115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2486 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_2486  flagellin domain protein  100 
 
 
272 aa  528  1e-149  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1762  flagellin domain protein  95.96 
 
 
272 aa  509  1e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0087  flagellin domain protein  86.03 
 
 
272 aa  457  1e-127  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.01522e-16 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3830  flagellin domain protein  84.19 
 
 
272 aa  448  1e-125  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0123845 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0106  flagellin domain protein  85.66 
 
 
272 aa  450  1e-125  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.298157  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3746  flagellin domain protein  83.09 
 
 
272 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3371  flagellin domain protein  56.16 
 
 
275 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0467531  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3332  flagellin domain-containing protein  56.19 
 
 
300 aa  280  2e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3370  flagellin domain protein  55.8 
 
 
275 aa  278  9e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0519137  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2858  flagellin-like  39.04 
 
 
289 aa  175  7e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00447179  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2551  putative flagellin protein, C-terminus  42.04 
 
 
375 aa  146  3e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.345131  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2552  hypothetical protein  40.29 
 
 
393 aa  135  8e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4085  flagellin domain protein  39.3 
 
 
547 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0543  flagellin hook IN repeat-containing protein  48.19 
 
 
693 aa  126  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.686559 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0686  flagellin hook IN repeat-containing protein  46.99 
 
 
692 aa  124  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.153449  normal  0.210468 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6936  hypothetical protein  44.58 
 
 
620 aa  123  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1246  hypothetical protein  44.69 
 
 
399 aa  122  6e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.905349 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1408  hypothetical protein  44.69 
 
 
399 aa  122  8e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.596783  normal  0.114857 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7243  hypothetical protein  42.35 
 
 
578 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5088  hypothetical protein  44.24 
 
 
630 aa  120  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.937332 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3020  hypothetical protein  40.41 
 
 
405 aa  119  6e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.762369  normal  0.12294 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1247  hypothetical protein  44.69 
 
 
399 aa  118  9e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.933518 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5530  putative flagellin protein, C-terminus  42.17 
 
 
516 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.567075 
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5762  conserved hypothetical protein; putative flagellin C-ter domain  36.79 
 
 
420 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0522  hypothetical protein  42.17 
 
 
522 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0559459  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1337  hypothetical protein  43.71 
 
 
537 aa  116  5e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3880  flagellin hook IN repeat protein  43.64 
 
 
1562 aa  115  6e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.411065 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2370  flagellin  43.71 
 
 
737 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5528  putative flagellin protein, C-terminus  42.17 
 
 
514 aa  115  7.999999999999999e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.757214 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5527  putative flagellin protein, C-terminus  41.86 
 
 
523 aa  115  8.999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3800  flagellin  42.86 
 
 
886 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.139024  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2012  hypothetical protein  40 
 
 
572 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.999486 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6415  hypothetical protein  38.34 
 
 
405 aa  113  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1490  flagellin  42.69 
 
 
753 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.170223 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2500  hypothetical protein  38.34 
 
 
405 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1670  flagellin  42.51 
 
 
762 aa  112  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.940906  normal  0.0365182 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2995  hypothetical protein  37.82 
 
 
405 aa  112  6e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1105  hypothetical protein  40.72 
 
 
536 aa  112  7.000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0838477  normal  0.21931 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1193  hypothetical protein  42.13 
 
 
397 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.267898  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4438  flagellin  42.11 
 
 
886 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0238  conserved hypothetical protein; putative flagellin C-ter domain  42.25 
 
 
432 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2501  hypothetical protein  37.82 
 
 
405 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.98582  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1104  hypothetical protein  42.51 
 
 
523 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.926496  normal  0.217444 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3814  flagellin  43.11 
 
 
888 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1489  flagellin  44.51 
 
 
746 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.671791 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1194  conserved hypothetical protein; putative flagellin C-ter domain  43.96 
 
 
400 aa  110  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.206866  normal  0.376717 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1336  hypothetical protein  40.96 
 
 
528 aa  108  8.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4452  flagellin  40.72 
 
 
888 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.438814  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2540  flagellin  40.12 
 
 
892 aa  105  5e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1488  flagellin  42.51 
 
 
735 aa  102  8e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.723636  normal  0.726949 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3292  hypothetical protein  30.91 
 
 
260 aa  99.4  6e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2886  flagellin domain-containing protein  28.57 
 
