More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2567 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1646  carboxyl-terminal protease  93.25 
 
 		 458 aa  822    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000394964  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2567  carboxyl-terminal protease  100 
 
 		 456 aa  926    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000043041 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1500  carboxyl-terminal protease  59.51 
 
 		 444 aa  525  1e-147  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000070609  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0969  carboxy-terminal processing protease  60.05 
 
 		 450 aa  479  1e-134  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2713  peptidase S41A, C-terminal protease  57.97 
 
 		 457 aa  461  1e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  53.51 
 
 		 452 aa  456  1e-127  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  51.87 
 
 		 455 aa  434  1e-120  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  54.42 
 
 		 444 aa  430  1e-119  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  52.47 
 
 		 443 aa  426  1e-118  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1290  carboxyl-terminal protease  51.12 
 
 		 444 aa  427  1e-118  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000397536  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  53.65 
 
 		 443 aa  428  1e-118  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2993  carboxyl-terminal protease  50.89 
 
 		 444 aa  423  1e-117  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70163e-17 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1673  periplasmic protease  50.56 
 
 		 441 aa  392  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.248616  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  49.35 
 
 		 438 aa  395  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0122157 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0383  carboxyl-terminal protease  48.65 
 
 		 476 aa  382  1e-105  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000063116  normal  0.361886 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  46.02 
 
 		 439 aa  365  1e-100  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1781  carboxyl-terminal protease  48.19 
 
 		 439 aa  361  1e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3509  carboxyl-terminal protease  47.92 
 
 		 461 aa  361  2e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2392  peptidase S41A, protease  44.61 
 
 		 468 aa  360  4e-98  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.605927 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04640  carboxyl-terminal protease S41A  49.28 
 
 		 439 aa  359  4e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.900151  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0331  peptidase S41A, protease  48.94 
 
 		 439 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67810  putative carboxyl-terminal protease  50 
 
 		 436 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.859493  normal  0.405059 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5869  putative carboxyl-terminal protease  50 
 
 		 436 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5058  carboxyl-terminal protease  48.67 
 
 		 438 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4931  carboxyl-terminal protease  48.67 
 
 		 438 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0561  hypothetical protein  45.08 
 
 		 445 aa  355  7.999999999999999e-97  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0537  hypothetical protein  45.08 
 
 		 445 aa  355  7.999999999999999e-97  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0407  carboxyl-terminal protease  48.43 
 
 		 437 aa  355  1e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5109  carboxyl-terminal protease  48.67 
 
 		 438 aa  354  1e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5329  carboxyl-terminal protease family protein  48.08 
 
 		 445 aa  353  5e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  47.55 
 
 		 441 aa  352  8.999999999999999e-96  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1119  carboxyl-terminal protease  46.73 
 
 		 481 aa  352  8.999999999999999e-96  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  47.02 
 
 		 440 aa  350  2e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2453  carboxyl-terminal protease  46.32 
 
 		 455 aa  349  5e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493491  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  47.26 
 
 		 468 aa  349  5e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  46.56 
 
 		 446 aa  349  7e-95  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0608  peptidase S41A, C-terminal protease  43.63 
 
 		 480 aa  348  1e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  46.86 
 
 		 426 aa  348  1e-94  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  47.57 
 
 		 445 aa  346  6e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4248  carboxyl-terminal protease  47.27 
 
 		 438 aa  341  1e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499045 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0896  carboxyl-terminal protease  45.43 
 
 		 443 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000020194  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1546  carboxyl-terminal protease  44.5 
 
 		 483 aa  333  3e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0199003  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  43.08 
 
 		 432 aa  330  3e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0923  carboxyl-terminal protease  45.17 
 
 		 428 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.315177  normal  0.478971 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0449  carboxy-terminal processing protease precursor  43.08 
 
 		 456 aa  328  1.0000000000000001e-88  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2159  carboxyl-terminal protease  43.58 
 
 		 422 aa  328  2.0000000000000001e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.272376 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0492  C-terminal processing peptidase  41.93 
 
 		 462 aa  327  4.0000000000000003e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1722  C-terminal processing peptidase  43.08 
 
 		 456 aa  326  5e-88  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1437  carboxyl-terminal protease  44.71 
 
 		 429 aa  325  1e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00028594  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1770  carboxyl-terminal protease  46.6 
 
 		 424 aa  325  1e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1837  carboxyl-terminal protease  46.75 
 
 		 424 aa  324  2e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1472  carboxyl-terminal protease  44.25 
 
 		 444 aa  323  3e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.732729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0164  carboxyl-terminal protease  43.85 
 
 		 458 aa  323  3e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3158  carboxyl-terminal protease  44.12 
 
