More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2820 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_2058  thiolase  81.7 
 
 
399 aa  679  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.35513  normal  0.039203 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1434  acetyl-CoA acetyltransferase  98.24 
 
 
398 aa  797  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.732779  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2820  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 
398 aa  807  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2013  acetyl-CoA acetyltransferase  62.31 
 
 
401 aa  504  1e-141  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.536911  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2860  acetyl-CoA acetyltransferase  62.97 
 
 
403 aa  499  1e-140  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0816  acetyl-CoA acetyltransferase  58.9 
 
 
398 aa  474  1e-132  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1205  acetyl-CoA acetyltransferase  56.75 
 
 
400 aa  469  1e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000642816 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2321  acetyl-CoA acetyltransferase  58.6 
 
 
402 aa  466  1e-130  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2258  beta-ketoadipyl CoA thiolase  56.61 
 
 
401 aa  465  1e-130  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.127272  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1582  beta-ketoadipyl CoA thiolase  56.61 
 
 
401 aa  465  1e-130  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2248  beta-ketoadipyl CoA thiolase  56.61 
 
 
401 aa  466  1e-130  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0780819  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1484  beta-ketoadipyl CoA thiolase  56.61 
 
 
401 aa  465  1e-130  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2616  beta-ketoadipyl CoA thiolase  56.61 
 
 
406 aa  462  1e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.232956 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1323  acetyl-CoA acetyltransferase  58.15 
 
 
402 aa  462  1e-129  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.158351 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1696  beta-ketoadipyl CoA thiolase  58.6 
 
 
400 aa  459  1e-128  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.142195 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0492  acetyl-CoA acetyltransferase  57.36 
 
 
402 aa  461  1e-128  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0375  thiolase  56.86 
 
 
401 aa  454  1e-127  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.88796e-05  hitchhiker  2.65962e-05 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1122  beta-ketoadipyl CoA thiolase  58.1 
 
 
401 aa  456  1e-127  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1508  beta-ketoadipyl CoA thiolase  56.61 
 
 
401 aa  454  1e-126  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0554104  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2825  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.86 
 
 
401 aa  451  1e-126  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1305  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  57.52 
 
 
414 aa  451  1e-126  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05285  acetyl-CoA acetyltransferase  54.34 
 
 
404 aa  449  1e-125  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4811  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.61 
 
 
401 aa  450  1e-125  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.346578 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0263  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.86 
 
 
400 aa  449  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3097  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.34 
 
 
404 aa  449  1e-125  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.99011  hitchhiker  0.000409619 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4887  beta-ketoadipyl CoA thiolase  56.36 
 
 
401 aa  445  1e-124  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0589853 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0482  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.61 
 
 
400 aa  445  1e-124  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.807592  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2629  beta-ketoadipyl CoA thiolase  56.39 
 
 
406 aa  445  1e-124  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.577515  normal  0.0691319 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1260  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.87 
 
 
412 aa  446  1e-124  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0301  Beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.87 
 
 
401 aa  444  1e-124  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0179307  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2156  acetyl-CoA acetyltransferase  57.18 
 
 
404 aa  447  1e-124  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.744792  normal  0.301708 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2698  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.36 
 
 
404 aa  447  1e-124  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.398036  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0659  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.62 
 
 
401 aa  447  1e-124  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.993676  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3547  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.61 
 
 
405 aa  445  1e-124  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.008459  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2479  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.64 
 
 
406 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.612376  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0798  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.36 
 
 
400 aa  442  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6117  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.11 
 
 
401 aa  443  1e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0635  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.36 
 
 
405 aa  442  1e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211029  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1490  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.36 
 
 
400 aa  442  1e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.159653  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1554  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.36 
 
 
402 aa  442  1e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3574  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.36 
 
 
405 aa  442  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.887338  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0384  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.36 
 
 
400 aa  443  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.816364  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0542  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.36 
 
 
400 aa  442  1e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0885765  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3565  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.36 
 