 
273 aa  81.3  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.919361  normal  0.0484882 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3646  flagellin domain-containing protein  29.97 
 
 
273 aa  80.5  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.619307  normal  0.181793 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2887  flagellin domain-containing protein  30.32 
 
 
272 aa  79  0.00000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0771595  normal  0.0510481 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1038  flagellin-like  24.56 
 
 
282 aa  71.6  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.10381 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0069  flagellin domain-containing protein  28.88 
 
 
273 aa  71.2  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3254  flagellin domain-containing protein  25.69 
 
 
277 aa  69.3  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.875793  normal  0.855196 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1039  flagellin-like  24.29 
 
 
281 aa  68.2  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0579144 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1962  flagellin domain-containing protein  25.64 
 
 
275 aa  67.4  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.272266  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2884  flagellin domain-containing protein  26.47 
 
 
279 aa  62.4  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.134875  normal  0.076703 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1961  flagellin domain-containing protein  26.2 
 
 
274 aa  62.4  0.000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.494071  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1257  flagellin domain-containing protein  24.91 
 
 
274 aa  61.6  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.795763  hitchhiker  0.000282514 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3878  flagellin  27.92 
 
 
281 aa  60.8  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.466019  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4162  flagellin domain-containing protein  27.92 
 
 
281 aa  60.8  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00770352  normal  0.325059 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0362  flagellin domain protein  24.91 
 
 
303 aa  58.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00825341  normal  0.202796 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0268  flagellin domain-containing protein  23.49 
 
 
321 aa  58.5  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0752  flaB  24.03 
 
 
320 aa  57.8  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3134  flagellin-like  24.52 
 
 
281 aa  57  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0288  flagellin-like  25.36 
 
 
289 aa  57.4  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6612  flagellin domain protein  26.41 
 
 
302 aa  57.4  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0826615 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0328  flagellin domain protein  23.78 
 
 
301 aa  56.2  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.281136 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0330  flagellin domain protein  24.47 
 
 
303 aa  55.8  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.281136 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1040  flagellin-like  25.68 
 
 
292 aa  54.7  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0599642 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5667  flagellin domain protein  24.73 
 
 
302 aa  53.9  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2974  flagellin-like  23.79 
 
 
282 aa  52.4  0.000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.255462 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2690  flagellin domain-containing protein  24.32 
 
 
328 aa  52.8  0.000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.768338  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0329  flagellin domain protein  22.38 
 
 
302 aa  52.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.27249 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1138  flagellin  23.08 
 
 
321 aa  52  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0361  flagellin domain protein  22.73 
 
 
302 aa  52  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0478487  normal  0.0540762 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1375  flagellin  26.02 
 
 
271 aa  51.6  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000344656  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0751  flagella associated protein  25.88 
 
 
320 aa  52  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0360  flagellin domain protein  22.38 
 
 
301 aa  51.2  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00664833  normal  0.0333388 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0748  flagella associated protein  21.5 
 
 
320 aa  51.2  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0750  flagella associated protein  21.5 
 
 
320 aa  51.2  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0749  flagella associated protein  21.17 
 
 
320 aa  50.4  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3439  flagellin domain protein  25.81 
 
 
327 aa  50.1  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0034  flagellin domain protein  26.01 
 
 
292 aa  50.1  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4247  flagellin domain protein  23.39 
 
 
311 aa  49.7  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.157058 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0287  flagellin-like  24.57 
 
 
293 aa  49.3  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.356859  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1582  flagellin  22.58 
 
 
287 aa  49.3  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000267264  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1706  flagellin  22.58 
 
 
287 aa  49.3  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0636682  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0070  flagellin domain-containing protein  23.79 
 
 
271 aa  47.8  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0971133 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0266  flagellin domain-containing protein  37.5 
 
 
395 aa  47.4  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0267  flagellin domain-containing protein  33.73 
 
 
395 aa  47  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1581  flagellin domain protein  24.81 
 
 
275 aa  46.6  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0078  flagellin domain protein  23.4 
 
 
263 aa  46.2  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0442  flagellin-like  25.29 
 
 
314 aa  46.2  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2561  flagellin domain protein  26.04 
 
 
285 aa  45.8  0.0008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0265  flagellin domain-containing protein  30.12 
 
 
395 aa  45.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1834  flagellin  23.66 
 
 
266 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000481567  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>