More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2626 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_2626  ferric uptake regulator, Fur family  100 
 
 
143 aa  293  7e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1587  ferric uptake regulator, Fur family  97.9 
 
 
143 aa  290  6e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000012945  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3002  ferric uptake regulator family protein  83.22 
 
 
153 aa  249  9.000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000499535  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1379  ferric uptake regulation protein Fur  82.52 
 
 
143 aa  247  4e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.404925  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2445  ferric uptake regulator family protein  82.39 
 
 
143 aa  245  2e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164453  normal  0.662654 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0772  ferric uptake regulator family protein  68.12 
 
 
147 aa  198  1.9999999999999998e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.230128  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2468  ferric uptake regulator, Fur family  64.23 
 
 
146 aa  189  1e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0653957  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1952  negative regulator of ferric uptake  62.77 
 
 
143 aa  177  4.999999999999999e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3769  ferric uptake regulator, Fur family  51.41 
 
 
151 aa  153  9e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2300  ferric uptake regulator, Fur family  53.33 
 
 
167 aa  151  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.194588  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2388  ferric uptake regulator, Fur family  53.33 
 
 
167 aa  151  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1564  ferric uptake regulator family protein  53.33 
 
 
167 aa  150  4e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0495536  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3662  ferric uptake regulator, Fur family  50.7 
 
 
151 aa  150  5e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2676  ferric uptake regulator family protein  50.74 
 
 
148 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2043  ferric uptake regulator family protein  47.06 
 
 
144 aa  143  7.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2251  ferric uptake regulator family protein  50.76 
 
 
176 aa  138  3e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.409228  normal  0.662099 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1364  ferric uptake regulator, Fur family  45.19 
 
 
152 aa  138  3e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5908  ferric uptake regulator, Fur family  49.63 
 
 
165 aa  137  3.9999999999999997e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.616966  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0753  ferric uptake regulator family protein  43.7 
 
 
144 aa  127  7.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0603  ferric uptake regulator, Fur family  48.51 
 
 
154 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0487  ferric uptake regulation protein  42.34 
 
 
151 aa  122  2e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0459  ferric uptake regulator family protein  39.85 
 
 
143 aa  120  5e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00576361  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1562  ferric uptake regulator, Fur family  39.73 
 
 
147 aa  120  7e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1493  ferric uptake regulator family protein  43.07 
 
 
146 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000138692  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3367  ferric uptake regulator family protein  40.56 
 
 
149 aa  118  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0449  ferric uptake regulation protein  41.18 
 
 
157 aa  118  3e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.270092  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0423  ferric uptake regulation protein  41.18 
 
 
157 aa  118  3e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00356258  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1557  ferric uptake regulation protein  41.18 
 
 
157 aa  118  3e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.754844  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0577  ferric-uptake regulator  40.15 
 
 
156 aa  116  9.999999999999999e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.577405  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2982  ferric uptake regulator, Fur family  40.44 
 
 
154 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000154751  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1272  ferric uptake regulator family protein  40.69 
 
 
158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0505  FUR family transcriptional regulator  37.59 
 
 
144 aa  115  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.316228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0448  ferric uptake regulator  37.59 
 
 
144 aa  115  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0444  ferric uptake regulator  37.59 
 
 
144 aa  115  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0224  putative iron-regulated membrane protein  40.88 
 
 
155 aa  114  3e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0537  FUR family transcriptional regulator  37.59 
 
 
144 aa  115  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00799734  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0542  transcriptional regulator, Fur family  37.59 
 
 
142 aa  114  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0520  transcriptional regulator, Fur family  37.59 
 
 
142 aa  114  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000515951 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0650  ferric uptake regulator family protein  45.67 
 
 
144 aa  114  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000137697  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0592  FUR family transcriptional regulator  37.59 
 
 
142 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.311415  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1143  ferric uptake regulation protein  38.69 
 
 
154 aa  114  6e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0587945  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0603  ferric uptake regulator family protein  43.94 
 
 
138 aa  113  6.9999999999999995e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.401566  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0593  transcriptional regulator, Fur family  36.84 
 
 
142 aa  113  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000040057  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0453  ferric uptake regulator family protein  36.84 
 
 
142 aa  113  7.999999999999999e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.964373  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4784  transcriptional regulator, Fur family  36.84 
 
 
142 aa  113  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000324074  hitchhiker  0.00000172777 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2147  ferric uptake regulation protein  40.15 
 
 
155 aa  112  1.0000000000000001e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000154091  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1799  FUR family manganese uptake regulator  46.46 
 
 
137 aa  112  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1645  ferric uptake regulation protein (ferric uptake regulator)  39.42 
 
 
155 aa  113  1.0000000000000001e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1995  ferric uptake regulator, Fur family  43.08 
 
 
146 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.134138  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3031  ferric uptake regulator family protein  47.54 
 