 
400 aa  443  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00704584  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1812  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.36 
 
 
400 aa  443  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2115  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.36 
 
 
400 aa  442  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.749553  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0932  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.36 
 
 
405 aa  442  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00352947  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1902  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.36 
 
 
405 aa  442  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.19346  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2852  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.36 
 
 
400 aa  439  1e-122  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0252423  normal  0.507023 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3669  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.86 
 
 
400 aa  439  1e-122  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.486351 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0879  Acetyl-CoA C-acyltransferase  54.86 
 
 
401 aa  439  1e-122  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3361  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.61 
 
 
400 aa  440  1e-122  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.100968 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2901  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.61 
 
 
400 aa  439  1e-122  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00482281  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2457  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.61 
 
 
400 aa  438  1e-122  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3280  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.39 
 
 
406 aa  441  1e-122  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.939828  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2126  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.86 
 
 
400 aa  441  1e-122  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3487  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.11 
 
 
400 aa  435  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00319846  hitchhiker  0.000297737 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0844  beta-ketoadipyl CoA thiolase  56.36 
 
 
400 aa  436  1e-121  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5094  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.87 
 
 
400 aa  437  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3629  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.11 
 
 
400 aa  437  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  8.20943e-05  normal  0.547092 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5587  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.36 
 
 
400 aa  435  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2252  beta-ketoadipyl CoA thiolase  56.11 
 
 
400 aa  436  1e-121  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00123839  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2064  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.61 
 
 
400 aa  435  1e-121  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.664786 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1231  Beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.86 
 
 
400 aa  437  1e-121  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  4.2843e-06  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4307  3-oxoadipyl-CoA thiolase  54 
 
 
399 aa  432  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3767  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.86 
 
 
400 aa  432  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02790  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.5 
 
 
401 aa  434  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0219063 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4011  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.25 
 
 
399 aa  431  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0170191 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0831  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.11 
 
 
400 aa  434  1e-120  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0320  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.11 
 
 
402 aa  433  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.970819 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2563  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.36 
 
 
400 aa  430  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2998  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.11 
 
 
400 aa  431  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6183  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.5 
 
 
401 aa  431  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5022  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.36 
 
 
399 aa  429  1e-119  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.751086  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3707  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.87 
 
 
405 aa  429  1e-119  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.394558  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0314  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55 
 
 
401 aa  430  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0542  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.36 
 
 
400 aa  430  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00256596  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7640  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.87 
 
 
402 aa  431  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.202781  normal  0.359257 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5246  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.11 
 
 
400 aa  431  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0469  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.87 
 
 
400 aa  429  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4717  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.11 
 
 
406 aa  430  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2167  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.12 
 
 
400 aa  429  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.34173 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4433  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.25 
 
 
401 aa  429  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.874568  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4902  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.11 
 
 
400 aa  431  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.151617  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0514  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.61 
 
 
400 aa  431  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.107177  normal  0.646425 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5368  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.11 
 
 
400 aa  431  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.360889  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5925  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.37 
 
 
400 aa  430  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1532  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.87 
 
 
401 aa  427  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.117462 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3048  beta-ketoadipyl CoA thiolase  50 
 
 
403 aa  426  1e-118  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.214699  normal  0.389192 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4020  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.98 
 
 
401 aa  427  1e-118  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0676172  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0636  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53 
 
 
400 aa  426  1e-118  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3665  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.36 
 
 
400 aa  425  1e-118  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1582  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  53.22 
 
 
424 aa  427  1e-118  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2690  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.37 
 
 
400 aa  428  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0340832  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3081  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.12 
 
 
401 aa  424  1e-118  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.426252 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6797  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.98 
 
 
401 aa  423  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2833  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.36 
 
 
399 aa  424  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.164293 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0598  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.75 
 
 
400 aa  424  1e-117  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.319983  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2196  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.39 
 
 
400 aa  424  1e-117  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0302  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.64 
 
 
401 aa  423  1e-117  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.480832  normal  0.217803 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>