
309 aa  94.4  2e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2245  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
212 aa  93.6  4e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.810534 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0759  Methyltransferase type 11  44.55 
 
 
267 aa  87.4  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333457  normal  0.305002 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5386  transcriptional regulator, ArsR family  28.14 
 
 
355 aa  87.4  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3468  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  26.06 
 
 
420 aa  82.8  0.000000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0953  arsenite S-adenosylmethyltransferase  42.02 
 
 
265 aa  82.4  0.000000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000240908  hitchhiker  0.000000043462 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2552  Methyltransferase type 11  40.54 
 
 
263 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.318811 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3046  Methyltransferase type 11  42.48 
 
 
295 aa  79.3  0.00000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  32.28 
 
 
213 aa  78.6  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1428  arsenite S-adenosylmethyltransferase  37.09 
 
 
268 aa  78.2  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1926  Methyltransferase type 11  41.44 
 
 
281 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0762  arsenite S-adenosylmethyltransferase  41.51 
 
 
266 aa  77  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000040613  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1590  methyltransferase type 11  36.67 
 
 
267 aa  76.6  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0251  arsenite S-adenosylmethyltransferase  45.68 
 
 
272 aa  76.3  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  45.45 
 
 
117 aa  72.4  0.000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3937  Methyltransferase type 11  33.96 
 
 
298 aa  71.2  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.472331  normal  0.52551 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1731  arsenical resistance operon repressor  51.52 
 
 
105 aa  70.5  0.00000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0861085  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6112  arsenite S-adenosylmethyltransferase  35.85 
 
 
279 aa  70.5  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0266  methyltransferase type 11  35.78 
 
 
279 aa  70.1  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.608985  normal  0.806838 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  38.4 
 
 
225 aa  70.5  0.00000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  42.42 
 
 
236 aa  70.1  0.00000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1714  arsenite S-adenosylmethyltransferase  35.85 
 
 
248 aa  70.1  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.019439  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1202  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  37.93 
 
 
277 aa  68.9  0.00000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1638  Methyltransferase type 11  34.81 
 
 
269 aa  68.9  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357155  normal  0.179609 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1228  arsenite S-adenosylmethyltransferase  37.61 
 
 
277 aa  68.9  0.0000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1981  biotin biosynthesis protein BioC  30.07 
 
 
309 aa  68.9  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0285  hypothetical protein  28.3 
 
 
242 aa  68.6  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.218355  normal  0.197708 
 
 
-
 
NC_002936  DET1420  arsenite S-adenosylmethyltransferase  37.61 
 
 
280 aa  68.2  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1246  Methyltransferase type 11  39.45 
 
 
288 aa  68.2  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.476258 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  39 
 
 
236 aa  68.2  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1931  transcriptional regulator, ArsR family  42.05 
 
 
123 aa  67.4  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2279  hypothetical protein  32.61 
 
 
284 aa  67.4  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5332  Methyltransferase type 11  33.1 
 
 
199 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1449  methyltransferase, putative  27.64 
 
 
201 aa  67  0.0000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  38.66 
 
 
260 aa  67  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1629  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  36.63 
 
 
218 aa  67  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.615509  normal  0.918656 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>