 
139 aa  110  5e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0406  ferric uptake regulator, Fur family  42.42 
 
 
139 aa  110  6e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2986  ferric uptake regulator, Fur family  47.58 
 
 
143 aa  110  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.105319  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2576  ferric uptake regulator, Fur family  47.58 
 
 
143 aa  110  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.710249  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2747  ferric uptake transcriptional repressor transcription regulator protein  47.58 
 
 
143 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1147  ferric uptake regulator family protein  45.04 
 
 
155 aa  109  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1364  ferric uptake regulator, Fur family  35.34 
 
 
150 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4057  ferric uptake regulator, Fur family  42.64 
 
 
151 aa  108  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3944  ferric uptake regulator, Fur family  42.64 
 
 
151 aa  108  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.701643  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6009  ferric uptake regulator family protein  42.42 
 
 
155 aa  108  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.964976 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3924  ferric uptake regulator family protein  41.79 
 
 
149 aa  108  3e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0498  ferric uptake regulator, Fur family  34.59 
 
 
150 aa  108  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3272  ferric uptake regulator, Fur family  41.79 
 
 
138 aa  107  4.0000000000000004e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.710175  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1194  ferric-uptake regulator  45.45 
 
 
159 aa  106  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2142  putative ferric uptake regulation protein  44.26 
 
 
137 aa  106  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.459771  normal  0.262117 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2976  ferric uptake regulator family protein  46.77 
 
 
143 aa  106  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1061  FUR family transcriptional regulator  40.6 
 
 
149 aa  105  2e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.304588  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2837  ferric uptake regulator family protein  46.77 
 
 
143 aa  105  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0435  ferric uptake regulator  46.77 
 
 
135 aa  105  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0247  ferric uptake transcriptional (FUR)-like transcription regulator protein  41.54 
 
 
151 aa  105  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.406535  normal  0.140515 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0223  transcriptional regulator  44.12 
 
 
145 aa  104  4e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0984  ferric uptake regulator family protein  44.35 
 
 
140 aa  104  4e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.392033  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2623  ferric uptake regulation protein  42.86 
 
 
143 aa  104  5e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.376677  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3615  ferric uptake regulator family protein  45.16 
 
 
168 aa  104  5e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4555  ferric uptake regulator family protein  40.91 
 
 
145 aa  104  5e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0842  ferric uptake regulator, Fur family  39.85 
 
 
152 aa  103  8e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0021  ferric uptake regulator, Fur family  42.75 
 
 
142 aa  103  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.531166 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2295  ferric uptake regulator family protein  34.75 
 
 
159 aa  103  8e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0033  ferric uptake regulator, Fur family  42.75 
 
 
142 aa  103  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.968997  normal  0.145253 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0932  ferric uptake regulator family protein  45.45 
 
 
137 aa  103  9e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1123  ferric uptake regulator family protein  46.34 
 
 
148 aa  102  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.488583  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1064  ferric uptake regulator family protein  38.35 
 
 
152 aa  103  1e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193805  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4234  ferric uptake regulator family protein  41.41 
 
 
167 aa  103  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0343972  normal  0.519768 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1820  ferric uptake regulator family protein  39.42 
 
 
144 aa  102  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.168146 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0229  ferric uptake regulator family protein  44.03 
 
 
151 aa  103  1e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1161  ferric uptake regulator family protein  44.63 
 
 
137 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.13561  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2494  FUR family manganese uptake regulator  44.63 
 
 
137 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.360985  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3767  ferric uptake regulator family protein  41.86 
 
 
140 aa  102  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1048  ferric uptake regulator family protein  37.59 
 
 
152 aa  102  2e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000518354  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1228  ferric uptake regulator family protein  41.35 
 
 
138 aa  102  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2385  ferric uptake regulator family protein  42.31 
 
 
140 aa  102  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.978745  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0013  ferric uptake regulator family protein  42.28 
 
 
135 aa  101  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00124444  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1727  ferric uptake regulator, Fur family  46.34 
 
 
146 aa  101  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.745172  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1586  ferric-uptake regulator  38.35 
 
 
149 aa  101  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.501887  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1555  ferric uptake regulator family protein  38.35 
 
 
149 aa  101  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3653  ferric uptake regulator family protein  45.53 
 
 
149 aa  101  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.188238  normal  0.295199 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2790  ferric uptake regulator family protein  35.62 
 
 
151 aa  101  4e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000512773  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0616  ferric uptake regulator family protein  44.35 
 
 
142 aa  101  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.740565  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2737  ferric uptake regulator family protein  44.35 
 
 
142 aa  101  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.348547  normal  0.830954 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0166  ferric uptake regulator family protein  44.35 
 
 
142 aa  101  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0649  ferric uptake regulator family protein  44.35 
 
 
142 aa  101  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>