 		 433 aa  323  4e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0549247 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1062  carboxyl-terminal protease  47.63 
 
 		 442 aa  322  9.999999999999999e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.937129  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3451  carboxyl-terminal protease  45.85 
 
 		 444 aa  321  1.9999999999999998e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.000000117328  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2508  carboxyl-terminal protease  42.13 
 
 		 471 aa  320  3e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0524  carboxy-terminal peptidase  47.49 
 
 		 482 aa  320  3.9999999999999996e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.707834  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0682  carboxyl-terminal protease  47.49 
 
 		 482 aa  320  3.9999999999999996e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713841 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0304  carboxyl-terminal protease  48.34 
 
 		 498 aa  320  3.9999999999999996e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000604667 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03547  carboxyl-terminal protease  48.75 
 
 		 507 aa  320  3.9999999999999996e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0324  C-terminal processing peptidase  43.88 
 
 		 434 aa  317  2e-85  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0091  carboxyl-terminal protease  42.36 
 
 		 445 aa  317  4e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0132582  normal  0.640744 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0566  carboxyl-terminal protease  42.51 
 
 		 456 aa  316  5e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4733  carboxyl-terminal protease  45.04 
 
 		 440 aa  316  5e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0128345  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0643  carboxyl-terminal protease  45.15 
 
 		 447 aa  316  6e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0139485 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0258  carboxyl-terminal protease  42.51 
 
 		 457 aa  315  7e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  44.19 
 
 		 440 aa  315  9e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0713  carboxyl-terminal protease  49.85 
 
 		 459 aa  315  9e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.290846  normal  0.150395 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  43.29 
 
 		 428 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0381  carboxyl-terminal protease  41.25 
 
 		 441 aa  314  1.9999999999999998e-84  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2931  carboxyl-terminal protease  47.61 
 
 		 445 aa  314  1.9999999999999998e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4487  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  45.04 
 
 		 444 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3016  carboxyl-terminal protease  44.5 
 
 		 440 aa  313  4.999999999999999e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0932  S41 family peptidase  41.43 
 
 		 448 aa  313  5.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0235658  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0492  peptidase S41A, C-terminal protease  41.22 
 
 		 439 aa  312  5.999999999999999e-84  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2591  carboxyl-terminal protease  41.43 
 
 		 448 aa  312  6.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.837496  normal  0.635906 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0098  carboxyl-terminal protease  43.59 
 
 		 446 aa  312  6.999999999999999e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0414  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  49.54 
 
 		 423 aa  312  6.999999999999999e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4223  carboxyl-terminal protease  44.07 
 
 		 440 aa  311  1e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.502517  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1210  carboxyl-terminal protease  51.52 
 
 		 415 aa  311  2e-83  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2562  carboxyl-terminal protease  43.72 
 
 		 440 aa  311  2e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0132517 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0449  peptidase S41A  41.93 
 
 		 451 aa  311  2e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.143572  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0703  carboxyl-terminal protease  42.65 
 
 		 437 aa  310  2e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2287  carboxyl-terminal protease  43.72 
 
 		 440 aa  311  2e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.939403  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0799  carboxyl-terminal protease  41.87 
 
 		 410 aa  310  2.9999999999999997e-83  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2072  carboxyl-terminal protease  42.62 
 
 		 453 aa  310  2.9999999999999997e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.422873  normal  0.323536 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0525  carboxyl-terminal protease  42.26 
 
 		 451 aa  309  5.9999999999999995e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.29494  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2755  carboxyl-terminal protease  42.46 
 
 		 445 aa  309  8e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0444358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2244  carboxyl-terminal protease  43.24 
 
 		 440 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0625684  normal  0.355809 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0704  carboxyl-terminal protease  42.93 
 
 		 437 aa  308  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0166  carboxyl-terminal protease  42.4 
 
 		 452 aa  306  3e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.97074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4300  carboxy-terminal protease  43.36 
 
 		 444 aa  306  5.0000000000000004e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0300488  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0533  carboxyl-terminal protease  45.41 
 
 		 522 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3885  carboxyl-terminal protease  43.84 
 
 		 440 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.26921  normal  0.039138 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4209  carboxyl-terminal protease  43.6 
 
 		 440 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.194144 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1812  carboxyl-terminal protease  41.82 
 
 		 478 aa  305  1.0000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3021  carboxyl-terminal protease  41.53 
 
 		 472 aa  305  1.0000000000000001e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.846777  normal  0.0258031 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4182  peptidase S41A  45.41 
 
 		 526 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0035  carboxyl-terminal protease  45.62 
 
 		 478 aa  304  2.0000000000000002e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.118794  normal  0.879403 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>